胆红素,血清水平,定量性状基因座 1

血清胆红素水平作为数量性状与染色体 2q37 上的 UGT1A1 基因( 191740 ) 的变异有关,因此在该条目中使用了数字符号(#)。

▼ 测绘

施韦特纳等人(1994)报道了低血清胆红素浓度与冠状动脉疾病(CAD) 风险增加之间的关联。霍普金斯等人(1996)表明,较高的总血清胆红素值对 CAD 的保护作用与 HDL 胆固醇相当。Hunt 等人对犹他州 24 个家系的 1,240 名成年人进行了一项研究(1996 年)通过对从 2 次门诊就诊中获得的血清胆红素水平进行双变量最大似然分离分析建模来确定是否有一个主要基因的统计证据可以解释所报道的血清胆红素水平与冠心病(CHD) 之间的反比关系。他们的数据表明,在 11.5% 的分析人群中,主要基因导致胆红素水平升高。

由于血清胆红素浓度与冠状动脉疾病风险之间存在反比关系,Lin 等人(2003)在弗雷明汉心脏研究中进行了全基因组扫描。他们的研究样本包括 330 个,其中 1,394 个同胞对、681 个表亲对和 89 个父对。使用方差分量方法,遗传力估计为 49% +/- 6%,基因组扫描显示血清胆红素与染色体 2q 相关的重要证据,在 243 cM 位置的 lod 评分为 3.8。峰值多点 lod 分数位于距 UGT1A1 基因 1 cM 处。林等人(2003)得出结论,他们的研究结果表明 UGT1A1 可能是控制人群中血清胆红素水平的主要基因。

约翰逊等人(2009 年)结合 3 项全基因组关联研究(弗雷明汉心脏研究、鹿特丹研究和 AGES-雷克雅未克)的结果来评估影响 9,464 人血清胆红素水平的遗传因素。荟萃分析显示,UGT1A1 基因座的遗传影响强烈复制内含子 1 中的 GT 颠换(rs6742078,191740.0025 ;组合p 值小于 5.0 x 10(-324))。在具有 UGT1A128( 191740.0011 ) 和rs6742078基因型的 490 个个体的子集中,他们发现标记处于高度连锁不平衡状态,这表明信号可能归因于 UGT1A128 多态性。约翰逊等人(2009)表示rs6742078在 UGT1A1 基因中,解释了大约 18% 的总血清胆红素水平的变化。

在一项基于人群的研究中,检测了来自中国新疆的 3 个亚洲群体的血清总胆红素,包括 502 名哈萨克牧民、769 名维吾尔族农民和 789 名汉族农民,Lin 等人(2009)发现与 UGT1A1 基因中的 2 个多态性显着相关:TA(n) 重复多态性( 191740.0011 ) 和rs4148323( 191740.0016 )(p = 2.05 x 10(-26) 和 p = 5.21 x 10(-16)分别)。rs4148323的TA(7)等位基因和A等位基因与总胆红素水平升高孤立相关。结合起来,这些 SNP 可以解释这些群体中 3.9% 到 9.8% 的差异。然而,人群之间的总胆红素水平存在差异,这表明必须涉及其他因素。

遗传异质性

Johnson 等人 对来自 3 项全基因组关联研究的 9,464 名个体进行了荟萃分析(2009)确定了染色体 12p12.2 上SLCO1B1 基因( 604843 ) 的外显子 6 中的非同义 SNP( rs4149056;组合 p = 6.7 x 10(-13)) 的显着关联。TC 转换导致 val174 到 ala(V174A) 替换。在rs6742078 UGT1A1 SNP 的条件分析下,SLCO1B1 rs4149056显示出相似的全基因组显着性。约翰逊等人(2009)指出SLCO1B1 基因中的rs4149056解释了大约 1% 的总血清胆红素水平的变化。

桑娜等人(2009 年)报告了对 4,300 名撒丁岛人进行的全基因组关联扫描,以了解总血清胆红素水平。作者报告了染色体 12p12.2(p = 3.9 x 10(-9)) 上SLCO1B3 基因( 605495 ) 内含子 7 中rs17680137的强关联。研究结果在 1,860 名撒丁岛人的孤立样本和宾夕法尼亚州兰开斯特的旧秩序阿米什社区的 832 名受试者中得到了复制(组合 p 小于 5.0 x 10(-14))。桑娜等人(2009)指出 SLCO1B3 SNP rs17680137也导致特发性轻度非结合高胆红素血症。

林等人(2009)进行了一项基于人群的研究,检查了可能影响 3 个亚洲群体的血清胆红素的多态性,包括 502 名哈萨克牧民、769 名维吾尔农民和 789 名汉族农民。BLVRA( 109750 )、SLCO1B1 或 HMOX1( 141250 ) 基因的多态性在所有 3 个人群中均未发现显着关联,尽管有一些迹象表明仅与维吾尔人群中的 HMOX1 基因相关。