长基因间非编码 RNA 1194

LINC01194 产生几种在睾丸和胰腺以及肿瘤细胞系中表达的剪接变体(Hogan 等人,2004)。

▼ 克隆与表达

通过筛选黑色素瘤细胞系中与 HLA-A3 结合的肽(参见142800),然后进行高效液相色谱、数据库分析以及 5-prime 和 3-prime RACE,Hogan 等人(2004)获得了 LINC01194 的 5 个剪接变体,他们称之为 TAG。变体中没有重要的 ORF 从 AUG 密码子开始。然而,作者确定了 3 个非标准起始密码子彼此框内,它们可能产生少于 100 个氨基酸的 TAG 同种型。RT-PCR 分析检测到黑色素瘤、白血病和其他肿瘤细胞系中的 TAG 表达,但在 B 或 T 淋巴细胞中未检测到。在正常人体组织中,仅在睾丸和胎盘中检测到 TAG 表达。

▼ 基因结构

霍根等人(2004)确定 LINC01194 基因包含 7 个外显子,跨度为 230 kb。

▼ 测绘

通过基因组序列分析,Hogan 等人(2004)将 LINC01194 基因对应到染色体 5p。

Gross(2016)根据 LINC01194 序列(GenBank AY328030 ) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 LINC01194 基因对应到染色体 5p15.2。