聚合酶、DNA、Lambda; POLL

HGNC 批准的基因符号:POLL

细胞遗传学位置:10q24.32 基因组坐标(GRCh38):10:101,578,881-101,588,318(来自 NCBI)

▼ 说明

POLL 在缺口 DNA 底物上具有 5-prime-deoxyribose-5-磷酸裂解酶活性和链置换合成活性,表明 POLL 参与短补丁和长补丁碱基切除修复。 POLL 广泛表达,在睾丸和卵巢的粗线期精母细胞中大量表达(Kobayashi 等人的总结,2002)。

▼ 克隆与表达

Aoufouchi 等人通过搜索序列数据库来识别 polX 家族的新成员(2000) 鉴定了代表 2 种 DNA 聚合酶 POLM(606344) 和 POLL 的 EST 克隆,他们分别将其称为 pol mu 和 pol lambda。 通过筛选骨髓和淋巴结 cDNA 文库,他们分离出了全长 POLL cDNA。 POLL 编码推导的 575 个氨基酸的蛋白质,预计包含 polX 结构域、BRCA1(113705) C 末端(BRCT) 结构域和 2 个螺旋-发夹-螺旋(HHH) DNA 结合基序。 POLL 在结构上类似于末端脱氧核苷酸转移酶(TDT; 187410)。 它与 DNA 聚合酶 β(POLB;174760) 具有 34% 的氨基酸同一性,与小鼠 Poll 具有 82% 的氨基酸同一性。 Northern 印迹分析检测到 2.7 kb POLL 转录物,在睾丸和胎儿肝脏中表达最高,而在许多其他组织中表达非常弱。 他们发现了 POLL 剪接变体,他们认为这些变体是无功能的。 奥福奇等人(2000) 提供了酵母和人类 polX 家族蛋白的系统发育比较。

▼ 基因功能

奥福奇等人(2000) 发现 POLL 在体外具有模板依赖性 DNA 聚合酶活性。 Aoufouchi 等人使用半定量 RT-PCR 扩增(2000) 得出结论,当细胞暴露于 DNA 损伤剂时,POLL mRNA 表达以剂量和时间依赖性方式下调。

▼ 基因结构

奥福奇等人(2000) 确定 POLL 由 8 个外显子编码,跨越约 9 kb 的基因组 DNA。

▼ 测绘

扎里瓦拉等人(2004) 报道人类 POLL 基因定位于 10 号染色体,与相反链上的 DPCD 基因(616467) 部分重叠。 小鼠 Poll 基因位于 19 号染色体的同线性区域。

Gross(2015) 根据 POLL 序列(GenBank AF161019) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 POLL 基因对应到染色体 10q24.32。

▼ 动物模型

小林等人(2002) 培育出 Poll -/- 小鼠,其表现出脑积水、出生后高死亡率、全反位、慢性鼻窦炎以及由于精子不活动而导致的男性不育。

扎里瓦拉等人(2004) 检查了 Kobayashi 等人使用的遗传构建体(2002) 生成 Poll -/- 小鼠。 他们指出,在 Bertocci 等人的另一项研究中,仅删除了 Poll 的催化结构域(2002) 产生了具有正常表型的小鼠。 扎里瓦拉等人(2004) 确定删除了 Kobayashi 等人的民意调查(2002) 还删除了相反链上 Dpcd 的外显子 1。 培养的 HBE 细胞的 Northern 印迹分析表明,纤毛细胞分化过程中 DPCD 表达增加,而 POLL 表达减少。 扎里瓦拉等人(2004) 得出结论,在 Kobayashi 等人报道的 Poll -/- 小鼠中观察到的表型(2002) 可能是由于 Dpcd 丢失而不是 Poll 造成的。