跨膜蛋白 240; TMEM240

  • 1 号染色体开放解读码组 70;C1ORF70

HGNC 批准的基因符号:TMEM240

细胞遗传学定位:1p36.33 基因组坐标(GRCh38):1:1,534,777-1,540,623(来自 NCBI)

▼ 描述

TMEM240 是一种在大脑中表达的小型、高度保守的跨膜蛋白(Delplanque et al., 2014)。

▼ 克隆和表达

通过质谱和数据库分析,Trinidad 等人(2012) 鉴定出小鼠 Tmem240(他们将其称为 EG381582)是在成人大脑突触膜中表达的磷蛋白。

德尔普兰克等人(2014) 报道推导的 173 个氨基酸的人 TMEM240 蛋白具有短的 N 末端尾部,随后是 2 个跨膜结构域和一个长的 C 末端结构域。它在跨膜结构域之间的环中具有 2 个推定的磷酸化位点,在 C 端结构域中具有 1 个推定的磷酸化位点。数据库分析揭示了几种脊椎动物的直系同源物。

▼ 基因结构

Delplanque 等人(2014) 确定 TMEM240 基因有 4 个编码外显子,跨度为 5.6 kb。

▼ 测绘

Delplanque 等人(2014) 指出 TMEM240 基因对应到染色体 1p36.33。

▼ 分子遗传学

Delplanque 等人在 8 个不相关的法国家族中患有脊髓小脑性共济失调 21(SCA21; 607454) 的受影响成员中(2014) 鉴定了 TMEM240 基因中的 6 个不同的杂合突变(参见,例如 616101.0001-616101.0005)。有5个错义突变和1个截短突变。通过连锁分析结合全外显子组测序发现了第一家族的突变。通过对 368 个患有常染色体显性 SCA 的法国家系的 TMEM240 基因进行直接测序,发现了另外 7 个家族的突变。所有突变都影响高度保守的残基,但尚未进行变体的功能研究。

▼ 等位基因变异体(5 个选定示例):.

0001 脊髓小脑性共济失调 21
TMEM240、PRO170LEU
在一个患有脊髓小脑性共济失调 21(SCA21; 607454) 的法国大家族的受影响成员中,最初由 Devos 等人报道(2001),Delplanque 等人(2014) 在 TMEM240 基因的外显子 4 中发现了一个杂合的 c.509C-T 转换,导致 C 末端高度保守的残基发生 pro170 到 leu(P170L) 的取代。该突变是通过全外显子组测序发现并经桑格测序证实的,它与家族中的疾病分离,并且在 dbSNP、1000 基因组计划或外显子组变异服务器数据库或 934 个法国对照中不存在。随后在 368 个患有类似疾病的法国家庭中的 2 个受影响成员中发现了相同的突变,但单倍型分析并未表明这些家庭之间存在创始人效应。没有对该变体进行功能研究。

.0002 脊髓小脑共济失调 21
TMEM240, TYR163TER
在患有 SCA21(607454) 的法国家庭的受影响成员中,Delplanque 等人(2014) 鉴定了 TMEM240 基因外显子 4 中的杂合 c.489C-G 颠换,导致 C 末端附近出现 tyr163-to-ter(Y163X) 取代。该突变不存在于 dbSNP、1000 基因组计划或外显子组变异服务器数据库或 396 个法国对照中。没有对该变体进行功能研究(Delplanque 等人(2014) 的文章中,该等位基因变体的核苷酸变化存在差异:摘要中表述为 c.489C-G,但正文中表述为 c.489C-T。Sablonniere(2014) 证实 c.489C-G 是正确的。)

.0003 脊髓小脑性共济失调 21
TMEM240,ARG116CYS
在一名患有 SCA21 的法国男性(607454) 中,Delplanque 等人(2014) 在 TMEM240 基因的外显子 3 中发现了一个杂合的 c.346C-T 转变,导致高度保守的残基处的 arg116 到 cys(R116C) 取代。在 5 个未受影响的家庭成员中未发现该突变,在 dbSNP、1000 基因组计划或外显子组变异服务器数据库或 396 个法国对照中也不存在该突变。没有对该变体进行功能研究。

.0004 脊髓小脑性共济失调 21
TMEM240, THR80MET
在一名患有 SCA21(607454) 的法国男子中,Delplanque 等人(2014) 在 TMEM240 基因的外显子 3 中发现了一个杂合的 c.239C-T 转换,导致 2 个跨膜 α 螺旋之间高度保守的残基发生 thr80 到met(T80M) 取代。在 2 个未受影响的家庭成员中未发现该突变,在 dbSNP、1000 基因组计划或外显子组变异服务器数据库或 396 个法国对照中也不存在该突变。没有对该变体进行功能研究。与具有其他TMEM240突变的SCA21患者不同,具有T80M突变的患者没有认知障碍。

.0005 脊髓小脑共济失调 21
TMEM240, ARG171TRP
在一名患有 SCA21 的法国女性(607454) 中,Delplanque 等人(2014) 鉴定了 TMEM240 基因外显子 4 中的杂合 c.511C-T 转换,导致 C 末端高度保守的残基处 arg171 至 trp(R171W) 取代。在 dbSNP、1000 基因组计划或外显子组变异服务器数据库或 396 个法国对照中,未发现该突变,未在未受影响的家庭成员中发现。没有对该变体进行功能研究。该患者六十多岁时出现迟发性步态共济失调。