肿瘤坏死因子受体相关蛋白 1; TRAP1

  • TNFR 相关蛋白 1 热休克蛋白,75-KD; 热休克蛋白75
  • HSP90 样蛋白; 热休克蛋白90L

HGNC 批准的基因符号:TRAP1

细胞遗传学定位:16p13.3 基因组坐标(GRCh38):16:3,658,036-3,717,523(来自 NCBI)

▼ 说明

HSP90 蛋白是高度保守的分子伴侣,在信号转导、蛋白质折叠、蛋白质降解和形态进化中发挥关键作用。 HSP90 蛋白通常与其他共伴侣蛋白结合,并在应激后折叠新合成的蛋白或稳定和重折叠变性蛋白方面发挥重要作用。 TRAP1 是一种线粒体 HSP90 蛋白。 其他 HSP90 蛋白存在于细胞质(参见 HSP90AA1;140571)和内质网(HSP90B1;191175)中(Chen 等,2005)。

▼ 克隆与表达

Song 等人使用 Gal4/HeLa cDNA 文库的酵母 2 杂交筛选,以 TNFR1(191190) 的胞内结构域为诱饵,然后使用 5-prime RACE(1995)分离出编码TRAP1的部分cDNA。 推导的 661 个氨基酸蛋白与 HSP90 家族成员有 60% 相似,尽管它缺乏 HSP90 蛋白中的高电荷结构域。 Northern 印迹分析揭示了 2.7 kb TRAP1 转录物的可变但普遍的表达。

Chen 等人通过使用 N 端截短的视网膜母细胞瘤蛋白(RB1; 614041) 作为诱饵,对几个 cDNA 文库进行酵母 2 杂交筛选(1996)获得了几乎完整的编码TRAP1的cDNA,他们将其命名为HSP75。 HSP75 有 698 个氨基酸。 免疫沉淀、免疫印迹分析和免疫荧光显微镜证明了 75 kD 细胞质蛋白的表达,该蛋白在有丝分裂期间与 RB1 共定位,但在其他阶段不表达。 热休克期间,HSP75 迁移至细胞核。

在以外骨蛋白-2(EXT2; 608210) 作为诱饵的酵母 2-杂交筛选中,Simmons 等人(1999)分离出TRAP1。 他们报告说,全长 cDNA 序列编码一个 704 个氨基酸的蛋白质(GenBank AF154108)。

Felts 等人使用免疫荧光显微镜(2000) 证明了 TRAP1 的线粒体定位。 TRAP1 具有线粒体定位序列 STQTAED,从第 59 位切割后开始。序列分析预测 TRAP1 与果蝇同源物有 54% 的同一性。

通过数据库分析,陈等人(2005) 鉴定了几个 TRAP1 变体。 与其他 HSP90 蛋白一样,704 个氨基酸的 TRAP1 蛋白具有高度保守的 N 端结构域、参与 ATP 酶活性的中间结构域、带电结构域和 C 端结构域,但它缺乏其他 HSP90 蛋白中紧邻 N 端结构域的带电结构域。 它还具有信号肽和富含gln 的区域。

▼ 基因功能

Song 等人使用酵母 2-hybrid 和 GST Pull-down 分析(1995) 发现 TRAP1 与 TNFR1 的 N 端部分相互作用。

Chen 等人的结合分析(1996) 表明 HSP75 使用 LxCxE 基序与 RB1 的 T 抗原结合结构域结合。 Western blot分析表明HSP75可以重折叠变性的RB1,表明HSP75充当RB1的伴侣。

Simmons 等人的结合分析(1999) 表明 TRAP1 与多个外生骨疣致病基因 EXT1(608177) 和 EXT2 编码的蛋白质的 C 末端相互作用,但不与 EXTL1(601738) 或 EXTL3(605744) 相互作用。 这种相互作用需要 EXT 蛋白中存在 his 残基,Raskind 等人在 I 型多发性外生骨疣(133700) 的单个家族中发现了 his 残基的缺失(1998)。

费尔茨等人(2000) 报道 TRAP1 缺乏 HSP90 的伴侣活性,也无法与 HSP90 的共伴侣相互作用。 然而,TRAP1 确实结合了 ATP,并表达了可被 HSP90 抑制剂格尔德霉素阻断的 ATP 酶活性。

▼ 基因结构

陈等人(2005)确定TRAP1基因包含19个外显子。

▼ 测绘

西蒙斯等人(1999) 指出 TRAP1 基因定位于 16 号染色体。

通过基因组序列分析,Chen 等人(2005) 将 TRAP1 基因定位到染色体 16p13.3。

▼ 命名法

陈等人(2005) 为 HSP90 基因家族提供了修订的命名系统。 在该系统下,根HSP90A表示胞质HSP90,HSP90B表示内质网HSP90,TRAP表示线粒体HSP90。 HSP90A分为2类,HSP90AA代表传统的HSP90-α,HSP90AB代表HSP90-β。 根/类后面的指趾代表该类中的基因,末尾的“P”表示假定的假基因。 陈等人(2005) 还提出了 TRAP1 的别名 HSP90L。