WD 重复含有蛋白 5; WDR5

  • BMP2 诱导基因,3-KB;BIG3

HGNC 批准的基因符号:WDR5

细胞遗传学位置:9q34.2 基因组坐标(GRCh38):9:134,135,198-134,159,967(来自 NCBI)

▼ 描述

WDR5 是含有 WD 重复序列的蛋白质家族的成员。有关该系列的背景信息,请参阅 606045。

▼ 克隆和表达

通过 BMP2(112261) 在小鼠前软骨细胞中诱导基因的差异展示,Gori 等人(2001) 克隆了小鼠 Wdr5,他们将其称为 Big3。推导的 328 个氨基酸蛋白质主要由 7 个 WD40 重复组成,呈 β 螺旋桨结构。对几种小鼠组织的 Northern 印迹分析检测到睾丸中表达最高。Wdr5 还在永生化小鼠骨髓基质细胞、成骨细胞、骨细胞和生长板软骨细胞以及原代颅盖成骨细胞中表达。对小鼠胚胎骨的免疫组织化学分析检测到颅骨成骨细胞中的 Wdr5。

▼ 基因功能

Gori 等人(2001) 发现 Wdr5 加速了小鼠成骨细胞的成骨细胞分化程序,通过碱性磷酸酶活性和响应甲状旁腺激素的环 AMP 产生来测量(PTH; 168450)。对 PTH 的反应与 PTH 结合有关。Wdr5 还增加了 Cbfa1(600211)、I 型胶原蛋白(参见 120150) 和骨钙素(112260) mRNA 的表达,并加速转染细胞中矿化结节的形成。

布朗等人(2005) 确定了 2 个 PER1(602260) 相关因子 NONO(300084) 和 WDR5,它们调节 PER 活性。RNA干扰(RNAi)导致NONO表达减少,从而减弱了哺乳动物细胞的昼夜节律,而携带亚等位基因的果蝇则几乎出现心律失常。WDR5 是组蛋白甲基转移酶复合物的一个亚基,可增强 PER 介导的转录抑制,而 RNAi 对其的抑制可减少时钟基因启动子处的昼夜节律组蛋白甲基化。

WDR5 是哺乳动物 SET1A(611052)/SET1B(611055) 组蛋白 H3-Lys4 甲基转移酶复合物的组成部分(Lee et al., 2007)。

通过质谱分析,Higa 等人(2006) 鉴定了超过 20 个与 CUL4(参见 603137)-DDB1(600045)-ROC1(RBX1;603814) 复合物相互作用的 WDR 蛋白,包括 WDR5。序列比对表明,大多数相互作用的 WDR 蛋白都有一个位于中心的 WDxR/K 子基序。敲低研究表明 WDR 蛋白起到底物特异性接头的作用。例如,L2DTL(DTL; 610617) 的失活(而非其他 WDR 蛋白)可阻止伽马射线照射后 CDT1(605525) 的 CUL4-DDB1 依赖性蛋白水解。WDR5 或 EED(605984) 的失活(而非其他 WDR 蛋白)改变了 CUL4-DDB1 依赖性组蛋白 H3(参见 602810)甲基化的模式。

朱等人(2008) 指出 Wdr5 增强了伴随小鼠成骨细胞分化的经典 Wnt(参见 WNT1, 164820)信号传导。他们发现,通过小干扰RNA减少内源性Wdr5表达,下调Wnt信号传导并抑制成骨细胞分化。染色质免疫沉淀证明 Wdr5 与 Wnt1 启动子以及 Myc(190080) 和 Runx2(600211) 启动子的 Wnt 反应元件相关。Wdr5 抑制似乎会在多个阶段干扰 Wnt 信号传导。朱等人(2008) 得出结论,诱导成骨细胞表型需要最佳的 Wdr5 水平。

Wang 等人使用质谱法(2008) 鉴定 WDR5 是 HeLa 细胞中含有 ADA2A(TADA2A; 602276)(ATAC) 组蛋白乙酰转移酶复合物的组成部分。

埃尔-布罗洛西等人(2019) 分析了斑马鱼和小鼠的几种转录适应模型,发现了突变 mRNA 降解的必要条件。无法转录突变基因的等位基因不会表现出转录适应,并且这些等位基因比显示突变 mRNA 衰减的等位基因产生更严重的表型。显示突变 mRNA 衰变的等位基因的转录组分析揭示了与突变基因 mRNA 表现出序列相似性的大部分基因的上调,表明存在序列依赖性机制。在靶向小干扰 RNA(siRNA) 筛选中,以鉴定参与转录适应、组蛋白赖氨酸脱甲基酶 KDM4(参见 609764)或 KDM6(参见 300128)敲低的表观遗传调节剂,分别去除抑制性组蛋白 H3 lys9 三甲基化(H3K9me3) 和 H3K27me3 标记,抑制转录适应反应。然而,在敲除 WDR5(COMPASS 复合体的成员)后观察到最强的效果,该复合体生成许可组蛋白标记 H3K4me3。埃尔-布罗洛西等人(2019) 得出的结论是,他们的数据提出了一个模型,在该模型中,伴随着突变 mRNA 的降解,衰变因子易位到细胞核,在那里它们与特定位点(可能由衰变中间体引导)结合,并招募组蛋白修饰剂和/或染色质重塑剂来上调转录。埃尔-布罗洛西等人(2019) 指出,普遍的假设是,在受影响的个体中,致病性错义突变往往比无义突变更常见,因为它们可能导致组成型活性或显性失活蛋白质。然而,El-Brolosy 等人(2019) 提出无义突变不太常见,因为它们可能导致 mRNA 衰变触发相关基因的上调,因此不会引起明显的症状。作者认为,对相关个体进行详细的转录组分析将有助于检验这一假设。

马等人(2019) 使用 capn3a(见 114240)和 nid1a(见 131390)基因的斑马鱼敲低和敲除模型表明,带有提前终止密码子(PTC)的 mRNA 会迅速触发涉及 Upf3a(605530)和 COMPASS 复合体成分的遗传补偿反应(GCR)。与具有较小肝脏的 capn3a 敲低胚胎和体长较短的 nid1a 敲低胚胎不同,capn3a-null 和 nid1a-null 突变体看起来正常。这些表型差异归因于同一家族中其他基因的上调。通过分析 6 个独特设计的转基因,Ma 等人(2019) 证明 GCR 取决于 PTC 的存在和转基因 mRNA 的核苷酸序列,该序列与补偿性内源基因同源。马等人(2019) 表明 upf3a 和 COMPASS 复合体的组件(包括 wdr5)在 GCR 中发挥作用,并证明 GCR 伴随着补偿基因转录起始位点区域 H3K4me3 的增强。马等人(2019) 的结论是,他们的发现为 GCR 提供了潜在的机制基础,并表明它们可能有助于开发治疗策略,通过在突变基因中创建 PTC 或引入含有 PTC 的转基因来触发 GCR,来治疗与遗传性疾病相关的错义突变。

在随附的评论中,Wilkinson(2019)将 El-Brolosy 等人观察到的上调反应称为“上调反应”(2019)和马等人(2019)“无义诱导的转录补偿”(NITC)。

▼ 测绘

国际辐射混合定位联盟将 WDR5 基因定位到 9 号染色体(RH98879)。