CWC22 剪接体相关蛋白同源物; CWC22

  • CWC22 剪接体相关蛋白,酿酒酵母
  • KIAA1604的同源物
  • NCM

HGNC 批准的基因符号:CWC22

细胞遗传学位置:2q31.3 基因组坐标(GRCh38):2:179,944,875-180,007,296(来自 NCBI)

▼ 描述

在剪接过程中,外显子连接复合物(EJC) 在 mRNA 外显子连接上游组装大约 24 个核苷酸。EJC 参与前 mRNA 剪接、mRNA 转移、翻译和无义介导的 mRNA 衰减。EJC 组装需要 CWC22(Barbosa 等人,2012)。

▼ 克隆和表达

Nagase 等人通过对从大小分级的胎儿脑 cDNA 文库中获得的克隆进行测序,(2000) 克隆了 CWC22,他们将其命名为 KIAA1604。推导的蛋白质含有937个氨基酸。RT-PCR ELISA 检测到所有成人和胎儿组织中 CWC22 的表达,其中成人脑、脾和卵巢中的表达量最高。CWC22 在所检查的所有特定成人大脑区域中表达,其中在胼胝体和杏仁核中表达最高,其次是丘脑和丘脑底核。

Barbosa 等人通过搜索数据库查找果蝇 nucampholin(ncm) 的人类直系同源物,该基因与 RNA 解旋酶 Eif4a3(DDX48; 608546) 相互作用(2012) 确定了 CWC22。推导的 908 个氨基酸的 CWC22 蛋白的中心区域包含一个保守的 MIF4G(EIF4G 的中间(参见 600495))结构域,后面是一个 MA3 结构域。CWC22 的直向同源物存在于脊椎动物、线虫和酵母中,其中 MIF4G 和 MA3 结构域的保守性最高。内源性和荧光标记的 WCW22 主要定位于细胞核并集中在核斑点中。

▼ 基因功能

通过免疫共沉淀分析,Barbosa 等人(2012) 表明内源性 CWC22 和 EIF4A3 在 HEK293 细胞中相互作用。EIF4A3(但不是 CWC22)与 EJC 的其他组件交互。CWC22 与 EIF4A3 的非活性开放构象和 EIF4A3 的活性封闭构象相互作用,其中 EIF4A3 具有 RNA 结合和 ATP 酶活性。然而,CWC22 与处于开放构象的 EIF4A3 的结合阻止了 EIF4A3 采用闭合构象并结合 RNA。RNA 干扰实验表明 CWC22 是 EJC 组装所必需的。巴博萨等人(2012) 得出结论,CWC22 充当将 EIF4A3 递送至 EJC 的伴侣。

Steckelberg 等人孤立地(2012) 发现 CWC22 与 EIF4A3 结合并且是 EJC 组装所必需的。他们表明,通过小干扰 RNA 敲低 CWC22 会损害 HeLa 细胞中的前 mRNA 剪接。突变分析和互补测定表明,CWC22 的中心区域包含 MIF4G 和 MA3 结构域,但单独的 MIF4G 结构域和 MA3 结构域都不支持前 mRNA 剪接。缺乏 EIF4A3 结合的 CWC22 突变体不支持重组 EJC 的体外剪接或组装。

亚历山德罗夫等人(2012) 发现 CWC22 除了在 mRNA 剪接中发挥作用外,还在无义介导的衰变中发挥作用。

通过人-啮齿动物杂交小组的 PCR 作图,Nagase 等人(2000) 将 CWC22 基因对应到 2 号染色体。

Hartz(2013) 根据 CWC22 序列(GenBank AB046824) 与基因组序列(GRCh37) 的比对,将 CWC22 基因对应到染色体 2q31.3。