微小RNA 29A; MIR29A

  • miRNA29A
  • MIRN29A

HGNC 批准的基因符号:MIR29A

细胞遗传学定位:7q32.3 基因组坐标(GRCh38):7:130,876,746-130,876,809(来自 NCBI)

▼ 克隆和表达

Hwang 等人(2007) 指出存在 3 种人类 microRNA-29 旁系同源物:miR29a、miR29b(610783) 和 miR29c(610784)。HeLa 细胞中表达 miR29b-1/miR29a 簇,但不表达 miR29b-2/miR29c 簇。miR29a 在所有细胞周期阶段均持续表达;除有丝分裂细胞外,miR29b 均以低水平表达;且 miR29c 未检测到。黄等人(2007) 指出,miR29a 与当时研究的所有其他动物 miRNA 一样,主要存在于细胞质中。

Xu 等人使用定量 RT-PCR(2009)发现miR29A、miR29B和miR29C在正常组织中高表达。然而,所有 3 种 miR29 亚型在多种实体瘤中均下调,包括神经母细胞瘤、肉瘤、脑肿瘤和肿瘤细胞系。

▼ 测绘

Hwang 等人的地图(2007) 指出 MIRN29B1/MIRN29A 基因簇对应到染色体 7q32.3。

▼ 基因功能

MIRN29A、MIRN29B 和 MIRN29C 在肺癌中表达下调。法布里等人(2007) 确定了 DNMT3A(602769) 和 DNMT3B(602900) 3 素 UTR 中 MIRN29 的互补位点,DNMT3A(602769) 和 DNMT3B(602900) 是参与 DNA 甲基化的关键酶,在预后不良的肺癌中经常上调。MIRN29s的表达与肺癌组织中DNMT3A和DNMT3B的水平呈负相关,并且MIRN29s直接靶向DNMT3A和DNMT3B。在肺癌细胞系中强制表达 MIRN29 可恢复 DNA 甲基化的正常模式,诱导甲基化沉默的肿瘤抑制基因的重新表达,并在体外和体内抑制致瘤性。

Chang 等人使用微阵列和 Northern blot 分析(2008) 表明,MIRN29A 是小鼠和人 B 细胞淋巴瘤细胞系中 MYC(190080) 下调的几种 miRNA 之一。MYC 结合 MIRN29A 上游区域。

BACE1(604252) 是一种 β 分泌酶,可将淀粉样前体蛋白(APP; 104760) 降解为淀粉样β 肽,从而在阿尔茨海默病(AD; 104300) 中表现出致病性积累。赫伯特等人(2008) 发现大约 30% 的散发性 AD 患者中 BACE1 蛋白的表达增加,而非 mRNA 的表达增加,并且随着 BACE1 蛋白水平的升高,miR29A/miR29B1 簇的表达显着降低。在发育中和成年小鼠大脑以及原代神经元培养物中也检测到 Bace1 蛋白和 miR29a/miR29b1 水平之间类似的负相关。人胚胎肾细胞的功能获得和丧失实验表明,miR29A和miR29B1在短暂过表达时下调内源性BACE1,并且BACE1活性产生的APP片段水平在miR29A和miR29B1表达后降低。赫伯特等人(2008) 提出,特定 miRNA 的丢失可能导致散发性 AD 中 BACE1 和淀粉样蛋白-β 水平升高。

Xu 等人使用蛋白质印迹、定量 RT-PCR 和 FACS 分析(2009)发现B7H3(CD276; 605715)转录物在人类正常组织和实体瘤中普遍表达,但B7H3蛋白仅在肿瘤组织和细胞系中优先表达。徐等人(2009) 在 B7H3 的 3-prime UTR 中鉴定了 miR29 靶位点。所有 3 个 miR29 亚型与 B7H3 3-prime UTR 具有相同的种子互补性,表明它们都以 B7H3 为目标。总体而言,B7H3 蛋白和 miR29 表达水平之间存在负相关。荧光素酶报告基因分析显示,miR29A 直接靶向 B7H3 的 3 素 UTR。miR29A 的敲除和敲低分别导致 B7H3 蛋白表达的下调和上调。徐等人。

加尔松等人(2009) 提供的证据支持 miR29A 和 miR29B 在急性髓系白血病(AML; 601626) 中具有肿瘤抑制作用。两种 microRNA 的过度表达都会降低 AML 细胞系的细胞生长并诱导细胞凋亡。在 AML 异种移植小鼠模型中注射 miR29B 导致肿瘤缩小。Northern印迹分析表明,2种microRNA靶向参与细胞凋亡、细胞周期和细胞增殖的基因。用 miR29A 和 miR29B 转染白血病细胞导致 CXXC6(TET1; 607790)、MCL1(159552) 和 CDK6(603368) 特异性下调。对 AML 患者的 45 个样本进行的研究表明,MCL1 和 miR29B 之间呈负相关。尽管 42% 的 miR29A 相关基因也与 miR29B 相关,但存在一些差异:与蛋白质代谢相关的基因在 miR29B 相关基因中过多表达,与免疫功能相关的基因在 miR29A 相关基因中过多表达。最后,在单体 7 的原发性 AML 样本中,miR29A 和 miR29B 均下调(252270)。

Fort 等人通过筛选 miRNA 文库(2010) 在一小群 miRNA 中鉴定了 3 个 MIR29 家族成员,这些 miRNA 减少了 HuH7 人肝癌细胞中纤维蛋白原的产生(参见 FGA;134820)。MIR29A、MIR29B 或 MIR29C 的过表达降低了 HuH7 细胞中 3 个纤维蛋白原基因编码的所有转录物的稳态水平。荧光素酶测定显示,MIR29C 通过 FGA-α(E) mRNA 3-prime UTR 区域中的靶位点特异性降低 FGA-α(E) mRNA 水平。然而,MIR29A、MIR29B 和 MIR29C 似乎通过间接机制降低所有其他纤维蛋白原转录物水平。

史密斯等人使用计算机分析(2012) 确定 TBET(TBX21; 604895) 和 IFNG(147570) 都是 MIR29B 的靶标,表明 MIR29B 可能在 Th1 炎症中发挥重要作用。荧光素酶分析证实 MIR29B 直接与人 TBET 和 IFNG 的 3-prime UTR 相互作用并抑制表达。MIR29A 也抑制 TBET。Mir29b 表达在患有实验性自身免疫性脑脊髓炎(EAE) 的小鼠中显着升高。在缺乏 Mir29a/Mir29b1 基因簇(Mir29ab1) 的小鼠中,Ifng 的 T 细胞产量增加了 6 倍,并且这些小鼠的 Tbet 表达也增强。缺乏 Mir29ab1 的小鼠可以免受 EAE 侵害。来自多发性硬化症(MS; 126200) 患者的记忆 T 细胞的 MIR29B 水平显着升高,TBET 水平也升高,但 IFNG 水平没有变化。MS 患者 T 细胞激活后,高水平的 MIR29B 显着下降,表明 MS 患者的反馈环路失调,可能导致慢性炎症。史密斯等人(2012) 得出结论,MIR29 是 Th1 分化的调节因子,并提供平衡保护性免疫和自身免疫的机制。

Wang 等人通过分化骨髓前体细胞系和干细胞(2012) 在诱导粒细胞和单核细胞命运的细胞中检测到 MIR29A 和 MIR142-3p(615657) 的上调。两种 miRNA 均直接抑制 CCNT2(603862),导致单核细胞分化。MIR29A 和 MIR142-3p 还分别与 CDK6 和 TAB2(605101) 相互作用,并且发现这些靶标参与单核细胞和粒细胞分化的调节。在急性髓系白血病(AML; 601626) 母细胞中观察到 MIR29A 和 MIR142-3p 水平显着降低。在健康对照或 AML 患者的干细胞中强制表达 miRNA 会下调其靶标的表达并促进骨髓分化。王等人。

大脑等人(2013) 在 NOD2 刺激的人树突状细胞(DC) 中检测到 MIR29A、MIR29B 和 MIR29C 的表达上调(605956)。他们发现 MIR29 调节多种免疫介质的表达。值得注意的是,MIR29 通过直接靶向其 IL12p40(IL23B; 161561) 成分和间接靶向其 IL23p19(IL23A; 605580) 成分来下调 IL23,很可能是通过减少转录因子 ATF2(123811)。缺乏 Mir29 的小鼠中,葡聚糖硫酸钠(DSS) 诱导的结肠炎会加剧,并且与肠粘膜中 IL23 和 Th17 细胞因子升高有关。来自表达 NOD2 多态性的克罗恩病(266600) 患者的 DC 在刺激病原体模式识别受体后未能诱导 MIR29,并且这些 DC 在暴露于粘附的大肠杆菌时表现出 IL12p40 的释放增强。大脑等人。

Jiang 等人使用单因素方差分析(ANOVA) 和定量 RT-PCR(2020) 表明 ZNF532(619066) 在人视网膜周细胞中产生高葡萄糖调节的 circRNA cZNF532。小鼠中的 cZNF532 直系同源物与人类 cZNF532 具有超过 85% 的相似性。小鼠和人类的体外和体内分析表明,在糖尿病应激下,周细胞中的 cZNF532 表达上调。进一步分析表明,cZNF532 通过充当 miR29A-3p 的海绵并增加 miR29A-3p 靶基因 CSPG4(601172)、LOXL2(606663) 和 CDK2(116953) 的表达来调节视网膜周细胞功能和血管完整性。cZNF532-miR29a-3p 信号传导失调与视网膜血管功能障碍的人类患者有关。