核帽结合蛋白 1; NCBP1

  • 核帽结合蛋白,80-KD
  • NCBP
  • CBP80

HGNC 批准的基因符号:NCBP1

细胞遗传学位置:9q22.33 基因组坐标(GRCh38):9:97,633,820-97,673,747(来自 NCBI)

▼ 克隆与表达

在许多真核生物 mRNA 上发现了单甲基化帽结构。该帽可以通过促进核糖体与 mRNA 的结合来刺激细胞质翻译。还有证据表明,帽可以在剪接等核事件中发挥作用,其中体外测定表明它是剪接体形成所必需的。此外,有人认为,该帽有助于将 RNA 聚合酶 II 转录的 RNA 从细胞核输出到细胞质。与帽子结构结合的蛋白质可能参与这些过程。片冈等人(1994) 描述了在 HeLa 细胞核提取物中发现的编码 80-kD 核帽结合蛋白(NCBP) 的基因的克隆,该蛋白可能参与 mRNA 剪接和 RNA 输出。对部分纯化的蛋白质进行测序,由此设计 PCR 引物并用于从 HeLa 细胞文库中分离 cDNA(Kataoka 等,1994)。该 cDNA 编码预测的 790 个氨基酸的蛋白质。重组表位标记的 NCBP 专门定位于细胞核,并且核定位活性被证明仅限于 N 末端 70 个氨基酸(Kataoka 等,1994)。Izaurralde 等人也克隆了相同的 cDNA(1994),他注意到与酵母 GRC3/STO1 蛋白的序列相似性。

▼ 基因功能

无义介导的衰变(NMD) 消除了过早终止翻译的 mRNA。石垣等人(2001) 使用 CBP80 或其胞质对应物 eIF4E(133440) 的抗体来免疫纯化含有无义或含有无义转录物的核糖核蛋白(RNP)。数据表明,NMD 的发生与 CBP80 相关。作者将 NMD 敏感 mRNP 的其他成分定义为 CBP20(605133)、PABP2(602279)、eIF4G(600495) 以及 NMD 因子 UPF2(605529) 和 UPF3(参见 605530)。与 NMD 对翻译的依赖性一致,CBP80 结合 mRNA 的 NMD 被放线菌酮或抑制 tRNA 阻断。这些发现提供了证据表明翻译可以与 CBP80 相关联进行。他们还指出,CBP80 结合的 mRNA 经历了“先锋”轮翻译,

▼ 生化特征

Mazza 等人(2001) 确定了人核帽结合复合物的 2 埃晶体结构。该结构表明,大亚基 CBP80 有 3 个结构域,每个结构域都包含连续的螺旋发夹,类似于在参与 RNA 代谢的其他几种蛋白质中发现的所谓的 MIF4G 结构域。小亚基 CBP20 具有 RNP 折叠并与 CBP80 的第二和第三结构域相关。定点诱变揭示了 CBP20 的 4 个对于帽结合至关重要的残基。

Chadwick 等人通过与体细胞杂交小组的基因组 DNA 杂交进行作图(1996) 将 NCBP1 基因定位到 9q34.1。没有证据表明人类基因组中存在第二个基因座。此外,NCBP1 与 XPA 基因(611153) 杂交到相同的粘粒,表明这 2 个基因座在物理上非常接近。这两个基因座的紧密接近性在小鼠中也是保守的,这些基因位于 4 号染色体上。