迪乔治综合征关键区基因 6; DGCR6

HGNC 批准的基因符号:DGCR6

细胞遗传学位置:22q11.21 基因组坐标(GRCh38):22:18,906,319-18,912,087(来自 NCBI)

▼ 克隆与表达

德姆丘克等人(1996) 描述了从染色体 22q11 上的 DiGeorge 综合征关键区域(188400) 克隆一个基因,他们将其称为 DGCR6。 该基因在许多人体组织中检测到 1.1 kb 的转录本。 该基因编码的推定蛋白与果蝇性腺蛋白(gdl) 和人类层粘连蛋白(150290) 的 γ-1 链(对应到染色体 1q31)具有同源性。 尽管在具有平衡易位和 DiGeorge 表型的家族中,DGCR6 基因没有被易位断点打断,并且尽管在不携带 DiGeorge 关键区域大缺失的 DGS 患者中尚未阐明重排,但 Demczuk 等人还是认为 DGCR6 基因在不具有 DiGeorge 关键区域大缺失的 DGS 患者中没有被阐明(1996)指出DGCR6基因仍然可能是参与该综合征病理学的候选基因。

通过检查大多数患有腭心面综合征(192430)/DiGeorge 综合征的患者 22 号染色体上删除的低拷贝重复序列的侧翼区域,Edelmann 等人发现,(2001) 鉴定了 DGCR6L(609459),DGCR6 基因的一个副本。 他们通过胎儿脾 cDNA 文库的 PCR 克隆了 DGCR6 和 DGCR6L。 2 个 cDNA 具有 97% 的同一性,并且都推导出的 220 个氨基酸的蛋白质具有 97% 的同一性。 它们之间有7个氨基酸差异,其中2个是保守变化。 使用转录物特异性引物进行的 PCR 分析显示,DGCR6 在所有检查的成人和胎儿组织中表达,而 DGCR6L 在除成人骨骼肌和小肠之外的所有测试组织中表达。

普富尔等人(2005) 从大脑 cDNA 文库中克隆了 DGCR6 和 DGCR6L。 蛋白质印迹分析在人乳腺癌细胞系和所有检查的人体组织中检测到内源蛋白为约 25 kD 的双条带,心脏除外,心脏只有 1 个条带。 肝脏、心脏和骨骼肌中的蛋白质水平最高,胰腺和胎盘中的蛋白质水平中等,大脑中的蛋白质水平较低。 蛋白质印迹分析表明,大多数测试的人类肿瘤细胞系表达一种或两种蛋白质的水平升高。 表位标记蛋白的免疫荧光定位主要在转染细胞的细胞核中检测到,细胞质反应性较低。 未转染的 HeLa 细胞中存在微弱的核信号。 对转染的 HeLa 细胞表达的放射性标记蛋白进行免疫沉淀,结果表明两种蛋白均被磷酸化,且半衰期均为约 2.5 小时。

▼ 基因结构

埃德尔曼等人(2001) 确定 DGCR6 和 DGCR6L 均包含 5 个长度相等的外显子,具有保守的内含子/外显子结构。

▼ 测绘

德姆丘克等人(1996) 将 DGCR6 基因定位到染色体 22q11。 通过对基因组克隆进行测序,Edelmann 等人(2001) 将 DGCR6 基因对应到染色体 22q11 的低拷贝重复区域,该区域也包含 DGCR6L 基因。 这 2 个基因彼此方向相反。

▼ 进化

埃德尔曼等人(2001) 利用 FISH 对几种不同的猿类进行了进化研究,并结合了对多种不同灵长类动物的 DGCR6 序列分析。 他们确定,DGCR6 基因的重复至少有 1200 万年的历史,并且可能可以追溯到 3500 万年前,狭鼻科与扁鼻科分歧之前。 在黑猩猩和人类分化后,全长 HERV-K 原病毒整合到包含 DGCR6 的低拷贝重复区域,但不整合到包含 DGCR6L 的区域。 埃德尔曼等人(2001) 的结论是,两种旁系同源物的功能维持都存在选择性进化压力。