与前列腺癌相关的 SWI/SNF 复合拮抗剂 1，非编码; SCHLAP1

与前列腺 1 相关的第二染色体位点
前列腺癌相关转录 114； PCAT114
长基因间非编码 RNA 913； LINC00913
lincRNA 913

HGNC 批准的基因符号：SCHLAP1

细胞遗传学位置：2q31.3 基因组坐标（GRCh38）：2:180,692,103-180,916,938（来自 NCBI）

▼ 说明

长非编码 RNA（lncRNA），如 SCHLAP1，含有超过 200 个核苷酸，经常被聚腺苷酸化，与 RNA 聚合酶 II 的转录相关（参见 180660），并且预计可调节转录（Prensner 等人，2013）。

▼ 克隆与表达

Prensner 等人通过筛选侵袭性前列腺癌细胞表达的 lncRNA，然后进行数据库分析（2013）鉴定了 SCHLAP1 的 7 个剪接变体。最长的转录本由全部 7 个外显子组成，包含 1,675 个核苷酸，并具有聚腺苷酸化信号。 LNCaP 前列腺癌细胞中 90% 以上的 SCHLAP1 转录物含有 1,436、1,367 和 1,100 个核苷酸的剪接变体。 SCHLAP1 主要定位于核组分。

▼ 基因功能

Prensner 等人使用定量 PCR（2013）发现转移性前列腺癌中 SCHLAP1 的表达高于局限性前列腺癌。通过小干扰 RNA 敲低 SCHLAP1 会损害前列腺癌细胞的体外和裸鼠增殖、侵袭和转移潜力。相反，3种主要SCHLAP1变体的过度表达增加了永生化正常RWPE前列腺上皮细胞的侵袭能力。前列腺癌细胞系中 SCHLAP1 的敲低以与 SWI/SNF（参见 300012）染色质修饰复合物相反的方式改变了基因表达谱。 RNA 免疫沉淀实验表明 SCHLAP1 与 SMARCB1（601607）共沉淀，SMARCB1 是一种重要的 SWI/SNF 亚基，可促进 SWI/SNF 复合物与组蛋白结合。染色质免疫沉淀显示 SCHLAP1 的过度表达减少了 SMARCB1 与 SWI/SNF 靶基因的结合，并降低了靶基因的表达。 SCHLAP1 的敲除具有相反的效果。普伦斯纳等人（2013）得出结论，SCHLAP1 通过减弱 SWI/SNF 复合物与基因组靶标的结合来拮抗 SWI/SNF 复合物功能。

Raab 等人使用生化和基因组检测（2019）表明，SWI/SNF 复合物在过表达 SCHLAP1 的 RWPE1 细胞中保持完整，这与 Prensner 等人的发现相反（2013）。 SCHLAP1 的存在不会影响 SWI/SNF 组成、SWI/SNF 亚基的结合或 SWI/SNF 与染色质的关联，也不会诱导染色质变化。 RNA 免疫沉淀和测序分析表明 SCHLAP1 和 SWI/SNF 相互作用是 SWI/SNF 与转录 RNA 之间广泛非特异性相互作用的结果。作者证实 SCHLAP1 增加了 RWPE1 细胞侵袭，但这种增加的侵袭可能是由 SWI/SNF 孤立机制驱动的。

▼ 基因结构

普伦斯纳等人（2013）确定 SCHLAP1 基因包含 7 个外显子，跨度近 200 kb。

▼ 测绘

通过基因组序列分析，Prensner 等人（2013）将 SCHLAP1 基因定位到染色体 2q31.3。