NECAP 内吞作用相关蛋白 1; NECAP1

  • 适应素耳结合层相关蛋白 1

HGNC 批准的基因符号:NECAP1

细胞遗传学位置:12p13.31 基因组坐标(GRCh38):12:8,082,273-8,097,880(来自 NCBI)

▼ 描述

NECAP1 基因编码一种辅助蛋白,参与突触中网格蛋白介导的内吞作用(Alazami 等人的总结,2014)。

▼ 克隆和表达

Ritter 等人通过对大鼠脑网格蛋白包被的囊泡进行蛋白质组学分析(2003) 确定了 Necap1。推导的蛋白质含有275个氨基酸。Western blot 分析检测到 Necap1 主要在大脑中表达。

阿拉扎米等人(2014) 发现 Necap1 在整个胚胎小鼠大脑和脊髓中强烈表达。

▼ 基因功能

Ritter 等人(2003) 在大鼠 Necap1 蛋白中鉴定出一个基序(WVQF),该基序直接与接头蛋白 2(AP-2) 复合物的 α-适应素亚基(AP2A1;601026) 的球状耳结构域结合。该序列的突变阻断了网格蛋白介导的内吞作用。

▼ Mapping

Hartz(2007) 根据 NECAP1 序列(GenBank AK074858) 与基因组序列(build 36.1) 的比对,将 NECAP1 基因对应到染色体 12p13.31。

▼ 分子遗传学

在患有发育性癫痫性脑病 21(DEE21; 615833) 的沙特阿拉伯近亲血缘家庭成员中,Alazami 等人(2014) 鉴定了 NECAP1 基因中的纯合截短突变(R48X; 611623.0001)。该突变是通过纯合性作图和外显子组测序的结合发现的。

Alsahli 等人使用三重全外显子组测序(2018) 在一名患有 DEE21 的女孩中鉴定出 NECAP1 基因 R48X 突变的纯合性。她的表亲沙特阿拉伯父母是该突变的杂合子。

Mizuguchi 等人发现,一名患有 DEE21 的男孩是马来西亚第一代欧亚裔表亲所生(2019) 鉴定了 NECAP1 基因中的典型剪接位点突变(611623.0002)。该突变是通过全外显子组测序发现并经桑格测序证实的,在父母和他的两个未受影响的同胞中以杂合状态存在。

▼ 动物模型

Hitti 等人通过对 2 只患有进行性视网膜萎缩的巨型雪纳瑞同窝幼崽及其未受影响的父母进行基因组测序,然后对 568 个犬类基因组进行连续过滤(2019) 鉴定了 NECAP1 基因中的一个候选变体(c.544G-A;G182R)。尽管在狐狸犬和腊肠犬品种中检测到了杂合子,但在 5,130 只犬科动物中对该变异进行的基因分型仅在另外 3 只受影响的巨型雪纳瑞犬中发现其处于纯合状态。

▼ 等位基因变异体(2 个选定示例):

.0001 发育性和癫痫性脑病 21
NECAP1、ARG48TER
Alazami 等人在患有发育性和癫痫性脑病 21(DEE21; 615833) 的沙特阿拉伯近亲家庭受影响成员中(2014) 鉴定了 NECAP1 基因中的纯合 c.142C-T 转换,导致 N 末端发生 arg48 至 ter(R48X) 取代。该突变是通过纯合性作图和外显子组测序相结合发现的,在 dbSNP 数据库或 1,068 条对照染色体中不存在。对患者淋巴母细胞的分析显示突变 mRNA 水平下降,表明无义介导的 mRNA 衰减。阿拉扎米等人(2014) 假设该突变可能损害突触介导的神经元通讯。患者在婴儿早期曾出现顽固性癫痫发作。

Alsahli 等人使用三重全外显子组测序(2018) 在患有 DEE21 的女孩中鉴定了 NECAP1 基因中 c.142C-T 转换(c.142C-T, NM_015509.3) 的纯合性,导致 R48X 替换。她的表亲沙特阿拉伯父母是该突变的杂合子。在包含 1,200 个种族匹配对照的内部外显子组数据库、沙特人类基因组计划数据库或其他公共数据库中均未发现该突变。没有功能研究的报道。患者3个月大时出现癫痫发作。

.0002 发育性和癫痫性脑病 21
NECAP1、IVS3DS、GA、+1
Mizuguchi 等人发现,一名 16 个月大的男孩,其表亲是欧亚裔,父母是马来西亚人,患有发育性癫痫性脑病 21(DEE21;615833),临床诊断为大田原综合征(2019) 在 NECAP1 基因的内含子 3 中发现了一个纯合剪接位点突变(c.301+1G-A, NM_015509.3),导致剪接异常并导致移码和过早终止密码子(Gly101AspfsTer45)。该突变是通过全外显子组测序发现并经桑格测序证实的,在他的父母和未受影响的兄弟姐妹中以杂合状态存在。该变体不存在于 gnomAD 数据库或 575 个日本外显子组对照的内部数据库中。没有功能研究的报道。患者3个月大时出现癫痫发作。