程序性细胞死亡 6 相互作用蛋白; PDCD6IP

  • PDCD6 相互作用蛋白
  • ALG2 相互作用蛋白 1;AIP1
  • ALG2 相互作用蛋白 X;ALIX
  • KIAA1375

HGNC 批准的基因符号:PDCD6IP

细胞遗传学定位:3p22.3 基因组坐标(GRCh38):3:33,798,629-33,869,702(来自 NCBI)

▼ 说明

PDCD6IP 与细胞凋亡相关的蛋白质(包括 PDCD6(601057))以及调节膜形状的内亲素相互作用(Chatellard-Causse 等,2002)。

▼ 克隆和表达

Nagase 等人通过对从大小分级的胎儿脑 cDNA 文库中获得的克隆进行测序,(2000) 克隆了 PDCD6IP,他们将其命名为 KIAA1375。RT-PCR ELISA 检测到在所有测试的成人和胎儿组织中均呈中等表达,但成人肺、脾、胰腺和胎儿脑除外,这些组织均显示低表达。在所有检查的单个大脑区域中均检测到中等表达。

吴等人(2001) 通过在数据库中搜索与线虫 PDCD6IP 同源物 YNK1 相似的序列,然后搜索胎盘 cDNA 文库的 5-prime 和 3-prime RACE,克隆了全长 PDCD6IP,他们将其命名为 p95。推导的 868 个氨基酸的 PDCD6IP 蛋白的计算分子量为 96 kD。它具有富含脯氨酸的 C 末端,其中包含多个 PxxP 基序,这些基序是 SRC(190090) 同源域 3(SH3) 结合域。PDCD6IP 还包含 SRC 家族成员保守的酪氨酸自磷酸化共有序列,以及几个额外的保守酪氨酸。PDCD6IP 与来自小鼠、非洲爪蟾、果蝇、几种酵母物种和拟南芥的蛋白质具有显着的同源性。Northern 印迹分析在 HeLa 细胞 RNA 中检测到内源 3.5-kb 转录物。

米索滕等人(1999) 使用 Alg2(PDCD6) 作为诱饵,在脑 cDNA 文库的酵母 2 杂交筛选中克隆了小鼠 Pdcd6ip,他们将其称为 Alix。推导的 869 个氨基酸蛋白质的计算分子量约为 96 kD。作者指出,除了几个 SH3 结合域之外,Alix 的 C 末端还包含一个 WW 结合域。Northern 印迹分析在所有测试的成年小鼠组织中检测到 3.5-和 6.5-kb 转录本。

▼ 基因功能

由于细胞周期G1期停滞的诱导,正常上皮细胞在细胞与细胞接触后在培养物中停止增殖。然而,恶性 HeLa 细胞不会抑制细胞与细胞接触时的增殖,而是会进行多层生长。吴等人(2001) 确定 PDCD6IP 的过度表达恢复了 HeLa 细胞经历 G1 期停滞并在汇合后形成单层培养物的能力。PDCD6IP 的过表达不会抑制稀疏培养物中 HeLa 细胞的生长。

吴等人(2002)发现HeLa细胞中PDCD6IP的过度表达促进脱离诱导的细胞凋亡,抑制活细胞从培养基脱离,并降低注射到裸鼠后的致瘤性。小鼠成纤维细胞中的过度表达促进扁平细胞形态并减缓细胞增殖。反义PDCD6IP转染则具有相反的效果,成纤维细胞形态更圆润,生长更密集。

米索滕等人(1999) 确定小鼠 Alix 和 Alg2 之间的相互作用是钙依赖性的。

维托等人(1999) 确定小鼠 Alix 和 Alg2 共定位于成纤维细胞的胞质中,并且它们的结合需要钙。Alix C 末端的过度表达可保护 HeLa 和 COS 细胞免受营养因子撤除诱导的细胞凋亡。

通过酵母 2-杂交分析,Chatellard-Causse 等人(2002) 确定小鼠 Alix 与内亲素 Sh3p4(604465)、Sh3p8(601768) 和 Sh3p13(603362) 结合。使用截短突变体进行的免疫共沉淀和叠加实验表明,内亲素的 SH3 结构域与 Alix 的 C 末端结合,特别是在包含 PxRPPPP 共有序列的 14 个氨基酸区域内。在人胚胎肾细胞中过度表达后,全长 Alix 和 Alix 的 N 末端集中在核周区域以及板状伪足和丝状伪足的细胞外围。Alix C 末端在几种细胞系中的过度表达导致核周囊泡周围的浓缩和细胞质空泡化成管状囊泡结构。免疫定位显示,该结构排列有 Alix 和内质网驻留蛋白。与 Sh3p4 共表达后,空泡化得到增强,而缺乏富含脯氨酸结构域的 Alix 在单独或与 Sh3p4 一起过表达时不会引起空泡化。

松尾等人(2004) 发现非常规磷脂溶双磷脂酸(LBPA) 可以诱导多囊泡脂质体的形成,该脂质体类似于体内发现这种脂质时存在的多囊泡内体。该过程取决于体内内体膜上存在的相同 pH 梯度,并由 Alix 选择性控制。反过来,Alix 调节体内含有 LBPA 的内体的组织。

Katoh 等人通过酵母 2-杂交分析、免疫共沉淀分析和体外蛋白质下拉分析(2003) 表明 CHMP4B(610897) 与 ALIX 相互作用。HeLa 细胞中 CHMP4B 的过度表达导致 ALIX 从细胞质重新分布到核周区域,两种蛋白在此处共定位。在稳定表达 CHMP4B 的 HEK293 细胞中,ALIX N 端区域的瞬时过表达诱导了囊泡样结构的形成,其中 CHMP4B 和截短的 ALIX 共定位。AAA 型 ATP 酶 SKD1(VPS4B;609983) 的显性失活形式,在内吞途径中发挥关键作用,与 CHMP4B 共免疫沉淀。此外,CHMP4B 和 ALIX 均与显性失活 SKD1 共定位于转染的 HeLa 细胞的核周点状分布中,

Katoh 等人使用免疫共沉淀分析和体外 Pull-down 测定(2004) 表明 ALIX 与所有 3 种 CHMP4 蛋白相互作用,尽管 ALIX 和 CHMP4B 之间的相互作用比 ALIX 和 CHMP4A(610051) 或 CHMP4C(610899) 之间的相互作用更强。

Carlton 和 Martin-Serrano(2007) 发现,参与 HIV-1 出芽的 2 种蛋白质——肿瘤易感基因 101(TSG101; 601387)(转运 1(ESCRT-1) 所需的内体分选复合体的一个亚基)和 ALIX(一种 ESCRT 相关蛋白)在胞质分裂过程中通过与中心体蛋白 55(CEP55; 6) 相互作用而被募集到中间体。 10000),一种对于脱落至关重要的中心体和中体蛋白。胞质分裂的完成需要 TSG101、ALIX 和可能的 ESCRT-1 的其他成分。Carlton 和 Martin-Serrano(2007) 得出结论,因此,HIV-1 出芽和胞质分裂使用相似的细胞成分子集来进行拓扑相似的膜裂变事件。

Chen 等人通过对人 T 细胞 cDNA 文库进行酵母 2 杂交分析,然后进行免疫共沉淀和免疫荧光分析(2009) 将 ALIX 鉴定为 GAL3(LGALS3; 153619) 的结合伴侣,并表明 ALIX 易位至活化 T 细胞中的免疫突触。陈等人(2009) 得出的结论是,GAL3 是 T 细胞激活的抑制性调节因子,它通过促进 T 细胞受体下调而在细胞内发挥作用,可能是通过调节免疫突触的 ALIX 功能。

冯等人(2013) 表明,从细胞中释放的甲型肝炎病毒(HAV) 隐藏在宿主来源的膜中,从而保护病毒体免受抗体介导的中和作用。有包膜病毒(eHAV) 类似于外泌体,即在细胞间通讯中很重要的小囊泡。它们具有完全传染性,对氯仿提取敏感,并在感染者的血液中循环。它们的生物发生依赖于与转移所需的内体分选复合物相关的宿主蛋白,即 VPS4B 和 ALIX。冯等人(2013) 得出的结论是,虽然 HAV 劫持膜有利于中和抗体的逃脱,并可能促进病毒在肝脏内遗传,但抗衣壳抗体在感染 eHAV 后限制复制,

▼ Mapping

Gross(2015) 根据 PDCD6IP 序列(GenBank AF151793) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 PDCD6IP 基因对应到染色体 3p22.3。