SORTING NEXIN 6; SNX6

HGNC 批准的基因符号:SNX6

细胞遗传学位置:14q13.1 基因组坐标(GRCh38):14:34,561,092-34,630,147(来自 NCBI)

▼ 说明

SNX6 是分选 nexin 分子家族的成员,该分子包含 phox 同源(PX) 结构域,并与参与蛋白质转移的几种酵母蛋白具有同源性(Parks 等,2001)。

▼ 克隆与表达

Parks 等人使用以 SMAD1(601595) 作为诱饵的酵母 2-杂交筛选(2001) 鉴定了 nexin-6 的分选并从人类心脏 cDNA 文库中克隆了全长 cDNA。 推导的 406 个氨基酸蛋白与 SNX5(605937) 蛋白具有 66% 的序列同一性。 Northern 印迹分析检测到主要 2.2-kb 和次要 3.0-kb 转录本的广泛表达,在心脏、骨骼肌和胎盘中表达水平最高,在肺和肝脏中表达水平较低。

▼ 测绘

国际辐射混合测绘联盟将 SNX6 基因测绘到 14 号染色体(WI-6202)。

▼ 基因功能

帕克斯等人(2001) 发现 SNX6 与 Smad1 的相互作用非常弱,但免疫沉淀研究表明,SNX6 通过其 PX 结构域与受体丝氨酸-苏氨酸激酶的转化生长因子-β 家族的成员强烈相互作用,包括 ActRIIB(602730)、TGFBR1(参见 190181) 和 TGFBR2(参见 190182)。 帕克斯等人(2001) 发现 SNX 1-4(参见 601272)也与 TGFB 受体家族相互作用,表现出不同的受体偏好。 相反,SNX6 在与受体酪氨酸激酶相互作用方面与其他 SNX 蛋白相似,包括表皮生长因子(131550)、血小板衍生生长因子(参见 173490)、胰岛素(147670) 和长形式的瘦素受体(601007)。 SNX1(601272)、SNX2(605929)、SNX4(605931) 和 SNX6 之间存在强烈的异聚相互作用,表明体内形成了寡聚复合物。 分子的 PX 结构域和卷曲螺旋区域都可能有助于异源寡聚化。 间接免疫荧光研究表明,SNX6 与其他 SNX 共定位,特别是在细胞质中。

细胞表面受体 CED1(107770) 介导吞噬细胞对凋亡细胞的识别,从而实现秀丽隐杆线虫中细胞尸体的清除。 陈等人(2010)发现线虫细胞内蛋白质分选复合体retromer通过介导CED1的再循环来清除细胞尸体。 哺乳动物逆转录酶复合体包含分选连接蛋白 1 和 2(601272, 605929)(线虫同源物 snx1)以及 5 和 6(605937)(线虫同源物 snx6)。 逆转录酶被招募到含有细胞尸体的吞噬体表面,其功能丧失导致细胞尸体去除缺陷。 逆转录酶可能通过与细胞尸体识别途径中的 CED1 直接相互作用发挥作用。 在缺乏逆转录酶功能的情况下,CED1 与溶酶体结合,无法从吞噬体和细胞质再循环到质膜。 因此,陈等人(2010) 的结论是,retromer 通过在细胞尸体吞噬过程中调节吞噬受体,是凋亡细胞清除的重要介质。