TAR RNA 结合蛋白 1; TARBP1

  • TRP185

HGNC 批准的基因符号:TARBP1

细胞遗传学位置:1q42.2 基因组坐标(GRCh38):1:234,391,312-234,479,178(来自 NCBI)

▼ 克隆与表达

HIV-1 是获得性免疫缺陷综合症(AIDS) 的病原体,含有 RNA 基因组,可在复制周期中产生染色体整合的 DNA。 HIV Tat 蛋白(参见 601409)是一种转录激活蛋白,可与稳定的茎-凸出-环结构 TAR RNA 的凸出区域结合,激活 HIV-1 长末端重复序列(LTR)。 Tat 在啮齿动物中激活 LTR 的效率低于在人类细胞中的效率,这表明细胞 RNA 结合蛋白也参与了 HIV 复制的调节。

通过 RNA 凝胶延迟分析,Wu 等人(1991) 鉴定了一种 185 kD 的蛋白质,他们将其命名为 TRP185,该蛋白质与 TAR RNA 的环区域结合。 Wu-Baer 等人通过微序列分析,然后使用简并引物进行 PCR 并筛选 HeLa 细胞 cDNA 文库(1995)分离出编码TRP185的cDNA。 推导的 1,621 个氨基酸的蛋白质包含一个亮氨酸拉链结构域,在氨基酸 535 和 556 之间每七个位置有一个 leu 残基,以及许多以 7 个氨基酸间隔间隔的赖氨酸螺旋重复。 通过免疫印迹和凝胶延迟分析,Wu-Baer 等人(1996) 证实重组蛋白和天然蛋白具有相同的分子量,并且在某些辅因子(例如 EEF1A,130590 和 PTB,600693)存在的情况下都与 TAR RNA 环序列结合。 吴贝尔等人(1995) 发现 RNA 聚合酶 II(参见 180660)直接结合 TAR RNA 环和凸出区域,并且需要相同的辅因子。 TRP185 和 RNA polII 与 TAR RNA 的结合是相互排斥的,表明 TRP185 可能单独发挥作用,或与 Tat 联合发挥作用,将 RNA polII 与 TAR RNA 分离。

▼ 测绘

吴贝尔等人(1995) 指出 TARBP1 基因对应到染色体 1p。

Stumpf(2020) 根据 TARBP1 序列(GenBank BC016023) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 TARBP1 基因对应到染色体 1q42.2。