β-脲基丙酶; UPB1

  • BUP1
  • β-丙氨酸合成酶

HGNC 批准的基因符号:UPB1

细胞遗传学位置:22q11.23 基因组坐标(GRCh38):22:24,495,059-24,528,680(来自 NCBI)

▼ 描述

UPB1 基因编码 β-脲基丙酸酶(EC 3.5.1.6),催化嘧啶降解的最后一步,将 N-氨甲酰-β-氨基异丁酸和 N-氨甲酰-β-丙氨酸分别转化为 β-氨基异丁酸(参见 210100)和 β-丙氨酸、氨和二氧化碳(Vreken 等人,1999)。

▼ 克隆和表达

Vreken 等人(1999)克隆了BUP1基因。1,152 bp 的 BUP1 开放解读码组对应于 384 个氨基酸的蛋白质,计算分子量为 43 kD,周围有 61 个核苷酸的 5 引物非翻译区和 277 个核苷酸的 3 引物非翻译区。该蛋白与大鼠 β-脲基丙酸酶 cDNA 的翻译产物具有 84% 的同一性。人类 cDNA 在大肠杆菌和真核 COS-7 细胞中的表达显示出非常高的 β-脲基丙酸酶酶活性,从而证实了 cDNA 的身份。来自大脑、肝脏、肾脏和心脏的人类 EST 文库含有部分 β-脲基丙酸酶 cDNA,表明在这些组织中表达,如在大鼠中所见。

▼ 基因结构

Vreken 等人(1999) 确定 BUP1 基因由 11 个外显子组成,跨越大约 20 kb 的基因组 DNA。

▼ 测绘

Vreken 等人的地图(1999) 通过荧光原位杂交将人类 UPB1 基因定位到染色体 22q11.2。

▼ 基因功能

β-脲基丙酸酶也被称为β-丙氨酸合酶,因为它催化动物体内β-丙氨酸的生物合成。在其活性形式下,该酶以十二聚体或六聚体形式存在,而该酶响应其产物 β-丙氨酸而解离成无活性的三聚体(Matthews 等人,1992)。

坂本等人(2001) 发现纯化的人肝脏 β-脲基丙酸酶活性可被 1 mM 丙酸盐抑制,但不会被 10 mM β-丙氨酸抑制。在这方面它与大鼠肝酶不同。

▼ 分子遗传学

Van Kuilenburg 等人(2004) 报道了 4 名 β-脲基丙酸酶缺乏症患者的 UPB1 基因中存在 3 个突变等位基因(UPB1D;613161)。这些突变包括2个剪接位点突变(IVS1-2A-G,606673.0001和IVS8-1G-A,606673.0002)和1个错义突变(A85E;606673.0003)。A85E 突变酶在大肠杆菌中的异源表达没有产生残留活性。作者推测,β-氨基异丁酸稳态的改变和/或氧化应激的增加可能导致这些患者出现一些临床异常。

▼ 等位基因变体(4 个选定示例):

.0001 β-脲基丙酸酶缺乏症
UPB1、IVS1AS、AG、-2
在 Assmann 等人描述的最初的 β-脲基丙酸酶缺乏症患者(UPB1D;613161) 中(1998),范库伦伯格等人(2004) 发现 UPB1 基因 IVS1-2A-G 和 IVS8-1G-A 中 2 个剪接受体位点突变存在复合杂合性(606673.0002)。

范·奎伦伯格等人(2004) 描述了一名近亲父母出生的 3 岁土耳其女孩,她因 β-脲基丙酸酶缺乏而患有精神运动性和严重智力障碍。该孩子的 IVS1-2A-G 突变是纯合子。预计该突变会导致外显子 1 下游发生移码。

.0002 β-脲基丙酸酶缺乏症
UPB1, IVS8AS, GA, -1
van Kuilenburg 等人在一名非近亲结婚的 4 个月大男孩中,在肝活检中未检测到 β-脲基丙酸酶活性(UPB1D; 613161)(2004) 在 UPB1 基因中发现剪接位点突变 IVS8-1G-A 的纯合性。预计该突变会导致外显子 8 下游发生移码。

范·奎伦伯格等人(2004) 发现了 Assmann 等人描述的最初的 β-脲基丙酸酶缺乏症患者(1998) 对于这个和另一个剪接位点突变 IVS1-2A-G(606673.0001) 来说是复合杂合的。

.0003 β-脲基丙酸酶缺乏症
UPB1,ALA85GLU
van Kuilenburg 等人在一名 12 个月大的非洲女孩中发现了 β-脲基丙酸酶缺乏症(UPB1D;613161),该女孩由非近亲婚配出生(2004) 在 UPB1 基因的外显子 2 中检测到 254C-A 颠换,导致 ala85-to-glu(A85E) 取代。突变酶在大肠杆菌中的异源表达表明没有内源性β-脲基丙酸酶活性。

.0004 β-脲基丙酸酶缺乏症
UPB1,ARG70PRO
在一名患有 β-脲基丙酸酶缺乏症(UPB1D;613161) 的澳大利亚男孩中,Yaplito-Lee 等人(2008) 鉴定了 UPB1 基因中 2 个突变的复合杂合性:外显子 2 中的 209G-C 颠换,导致 arg70-to-pro(R70P) 取代,以及剪接位点突变(606673.0001)。他患有多种先天性泌尿生殖系统和结直肠异常,包括膀胱外翻、肛门闭锁、阑尾和远端结肠重复、阴茎和阴囊分叉。肾脏影像显示骨盆和输尿管中度扩张和回声区。12 个月大时,他的生长、发育和神经系统检查均显示正常。体外功能表达研究表明R70P突变蛋白没有残留活性。