tRNA 甲基转移酶 1; TRMT1

  • tRNA 甲基转移酶 1,酿酒酵母
  • TRM1的同源物
  • N2,N2-二甲基鸟苷-26 tRNA 甲基转移酶
  • tRNA(m(2,2)G26) 二甲基转移酶

HGNC 批准的基因符号:TRMT1

细胞遗传学位置:19p13.13 基因组坐标(GRCh38):19:13,104,906-13,116,739(来自 NCBI)

▼ 描述

TRMT1 基因编码 tRNA 甲基转移酶-1,该酶以 S-腺苷-L-甲硫氨酸为底物催化 tRNA 中鸟嘌呤 26 的环外 2-氨基发生二甲基化(Liu 和 Straby,2000)。

▼ 克隆和表达

Liu 和 Straby(2000) 通过数据库搜索酵母和线虫的相关序列,鉴定出了人类 tRNA N2,N2-二甲基鸟苷(m2,2G) 二甲基转移酶(EC 2.1.1.32),他们将其称为 TRM1。人类 cDNA 编码推导的 659 个氨基酸的蛋白质,与酵母和秀丽隐杆线虫同源物分别有 26% 和 31% 的同一性。当人类蛋白在缺乏 tRNA(m2,2G)二甲基转移酶活性的大肠杆菌中表达时,它能够催化二甲基鸟苷的形成。此外,TRM1 特异性靶向人 tRNA(Tyr) 的 G26 位点。突变分析表明,蛋白质保守区域的改变完全消除了酶的活性。

▼ 测绘

Scott(2007) 根据 TRMT1 序列(GenBank BC040126) 与基因组序列(build 36.2) 的比对,将 TRMT1 基因对应到染色体 19p13.3。

▼ 分子遗传学

在患有常染色体隐性遗传智力发育障碍的伊朗近亲家庭(M300) 的受影响成员中 - 68(MRT68; 618302),Najmabadi 等人(2011) 鉴定了 TRMT1 基因中的纯合移码突变(611669.0001)。该家庭是 136 个患有智力障碍的近亲家庭中的一员,他们接受了基因分析。没有对该变体进行功能研究。

3个成年兄弟,由近亲伊朗父母所生(家庭9000114),拥有MRT68、Davarniya等人(2015) 在 TRMT1 基因(611669.0003) 中发现了纯合移码突变。该突变是通过连锁分析和全外显子组测序相结合发现的,并通过桑格测序证实,与家族中的疾病分离。在 100 个伊朗控制中没有发现它。没有进行该变异的功能研究和患者细胞的研究,但预计该变异会导致功能丧失。

Blaesius 等人在来自 2 个无关的近亲巴基斯坦家庭的 4 名患有 MRT68 的患者中(2018) 鉴定了 TRMT1 基因中的纯合功能丧失突变(611669.0001 和 611669.0002)。这些突变是通过全外显子组测序发现的,并通过桑格测序证实,与家族中的疾病分开。没有进行变体的功能研究和患者细胞的研究。

▼ 等位基因变异体(3 个选定示例):

.0001 智力发育障碍,常染色体隐性 68
TRMT1、32-BP DEL、NT657
Blaesius 等人发现,一名男孩的父母是巴基斯坦近亲(家庭 1),患有常染色体隐性遗传性智力发育障碍 68(MRT68;618302)(2018) 在 TRMT1 基因的外显子 7 中发现了一个纯合 32 bp 缺失(c.657_688del32, NM_017722),预计会导致甲基转移酶结构域中的移码和提前终止(Gln219HisfsTer22)。该突变是通过全外显子组测序发现并经桑格测序证实的,与家族中的疾病分离。在 gnomAD 数据库中找不到它。布莱修斯等人(2018) 指出 Najmabadi 等人之前已鉴定出相同的纯合突变(2011) 在具有相似表型的伊朗近亲家庭(M300) 的受影响成员中。没有进行变体的功能研究和患者细胞的研究,

.0002 智力发育障碍,常染色体隐性遗传 68
TRMT1,IVS12DS,GT,+1
在 3 个同胞中,由巴基斯坦近亲父母(家庭 2)出生,患有常染色体隐性遗传智力发育障碍 68(MRT68;618302),Blaesius 等人(2018) 在 TRMT1 基因的内含子 12(c.1506+1G-T, NM_017722) 中发现了纯合的 G 到 T 颠换,预计这会导致异常剪接和功能丧失。该突变是通过全外显子组测序发现并经桑格测序证实的,与家族中的疾病分离。在 gnomAD 数据库中找不到它。没有进行变体的功能研究和患者细胞的研究。

.0003 智力发育障碍,常染色体隐性遗传 68
TRMT1,2-BP DEL,1332GT
Davarniya 等人有 3 名兄弟,由伊朗近亲父母(家庭 9000114)所生,患有常染色体隐性遗传性智力发育障碍 68(MRT68;618302)(2015) 在 TRMT1 基因中发现了一个纯合 2-bp 缺失(c.1332_1333delGT, NM_001136035.2),预计会导致移码和提前终止(Tyr445LeufsTer28)。该突变预计会导致无义介导的 mRNA 衰变和功能丧失。该突变是通过连锁分析和全外显子组测序相结合发现的,并通过桑格测序证实,与家族中的疾病分离。该变体根据 dbSNP(版本 137)、1000 基因组计划和外显子组测序计划数据库进行筛选。伊朗的 100 项管制中都没有这一点。没有进行变体的功能研究和患者细胞的研究。