SPARC/骨连接素、CWCV 和 KAZAL 样结构域蛋白聚糖 2; SPOCK2

TESTICAN 2
KIAA0275

HGNC 批准的基因符号:SPOCK2

细胞遗传学位置:10q22.1 基因组坐标(GRCh38):10:72,059,034-72,089,032(来自 NCBI)

▼ 说明

蛋白聚糖由核心蛋白和共价连接的糖胺聚糖组成,是细胞外基质的组成部分。 SPOCK2 编码新的 Ca(2+) 结合蛋白聚糖家族的成员(Vannahme 等人总结,1999)。

▼ 克隆与表达

Nagase 等人通过筛选未成熟骨髓细胞系中具有编码大蛋白质潜力的 cDNA(1996) 鉴定了一个 SPOCK2 cDNA,他们将其称为 KIAA0275,编码一种与睾丸(SPOCK1;602264) 序列相似且具有 1 型甲状腺球蛋白重复序列​​的蛋白质。 Northern印迹分析检测到脑、胸腺和外周血白细胞中的表达最高。

Vannahme 等人通过使用 EST 片段筛选人脑 cDNA 文库,该片段与 BM-40/SPARC/骨连接素(182120) 的卵泡抑素样结构域具有序列相似性(1999) 克隆了 SPOCK2 cDNA,他们将其称为 testican-2,编码推导的 424 个氨基酸的前体蛋白,具有 22 个氨基酸的信号肽,计算出的分子量为 46.8 kD。成熟的 402 个氨基酸蛋白具有 5 个结构域:卵泡抑素样结构域、Ca(2+) 结合结构域、甲状腺球蛋白样结构域和具有 2 个假定糖胺聚糖附着位点的 C 末端区域。 SPOCK2 蛋白与 SPOCK1 具有 43% 的整体序列同一性。对成年小鼠组织的 Northern 印迹分析显示,一个主要的 6.1-kb 转录物在大脑中高水平表达,而在肺和睾丸中低水平表达。还检测到 4.4 和 2.6 kb 的小条带。原位杂交证明在嗅球、大脑皮层、海马、丘脑、小脑、脑桥和延髓的多种神经元细胞类型中广泛表达。由 Ca(2+) 结合 EF-hand 结构域和甲状腺球蛋白样结构域组成的重组片段在圆二色性研究中显示出可逆的 Ca(2+) 依赖性构象变化。

▼ 测绘

通过辐射杂交分析,Nagase 等人。 Vannahme 等(1996) 将 SPOCK2 基因定位到 10 号染色体。通过序列分析,Vannahme 等人(1999)将该基因定位于10q21-q23。