SHOOTIN1; SHTN1

KIAA1598

HGNC 批准的基因符号:SHTN1

细胞遗传学位置:10q25.3 基因组坐标(GRCh38):10:116,881,477-117,126,586(来自 NCBI)

▼ 克隆与表达

Nagase 等人通过对从尺寸分级的胎儿脑 cDNA 文库中获得的克隆进行测序(2000)克隆了KIAA1598。推导的蛋白质含有446个氨基酸。 RT-PCR ELISA 在成人大脑中检测到非常高的表达,其次是肝脏、肾脏、胰腺和脊髓。在心脏、肺、脾、睾丸、卵巢、胎肝和胎脑中表达中等,在成人骨骼肌中表达较低。在所检查的所有特定成人大脑区域中,尤其是丘脑和海马体中,表达量都很高。

通过数据库分析,Toriyama 等人(2006) 确定 KIAA1598 基因(他们将其称为 SHOOTIN1)编码一种 456 个氨基酸的蛋白质,计算得出的分子量为 52.6 kD。 KIAA1598 包含 3 个卷曲螺旋结构域和一个富含脯氨酸的区域。

张等人(2019) 报道 SHTN1 产生 2 个剪接变体,一种是短变体 SHTN1S,缺少外显子 15 和 16,另一种是长变体 SHTN1L,包括外显子 1 到 17。这些变体编码具有相同 N 端序列的蛋白质亚型但 C 末端不同,SHTN1L 的 C 末端比 SHTN1S 长得多。 SHTN1S 同工型对应于 Toriyama 等人报道的蛋白质(2006)。

▼ 基因结构

张等人(2019)确定SHTN1基因包含17个外显子。外显子 15 和 16 进行选择性剪接。

▼ 测绘

Gross(2019) 根据 SHTN1 序列(GenBank BC022348) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 SHTN1 基因对应到染色体 10q25.3。

▼ 基因功能

鸟山等人(2006) 发现 Shootin1 在培养的大鼠海马神经元极化过程中上调。多个神经突之间的表达波动,最终 Shootin1 在单个神经突中不对称积累,从而导致轴突诱导和神经元极化。用过量 Shootin1 扰乱 Shootin1 的不对称组织会破坏极化,而抑制 Shootin1 表达则会抑制极化。过表达和 RNA 干扰研究表明,Shootin1 是空间定位的磷酸肌醇 3-激酶(参见 PIK3CG;601232)活性所必需的。 Shootin1表现出顺行转移至生长锥并扩散回胞体,抑制这种转移可防止其在神经元中的不对称积累。鸟山等人(2006) 提出 Shootin1 参与神经元极化所需的内部不对称信号的生成。

张等人(2019) 发现在小鼠神经元的早期轴突形成过程中,Shtn1 表达从 Shtn1l 转变为 Shtn1s。 Shtn1l 促进轴突生长,决定轴突长度,而 Shtn1s 促进轴突规范,决定轴突命运。免疫沉淀和突变分析表明,Shtn1l 结合肌节蛋白并促进肌节蛋白聚合,从而通过 Shtn1 中不存在的包含 RRR 的基序驱动轴突生长。 RNA 结合蛋白 Ptbp2(608449) 控制从 Shtn1l 表达到 Shtn1s 表达的发育转换。