PHD 指蛋白 17； PHF17

上皮细胞凋亡和分化的基因； JADE1
KIAA1807

HGNC 批准的基因符号：JADE1

细胞遗传学位置：4q28.2 基因组坐标（GRCh38）：4:128,809,700-128,875,224（来自 NCBI）

▼ 克隆与表达

Nagase 等人通过对从尺寸分级的胎儿脑 cDNA 文库中获得的克隆进行测序（2001）克隆了PHF17，他们将其命名为KIAA1807。推导的 702 个氨基酸蛋白与人类锌指蛋白 BR140（BRPF1; 602410） 具有显着相似性。 RT-PCR ELISA 在整个成人大脑中检测到非常高的表达，在所有其他检查组织（包括所有测试的特定大脑区域）中检测到中等表达。

Zhou 等人使用 VHL（608537） 作为诱饵，对成人肾脏 cDNA 文库进行酵母 2 杂交筛选（2002） 克隆了 PHF17，他们将其称为 JADE1。推导的 509 个氨基酸蛋白质的计算分子量为 58.4 kD。它在 N 末端附近有一个 PEST 结构域、2 个中心植物同源结构域（PHD） 以及 N-糖基化、肉豆蔻酰化和丝氨酸或苏氨酸磷酸化的候选位点。 Northern印迹分析检测到6.0和3.6 kb的转录物在肾脏中高表达，其次是在胰腺和骨骼肌中中等表达，并且在所有其他检查组织中低表达。 Western blot分析检测人和小鼠Jade1分别为64和61 kD，在小鼠和人肾脏中高表达，在人胰腺、肝脏、心脏和小鼠肝脏中中等表达，在人脑中无表达。小鼠肾皮质和培养细胞的蛋白质印迹分析显示近端肾小管细胞中有显着的表达。内源性 JADE1 定位于人肾癌细胞中显着的核斑点和弥漫的细胞质斑点。

通过数据库和基因组序列分析，Tzouanacou 等人（2003） 鉴定了小鼠和人类 JADE1 的几种剪接变体，它们编码至少 2 种蛋白质亚型：JADE1L 和 JADE1S。 JADE1L 可能对应于 Zhou 等人报道的 6.0-kb 转录本（2002）。推导的 842 个氨基酸的 JADE1L 蛋白具有 N 端 PEST 基序，随后是 2 个 PHD 锌指结构域、二分核定位信号和 C 端 PEST 基序。 JADE1S 对应于 Zhou 等人克隆的 JADE1 转录本（2002）。推导的 510 个氨基酸的 JADE1S 蛋白缺乏 JADE1L 的核定位信号和 C 端 PEST 基序。 Jade1在小鼠原条和尾芽以及含有多能或组织特异性祖细胞的其他胚胎区域中表达，包括早期原肠胚形成外胚层和大脑皮层的心室区。 Jade1 也在发育中的肌肉组织和胚胎外组织中表达。

▼ 基因功能

通过酵母 2-杂交和内源性和共转染蛋白的免疫沉淀分析，Zhou 等人（2002） 表明 VHL 强烈且选择性地与 JADE1 结合。对截短蛋白之间结合的分析表明，JADE1 的 N 末端和 PHD 间区域对于与 VHL 的相互作用非常重要。 VHL 主要通过延长 JADE1 蛋白半衰期来增加 JADE1 的丰度。

Panchenko 等人使用报告基因构建体（2004）表明JADE1可以激活转录并且PHD锌指的缺失消除了转录活性。 JADE1 还以剂量依赖性方式促进组蛋白 H4（参见 602822）而非组蛋白 H3（参见 602810）乙酰化，并且乙酰化需要 PHD。缺乏第二个 PHD 的 JADE1 突变体表现为显性失活方式。 TIP60（HTATIP; 601409） 是一种具有组蛋白 H4/H2A 特异性的组蛋白乙酰转移酶，与 JADE1 物理相关并增强了 JADE1 乙酰转移酶功能。

周等人（2005） 发现 JADE1 的表达在所有测试的人肾癌细胞系中都非常低，并且与 VHL 表达无关。蛋白酶体活性的抑制增加了 JADE1 蛋白的表达。 JADE1 抑制裸鼠肾癌细胞生长、集落形成和肿瘤形成，并减少 3 维培养物中肾细胞生长的分支。 JADE1 增加细胞凋亡并降低抗细胞凋亡 BCL2（151430） 的水平，反义 JADE1 增加细胞生长速率。周等人（2005） 得出结论，JADE1 是增殖的促凋亡屏障。

▼ 基因结构

佐瓦纳库等人（2003） 确定小鼠 Phf17 基因包含 13 个外显子，其中包括 3 个替代非编码第一外显子。他们表示，人类PHF17基因具有相似的结构。

▼ 测绘

国际辐射混合测绘联盟将 PHF17 基因定位到 4 号染色体（SHGC-67603）。

▼ 动物模型

佐瓦纳库等人（2003） 发现 Jade1 缺失的小鼠胚胎是有活力和可生育的，并且与其野生型或杂合子同窝小鼠相比没有表现出明显的异常。然而，断奶时 Jade1 缺失的动物的孟德尔比率低于预期。