核 RNA 输出因子 5; NXF5

HGNC 批准的基因符号:NXF5

细胞遗传学位置:Xq22.1 基因组坐标(GRCh38):X:101,832,111-101,857,576(来自 NCBI)

▼ 克隆与表达

mRNA 从细胞核中输出涉及多种蛋白质,包括核孔蛋白、RNA 结合蛋白、RNA 解旋酶(DDX19;605812) 和核孔复合体相关蛋白,例如 NXF1(602647)。 Herold 等人通过在 EST 数据库中搜索 NXF1 同源物并通过 RT-PCR 分析(2000) 获得了编码 NXF2(300315)、NXF3(300316)、NXF4(300318) 和 NXF5 的 cDNA。 推导的 626 个氨基酸的 NXF5 蛋白具有 NXF1 的保守结构域结构,包括一个非规范的 RNP 型 RNA 结合结构域(RBD)、4 个富含亮氨酸的重复序列(LRR)、一个核转运因子 2(NTF2; 605813) 样结构域,允许与 NTF2 相关输出蛋白 1(NXT1; 605811) 异二聚化,以及一个泛素-介导与核孔蛋白相互作用的相关结构域。

Esposito 等人使用 RT-PCR(2013) 发现 3 种 NXF5 同工型在多个人体组织中存在差异表达,包括脑、胰腺、肾、睾丸、卵巢和肺。 心脏中表达低,肌肉中无表达。 小鼠 Nxf7 基因是人类 NXF5 的同源物,在多种小鼠组织中发现,包括心脏、肾脏足细胞、皮质、白质和纹状体。

▼ 基因结构

赫罗德等人(2000) 确定 NXF5 基因至少包含 21 个外显子。

▼ 测绘

Herold 等人使用基因组序列分析(2000) 将 NXF5 基因定位到 X 染色体。

▼ 分子遗传学

请参阅 300319.0001 了解局灶节段性肾小球硬化症(请参阅 603278)与 NXF5 基因突变的可能关联。

▼ 等位基因变异体(1 个选定示例):

.0001 意义不明的变体
NXF5、ARG113TRP
该变异被归类为意义不明的变异,因为其对局灶节段性肾小球硬化症(FSGS;见 603278)的贡献尚未得到证实。

埃斯波西托等人(2013) 报道了一个澳大利亚 6 代大家庭,其中 12 名男性患有局灶节段性肾小球硬化症,导致进行性肾衰竭。 尽管一些携带者女性患有蛋白尿或先兆子痫,但该模式与 X 连锁隐性遗传一致。 患有 FSGS 的 6 名男性还患有进行性心脏传导障碍,其中 5 名患者需要安装起搏器。 FSGS 连锁分析确定了 DXS8077 和 DXS8064 之间染色体 Xq21.33-q24 上的 21.19-cM 候选疾病区间(DXS1106 的对数值为 3.32)。 对 2 名受影响男性的全外显子组测序鉴定出 2 个不同基因中的 2 个变异:NXF5 基因外显子 7 中的 c.337C-T 转换,导致保守残基处的 arg113 到 trp(R113W) 取代,以及 ALG13 基因(300776.0003) 中的变异。 在 1000 个基因组计划数据库、6 个内部对照外显子组或 598 条对照染色体中均未发现这些变异,桑格测序显示这两种变异均与该家族中的疾病分离。 两种变体都具有相同的单倍型。 在男性和女性突变携带者的细胞中均检测到突变型 NXF5 mRNA。 体外功能表达研究表明,野生型R113蛋白定位于细胞核和细胞质,包括细胞过程中,并且与W113突变蛋白相比表现出更高水平的表达。 突变蛋白主要定位于核膜,表明突变可能影响蛋白的稳定性和定位。 当用野生型或突变蛋白转染时,细胞的肌节蛋白组织没有表现出差异。