SUMO相互作用基序含蛋白 1; SIMC1

用于抑制自溶降解的平台元件; PLIAD

HGNC 批准的基因符号:SIMC1

细胞遗传学位置:5q35.2 基因组坐标(GRCh38):5:176,238,424-176,345,989(来自 NCBI)

▼ 克隆与表达

通过计算分析寻找具有小型泛素样修饰剂(SUMO) 相互作用基序(SIM) 的蛋白质,Sun 和 Hunter(2012) 将人类 SIMC1 鉴定为包含 2 个簇状 SIM 的蛋白质。他们将 SIMC1、(26)FIDLT(30) 和(45)VIDLT(49) 的 SIM 分别指定为 SIM1 和 SIM2。

Ono 等人通过液相色谱和串联质谱鉴定与 CAPN3(114240) 相互作用的蛋白质(2013) 鉴定了 C5ORF25,他们将其命名为 PLEIAD。在转染的鸡骨骼肌管中,大多数细胞显示 SIMC1 在细胞质中弥散分布,尽管 PLEIAD 在肌节 I 带内以条纹图案定位于少数细胞中。

▼ 基因功能

Sun 和 Hunter(2012) 在 293T 细胞中使用 SIMC1 和 SIMC1 突变体的 GST 融合蛋白进行体外 GST Pull-down 测定,结果表明 SIMC1 包含一个 N 末端 SUMO 结合域,其中包含 2 个 VIDLT 型 SIM,并且两个 SIM1 SIM2 和 SIM2 的贡献相等且共同对于 SUMO 绑定至关重要。

在对共表达 CAPN3 和 PLEIAD 的 COS7 细胞的分析中,Ono 等人(2013) 发现 PLEIAD 与 CAPN3 相互作用并抑制其蛋白酶活性。进一步分析证实PLEIAD的C端序列保留了CAPN3抑制活性。数据库中的同源性搜索揭示了 PLEIAD 脊椎动物同源物的 C 端部分(而非 N 端)的显着保守性,表明 PLEIAD 的 C 端区域对 CAPN3 的调节。酵母 2 杂交筛选显示 PLEIAD 通过其 N 端区域与 C 端结合蛋白-1(CTBP1;602618) 相互作用。进一步分析表明,CTBP1 是 CAPN3 和其他常规钙蛋白酶的蛋白水解底物,这表明 PLEIAD 是一种支架,具有至少 2 个由分子不同区域介导的功能:N 端区域招募 CAPN3 的底物 CTBP1,并且C 末端区域参与抑制 CAPN3 的蛋白酶活性。

▼ 基因结构

小野等人(2013)发现人类PLEIAD基因由12个外显子组成,其中外显子3编码规范的第一个蛋氨酸。使用人类骨骼肌 cDNA 文库的 PCR 分析还鉴定了缺少外显子 2 和 3 的 PLEIAD 变体。 小鼠 Pleiad 直向同源物的结构与人类 PLEIAD 的不同之处在于,对应于人类外显子 2 和 3 的外显子在小鼠中不可识别,对应于人类外显子4的外显子2被扩展。

▼ 测绘

Sun 和 Hunter(2012) 报道人类 C5ORF25(SIMC1) 对应到染色体 5。

Gross(2018) 根据 SIMC1 序列(GenBank BC032390) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 SIMC1 基因对应到染色体 5q35.2。

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