T细胞白血病,同源基因1; TLX1
同源基因11; HOX11
T 细胞白血病 3 基因; TCL3
HGNC 批准的基因符号:TLX1
细胞遗传学位置:10q24.31 基因组坐标(GRCh38):10:101,131,300-101,137,789(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
高达 7% 的儿童 T 细胞急性淋巴细胞白血病(T-ALL) 伴有涉及 10q24 作为断点的易位,即 t(10;14)(q24;q11) 或 t(7;10)(q35; q24)。与 10q24 区域相邻的基因在易位到染色体 14q11 处的 TCRD(参见 186810)或染色体 7q35 处的 TCRB(参见 186930)附近后被转录激活(参见细胞遗传学)。肯尼迪等人(1991) 从携带易位 t(7;10)(q35;q24) 的 T-ALL 细胞系中克隆了 HOX11,该基因邻近染色体 10q24 上的断点。推导的 342 个氨基酸蛋白具有 N 末端富含甘氨酸和脯氨酸的结构域,后面是假定的 DNA 结合同源基因结构域。 Northern blot分析在T细胞系中检测到约2.3 kb的HOX11转录物,在神经母细胞瘤和小细胞肺癌细胞系中低表达。
亲爱的等人(1993) 发现人类 HOX11 及其在其他物种中的直向同源物在同源结构域的螺旋-3 中具有苏氨酸,而不是在其他 HOX 蛋白中发现的更常见的异亮氨酸或缬氨酸。使用免疫荧光显微镜,他们发现带有表位标记的人 HOX11 定位于转染的 COS 细胞的细胞核。
罗伯茨等人(1994) 分离了小鼠 Hox11 基因组克隆,发现同源结构域与人类 HOX11 具有完整的氨基酸同一性。
▼ 基因结构
肯尼迪等人(1991) 确定 TLX1 基因至少包含 3 个跨度为 7 kb 的编码外显子。选择性剪接可能会在 5 素外显子中引入一个小内含子。
格林等人(2007) 以头对头方向鉴定了 TLX1 转录起始位点上游 161 bp 的 TD1 基因(612734)。 TD1 和 TLX1 之间的基因间区域在 小鼠和人类之间高度保守,包含许多 GC 框和嵌入 CpG 岛内的位于中心的 CCAAT 框。它没有明显的 TATA 框子。报告基因检测表明,基因间区域对于 TD1 和 TLX1 的表达具有强大的双向启动子活性。
▼ 测绘
TLX1 基因定位于染色体 10q24(Kennedy 等,1991)。罗伯茨等人(1994) 将小鼠 Hox11 基因对应到小鼠染色体 19 内的同线性区域。
Gough 等人使用 FISH、BAC 末端测序和基因组数据库分析(2003) 确定染色体 10q24 上选定基因从着丝粒到端粒的顺序是 CYP2C9(601130)、PAX2(167409)、HOX11 和 NFKB2(164012)。
▼ 基因功能
卢等人(1991) 发现 TCL3 的表达在含有 t(10;14) 易位的白血病细胞中升高。
亲爱的等人(1993) 表明人类 HOX11 通过 TAATGG 靶序列激活报告基因的转录。 HOX11的同源结构域还结合了序列TAAC和TAAT,表明TAAC也可能是HOX11的识别序列。
德克尔马克等人(2010) 在所检查的 16% 的人类 T-ALL 中发现了 BCL11B(606558) 突变和缺失,这与他们在 TLX1 诱导的 T-ALL 小鼠模型中的发现一致(参见动物模型)。人 T-ALL 系的染色质免疫沉淀分析表明 TLX1 与 BCL11B 启动子结合。
▼ 细胞遗传学
卡根等人(1987) 将携带 t(10;14)(q24;q11) 易位的人类白血病 T 细胞与小鼠白血病 T 细胞融合,并检查了杂交体中人类染色体 10 和 14 的遗传标记。含有人类 10q+ 染色体的杂交体具有人类末端脱氧核苷酸转移酶基因(TDT; 187410) 已被定位到 10q23-q25,以及 TCR-α 恒定区(TRAC; 186880)。含有人类 14q-染色体的杂交体保留了 TCR-α 的可变成分(参见 615442)。因此,14q11 断点将 TCR-α 基因座分裂在可变基因和恒定基因之间的区域。这些结果表明,白血病过程是由 C(α) 基因座易位到位于 10q24 断点附近的假定细胞原癌基因引起的,导致所述癌基因的失调,他们为此命名为 TCL3。由于 10q+ 染色体保留了 TDT 基因,因此他们得出结论,TDT 基因座最接近 TCL3 基因,从而确认了 10q23-q24 条带的位置。
祖特等人(1990) 从 CD3 阴性 T-ALL 细胞中克隆了 t(10;14) 断点。他们在 10q24 确定了一个与 TDT 不同的位点;该位点在多种正常或其他肿瘤性 T 细胞中不活跃,但在 t(10;14) T 细胞白血病中识别丰富的 2.9-kb RNA。作者推测该基因座是假定的 TCL3 原癌基因的候选基因座。
肯尼迪等人(1991) 在 T-ALL 中鉴定出邻近染色体 10q24 断点的 HOX11 基因。他们表明,在携带易位 t(7;10)(q35;q24) 的 T 细胞系中,HOX11 基因的编码能力未受到干扰。波多野等人(1991) 还鉴定了 T-ALL t(10;14) 易位中 10q24 断点附近的 HOX11 基因。
杜贝等人(1991) 指出 HOX11 基因与 T-ALL 中发生的 t(10;14)(q24;q11) 易位有关。这种易位可能是由通常参与免疫球蛋白和 TCR 多样性生成的重组酶催化的。杜贝等人(1991)表明,这是人类癌症的第一个例子,其中未改变的同源基因的表达失调参与了肿瘤发生。
克莱佩等人(2010) 描述了人类 T-ALL 中 PTPN2(176887) 局灶性缺失的鉴定。 PTPN2 缺失特别发现于 TLX1 转录因子癌基因异常表达的 T-ALL 中,其中 4 例还表达 NUP214-ABL1 酪氨酸激酶(114350)。 PTPN2 的敲低增加了 T-ALL 细胞的增殖和细胞因子敏感性。此外,PTPN2 被确定为 NUP214-ABL1 激酶活性的负调节因子。克莱佩等人(2010) 得出的结论是,他们的研究为 PTPN2 的肿瘤抑制作用提供了遗传和功能证据,并表明 PTPN2 的表达可能调节对治疗的反应。
▼ 动物模型
HOX11是一个孤儿同源基因,因为它位于4个哺乳动物HOX簇之外的位点。虽然正统的 HOX 基因编码沿胚胎前后轴的位置规范组合系统,但孤儿同源基因的功能尚不清楚。正如易位 t(10;14) 中的发现所示,HOX11 与 T 细胞受体基因的并置将正常 HOX11 产物的表达重定向至胸腺细胞。 HOX11 被重定向至胸腺的转基因小鼠会出现 T 细胞淋巴母细胞淋巴瘤-白血病。为了评估 Hox11 在小鼠中的功能作用,Roberts 等人(1994) 通过基因靶向产生了 Hox11 缺陷小鼠。纯合缺陷小鼠没有脾脏,但其他方面表现正常。 Hox11 通常在内脏中胚层产生的内脏原基中表达。纯合缺陷胚胎在内脏发育部位没有细胞组织,但所有其他内脏衍生物均正常发育。罗伯茨等人(1994) 得出结论,Hox11 控制单个器官的发生;他们的发现为形态发生的遗传调控提供了新的见解。
亲爱的等人(1995) 在“敲除”中进行了类似的研究;研究发现,在纯合 Hox11 缺失胚胎中,脾脏形成正常开始到胚胎发生的特定阶段,此时脾原基经历快速且完全的吸收。死亡的脾细胞表现出凋亡的特征。作者得出的结论是,Hox11 不是启动脾脏发育所必需的,但对于器官发生过程中脾脏前体的存活至关重要。
Wellik 和 Capecchi(2003) 培育出 Hox10(142993) 和/或 Hox11 旁系同源组的所有成员均被破坏的小鼠,并表明这些基因是中轴骨骼腰骶区的全局调节因子,并且是主要肢体元素模式中不可或缺的一部分。在缺乏 Hox10 功能的情况下,不会形成腰椎。相反,肋骨从所有后椎骨突出,从最后一块胸椎向尾部延伸到骶骨区域之外。在缺乏 Hox11 功能的情况下,骶椎不会形成,而是这些椎骨呈现腰椎特征。这些旁系同源家族成员之间的冗余度非常大,以至于在 6 个旁系同源等位基因中的 5 个发生突变的小鼠中,Hox 模式的这种全局方面并不明显。
Cheng 等人使用 Tlx3(604640)-null、Tlx1-null 和复合 Tlx1/3-null 小鼠(2004) 发现 Tlx3 和 Tlx1 作为选择基因,促进脊髓背角浅表层状神经元中兴奋性谷氨酸能相对于抑制性 GABA 能的分化。在发育中的鸡脊髓(胚胎第 5 天)中,异位 Tlx3 表达足以抑制内源性 GABA 能分化并诱导谷氨酸能细胞的形成,从而改变细胞命运。程等人(2004) 认为 Tlx3 缺陷小鼠的中枢呼吸控制缺陷可能是由于过量的抑制性 GABA 突触输入造成的。作者指出,Tlx1 和 Tlx3 在小鼠前脑中不表达,这表明谷氨酸能和 GABA 能递质表型受到中枢神经系统中区域特异性基因的调节。
De Keersmaecker 等人使用在 T 细胞祖细胞中条件性转基因表达人 TLX1 的小鼠(2010) 生成了 TLX1 诱导的 T-ALL 的小鼠模型。阵列比较基因组杂交和序列分析发现了 Notch1(190198) 的突变,并且在近一半的 TLX1 诱导肿瘤中发现了 Bcl11b 的突变或缺失。光谱核型、阵列比较基因组杂交和微阵列分析显示小鼠 TLX1 诱导的肿瘤中存在非整倍性以及 Chek1(603078) 和其他有丝分裂控制基因的下调。德克尔马克等人(2010) 得出结论,TLX1 易位会导致未转化的原白血病胸腺细胞有丝分裂检查点的丢失、染色体错误分离以及肿瘤发展早期阶段的非整倍性。