N-末端 X-PRO-LYS N-甲基转移酶 1; NTMT1
甲基转移酶样 11A; METTL11A
N 末端 RCC1 甲基转移酶; NRMT
RCC1 甲基转移酶,N 端
C9ORF32
HGNC 批准的基因符号:NTMT1
细胞遗传学位置:9q34.11 基因组坐标(GRCh38):9:129,608,872-129,636,135(来自 NCBI)
▼ 说明
METTL11A 基因编码染色体缩合 1(RCC1; 179710) 的 RAN(601179) 鸟嘌呤核苷酸交换因子调节因子的 N 末端甲基转移酶。 METTL11A 酶可 α-N-甲基化其他蛋白质靶标,例如 SET(600960) 和 RB1(614041)。
▼ 克隆与表达
沙纳·图利等人(2010) 使用免疫分析和质谱纯化了 RCC1 N 末端甲基转移酶(NRMT,也称为 METTL11A)。 NRMT 编码甲基转移酶 11 家族中的 25 kD 蛋白质,该家族的大多数成员可甲基化代谢物或其他小分子。 NRMT 缺乏 SET 结构域,但具有类似 Rossman 的 α/β 折叠。它在整个真核进化过程中一直被保守。沙纳·图利等人(2010)指出,根据全基因组表达数据库,它在正常组织中普遍表达,并且在胃肠道癌症中强烈过度表达。
▼ 基因功能
沙纳·图利等人(2010) 使用体内甲基化测定证实 NRMT 是真正的 RCC1 α-N-甲基转移酶。 NRMT 的敲除再现了甲基化缺陷型 RCC1 突变体中所见的多纺锤体表型,证明了 α-N-甲基化对于正常双极纺锤体形成和染色体分离的重要性。在 Schaner Tooley 等人报告时(2010),RAN 鸟嘌呤核苷酸交换因子 RCC1(179710) 是唯一已鉴定出 α-N-甲基化生物学功能的蛋白质。 RCC1 甲基化缺陷突变体与 DNA 的亲和力降低并导致有丝分裂缺陷。
所有真菌和动物 N 端甲基化蛋白均含有独特的 N 端基序,met-(ala/pro/ser)-pro-lys,表明它们可能是同一酶的靶标。起始甲硫氨酸被裂解,暴露的 α-氨基被单甲基化、二甲基化或三甲基化。 Schaner Tooley 等人使用 met-(ala/ser/pro)-pro-lys(2010) 在 GenBank 中搜索 NRMT 的候选底物。超过 35 个带注释的基因包含此 N 末端基序。沙纳·图利等人(2010)确认了NRMT的6个靶基因,包括RCC1、SET(600960)、核糖体蛋白L23A(602326)、肌球蛋白轻链多肽-3(160790)、肌球蛋白轻链多肽-2(160781)和kelch样蛋白- 31(610749)。
▼ 生化特征
沙纳·图利等人(2010) 指出,结构基因组学联盟以 1.75 埃的分辨率解析了 NRMT 与 S-腺苷高半胱氨酸(SAH) 复合物的晶体结构。 SAH 结合位点对面的大空腔可以容纳 N 端肽,并包含类似于染色结构域中的芳香残基排列。 Schaner Tooley 等人使用计算机生成的假定活性位点 RCC1 N 端肽模型(2010) 发现只有前 3 个残基(ser-pro-lys) 与 NRMT 相互作用。最佳构象将底物 α-NH2 定位在靠近 SAH 的位置,以正确的甲基转移方向,距离硫原子 3.6 埃以内。肽 lys4 侧链与活性位点边缘的酸性残基形成氢键和静电相互作用。
▼ 测绘
Gross(2014) 根据 NTMT1 序列(GenBank BC033234) 与基因组序列(GRCh37) 的比对,将 NTMT1 基因对应到染色体 9q34.11。