系统性红斑狼疮,易感性,10; SLEB10

有证据表明 IRF5 基因(607218) 的变异会影响系统性红斑狼疮的易感性。

有关系统性红斑狼疮(SLE) 的表型描述和遗传异质性的讨论,请参阅 152700。

▼ 测绘

系统性红斑狼疮是一种由遗传和环境因素共同引起的复杂的系统性自身免疫性疾病。I 型干扰素(IFN) 的产生增加和 IFN 诱导基因的表达在 SLE 中常见,并且可能是该疾病的分子发病机制的关键。西于尔兹森等人(2005) 分析了 679 名瑞典、芬兰和冰岛 SLE 患者、798 名未受影响的家庭成员和 438 名无关对照个体的 I 型 IFN 通路的 13 个基因中的 44 个 SNP,以了解与 SLE 的联合联系和关联。作者鉴定了 IRF5 中的 SNP(例如 rs2004640、607218.0002),这些 SNP 在与 SLE 连锁和关联的联合分析中显示出强信号。

格雷厄姆等人(2006) 通过基于家庭的传递不平衡测试分析,在 4 个孤立的病例对照队列中复制了 rs2004640 的 T 等位基因的关联,并且还研究了与 IRF5 表达升高相关的孤立顺式作用变异(rs2280714)(Morley 等人) ., 2004) 并连接到外显子 1B 剪接位点。携带顺式作用变体且缺乏外显子 1B 供体位点的单倍型不会带来 SLE 风险。因此,驱动 IRF5 多种独特亚型表达升高的常见 IRF5 单倍型是 SLE 的重要遗传风险因素。

坎宁安·格雷厄姆等人(2007) 在 380 个英国 SLE 核心家族中鉴定出 2 个过度遗传的 IRF5 单倍型和一个单一的低遗传单倍型;参见 607218.0003。

西于尔兹森等人(2008) 对 485 名瑞典 SLE 患者和 563 名对照者的 IRF5 基因中的 47 个多态性进行了基因分型,发现即使在 Bonferroni 校正后,其中 18 个也显示出显着关联,其中关联特别强(p = 4.6 x 10(-9);OR, 1.69)双等位 CGGGG 插入缺失启动子多态性(607218.0001)。以 CGGGG 插入缺失为条件的逻辑回归分析消除了来自 10 个 SNP 的关联信号,其中包括 2 个先前认为具有功能的 SNP(rs2004640 和 rs10954213;分别参见 607218.0002 和 607218.0003)。以另一个强相关的 SNP rs10488631(p = 9.4 x 10(-10);OR,2.07)为条件,消除了来自其他 2 个 SNP 的关联信号,并且使用 CGGGG indel 和 rs10488631 一起进行条件分析,消除了来自所有标记的关联信号IRF5基因。以 CGGGG 或 rs10488631 为条件的逻辑回归分析表明,它们与 SLE 孤立相关。

为了确定 SLE 易感性的风险位点,Gateva 等人(2009) 在一项全基因组研究中,从 2,466 个区域中选择了与 SLE 相关的名义证据(P 小于 0.05)的 SNP,并在 1,963 个病例和 4,329 个对照的孤立样本中对它们进行了基因分型。盖特瓦等人(2009) 显示与 rs2070197 处的 IRF5 基因相关(组合 P 值 = 5.8 x 10(-24),比值比 = 1.88,95% 置信区间 = 1.78-1.95)。

韩等人(2009) 使用 Illumina-Human610-Quad BeadChips 对 1,047 例病例和 1,205 名对照进行基因分型,并在另外 2 个队列(3,152 例病例和 7,050 名对照)中复制 78 个 SNP,对中国汉族人群进行了全基因组关联研究。韩等人(2009) 发现 rs4728142 与 IRF5 基因相关(组合 P 值 = 8.14 x 10(-19),比值比 = 1.43,95% 置信区间 1.32-1.54)。

▼ 群体遗传学

墨西哥的系统性红斑狼疮患者似乎比欧洲人患有更严重的疾病和更低的发病年龄,并且疾病活动发作、肾脏表现和器官损伤的频率更高。Reddy 等人在墨西哥 SLE 患者中(2007) 发现 IRF5 基因中 3 个不同的 SNP 与疾病存在显着关联。最强的关联是 rs2070197(607218.0004) 的等位基因 C,它标记了风险单倍型。健康墨西哥混血个体中风险单倍型的频率(0.201) 显着高于具有欧洲血统的健康个体(0.09);健康的墨西哥印第安人群体的频率甚至更高(0.31)。此外,在墨西哥 SLE 患者中发现风险单倍型及其个体纯合性的频率要高得多。墨西哥印第安人(Mazateco) 中 rs2070197 的 C 等位基因的高频率表明,墨西哥人的印度遗传背景显然导致了墨西哥混血儿中风险单倍型的高频率。风险单倍型的纯合性频率较低(混血对照中为 4%,健康马扎特科斯中为 6.5%)导致 Reddy 等人(2007) 假设风险单倍型纯合的个体将患上 SLE。

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