富含亮氨酸重复序列和免疫球蛋白样结构域的蛋白质 2;LRIG2

LIG2
KIAA0806

HGNC 批准的基因符号:LRIG2

细胞遗传学定位:1p13.2 基因组坐标(GRCh38):1:113,073,198-113,132,260(来自 NCBI)

▼ 克隆与表达

Nagase 等人(1998)通过对从尺寸分级的人脑 cDNA 文库中获得的克隆进行测序,克隆了 LRIG2,并将其命名为 KIAA0806。推导的蛋白质含有1,065个氨基酸。RT-PCR ELISA 检测到脑中表达最高,而除脾脏外的所有其他检查组织中表达中等,脾脏几乎没有表达或没有表达。

Holmlund et al.(2004)从人脑cDNA文库中克隆了LRIG2。推导的蛋白质含有信号肽;15 个串联富含亮氨酸重复序列,具有富含半胱氨酸的 N 和 C 侧翼结构域;3个C2型免疫球蛋白样结构域;跨膜结构域;和细胞质尾。LRIG2与LRIG1(608868)有47%的氨基酸同一性。Northern 印迹分析在心脏中检测到 4.6-kb LRIG2 转录物,在所有其他分析组织中检测到 4.8-kb 转录物。定量RT-PCR检测到皮肤中的表达最高,膀胱中的表达最低。蛋白质印迹分析在胃、前列腺、肺和胎脑以及转染的 COS-7 细胞中检测到表观分子量为 132 kD 的 LRIG2。N-糖苷酶处理将表观分子量降低至 107 kD。细胞表面生物素化和共焦荧光激光显微镜证明转染的 COS-7 细胞的细胞表面和细胞质中均表达 LRIG2。

郭等人(2004)克隆了小鼠Lrig2。推导的小鼠蛋白与人LRIG2具有87.1%的氨基酸一致性。人和小鼠 LRIG2 在细胞外、跨膜和近膜序列中与 LRIG1 和 LRIG3(608870)具有最高的保守性。定量 PCR 检测到人 LRIG2 普遍存在但存在变异,其中在子宫中表达最高,在膀胱中表达最低。几个小鼠组织的定量PCR显示普遍存在表达,但表达模式与人体组织不同。

▼ 基因结构

Holmlund et al.(2004)确定LRIG2基因包含19个外显子,跨度至少50 kb。

▼ 测绘

Holmlund et al.(2004)通过FISH将LRIG2基因定位到染色体1p13。Guo et al.(2004)将小鼠Lrig2基因定位到染色体3F2+2的一个区域,该区域与人类染色体1p13显示同线性。

▼ 分子遗传学

在来自土耳其近亲家庭的受影响同胞中,患有尿面综合征,对应到染色体 1p13.2(UFS2;615112),Stuart et al.(2013)进行了外显子组测序,并鉴定了LRIG2基因(608869.0001)中1-bp缺失的纯合性;该突变在家族中随疾病分离,并且在 variome 数据库、116 个本地外显子组或 94 个土耳其对照中未发现。在第二个土耳其 UFS 近亲家庭中,两个受影响的姐妹是 LRIG2(R709X;R709X;608869.0002)。此外,西班牙非近亲家庭的一名UFS女孩,经外显子组和桑格测序发现,LRIG2(608869.0003-608869.0004)缺失和插入突变为复合杂合子。

▼ 等位基因变异体(4个精选例子):

.0001 尿面综合征2

LRIG2,1-BP DEL,1230A

一名8岁土耳其女孩患有尿面综合征(UFS2;615112),Stuart et al.(2013)鉴定出LRIG2基因外显子10中1-bp缺失(c.1230delA)的纯合性,导致预计会导致提前终止的移码(Glu140AspfsTer6)。该缺失得到了桑格测序的证实,并且在她无症状的 5 岁弟弟中也发现了纯合性,该弟弟仅表现出 UFS 的面部特征,并且通过超声和​​尿流测定显示尿路正常。该突变以杂合性存在于未受影响的表亲父母中,并且在 variome 数据库、116 个本地外显子组或 94 个土耳其对照中未发现。

.0002 尿面综合征2

LRIG2、ARG709TER

土耳其近亲家庭的 2 姐妹患有尿面综合征(UFS2;615112),Stuart et al.(2013)鉴定了LRIG2基因外显子15中c.2125C-T转变的纯合性,导致arg709到ter(R709X)的取代。该突变以杂合性形式存在于未受影响的父母中,并且在 variome 数据库、116 个本地外显子组或 94 个土耳其对照中未发现。

.0003 尿面综合征2

LRIG2,1-BP DEL,2088C

一名患有尿面综合征的 5 岁西班牙女孩(UFS2;615112),Stuart et al.(2013)鉴定出LRIG2基因外显子15中1-bp缺失(c.2088delC)的复合杂合性,导致预计会导致提前终止的移码(Ser697HisfsTer11),以及371-bp在外显子 14 中插入(c.1980_1981ins371),导致转录物跳过外显子 14,并且不会受到无义介导的衰变(根据淋巴细胞 cDNA 测序确定)。她未受影响的父母都是其中一种突变的杂合子。

.0004 尿面综合征2

LRIG2、371-BP INS、NT1980

讨论在尿面综合征(UFS2;UFS2;Stuart 等人(2013),参见 615112),参见 608869.0003。

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