含环指和 SPRY 结构域的蛋白质 1; RSPRY1
KIAA1972
HGNC 批准的基因符号:RSPRY1
细胞遗传学定位:16q13 基因组坐标(GRCh38):16:57,186,152-57,240,469(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
Nagase 等人通过对从尺寸分级的胎儿脑 cDNA 文库中获得的克隆进行测序(2001)克隆了RSPRY1,他们将其命名为KIAA1972。推导的 576 个氨基酸的蛋白质具有 SPRY 结构域和推定的 C3HC4 型锌指结构域,表明该蛋白质具有核酸管理功能。RT-PCR ELISA 检测到 KIAA1972 在肝脏、肾脏、睾丸、卵巢和脾脏中表达最高,在脊髓和胎儿肝脏中表达中等,在所有其他检查组织(包括成人和胎儿大脑)中表达较低。在特定的成人大脑区域中,在黑质中检测到最高表达。
法登等人(2015) 通过原位杂交、RT-PCR 和免疫组织化学检查了妊娠中晚期小鼠胚胎和新生儿中 Rspry1 转录本的表达和编码蛋白的定位。Rspry1 转录物和编码的蛋白质早在胚胎日(E) 12.5 就在完整小鼠肢芽间充质中表达和定位。在 E18.5,与小鼠的初级骨化同时发生,Rspry1 蛋白在大多数发育中的软骨内骨和骨骼肌以及发育中的心脏、肾脏和大脑中大量检测到。在 E18.5 前肢中,在肱骨、尺骨、桡骨、腕骨和掌骨中检测到 Rspry1。在 E18.5 后肢的骨骼中也检测到了 Rspry1,包括股骨、胫骨、腓骨、跗骨和跖骨。在这些骨骼内的成骨细胞和骨细胞中检测到强烈的定位,而在软骨细胞中检测到最小的定位。Rspry1 骨定位的第二个显着位点是软骨膜和骨膜,其中最内细胞层的水平最高。在胚胎和出生后大脑以及发育中的颅面组织中也检测到表达。
瓦德尔等人(2016) 从 C2C12 成肌细胞中克隆了小鼠 Rspry1。推导的 576 个氨基酸蛋白质的计算分子量为 64 kD。Rspry1 在其 C 末端包含一个 SPRY 结构域,后跟一个 C3HC4 型环指结构域。人RSPRY1蛋白与小鼠和大鼠Rspry1具有97%的氨基酸一致性,并且具有相似的结构。Western blot 分析检测到分化 C2C12 细胞中的 Rspry1 蛋白。荧光标记的 Rspry1 定位于转染的 C2C12 细胞的细胞质。
▼ 基因结构
瓦德尔等人(2016) 确定老鼠 Rspry1 基因包含 14 个编码外显子和 1 个非编码外显子。Rspry1 基因的 5-prime 侧翼区与 Fam192a 基因(617766) 共享一个 230 bp 的调控区,并且该调控区在大鼠和人类中是保守的。对小鼠、大鼠和人类调节区的基因组序列分析揭示了一个推定的E框序列、2个推定的AP2(参见107580)共有序列、一个推定的CCAAT框和2个推定的GC框。
▼ 测绘
Hartz(2015) 根据 RSPRY1 序列(GenBank AB075852) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 RSPRY1 基因对应到染色体 16q13。
瓦德尔等人(2016) 将 Rspry1 基因对应到小鼠染色体 8。它的转录方向与 Fam192a 基因相反,与 Fam192a 基因共享一个 5 素调控区,这种排列在人类中是保守的。
▼ 基因功能
Waddell 等人使用微阵列分析(2016) 发现在去神经诱导的骨骼肌萎缩过程中小鼠肌肉组织中 Rspry1 的表达略有增加。Rspry1 近端调控区的 529 bp 片段驱动 C2C12 小鼠成肌细胞中的报告基因表达。Rspry1 调控区中 E 框的突变显着降低了 C2C12 细胞中报告基因的表达,而 Myod1(159970) 的过表达则增加了 C2C12 细胞和 HEK293T 细胞中报告基因的表达。
▼ 分子遗传学
Faden 等人在患有 Faden-Alkuraya 型脊椎骨干骺端发育不良(SEMDFA; 616723) 的沙特贝都因血缘家庭的受影响成员中(2015) 鉴定了 RSPRY1 基因(616585.0001) 中 1 bp 重复的纯合性。Faden 等人使用以基因为中心的“配对”系统(2015) 发现了一名受到类似影响的秘鲁男孩,他的 RSPRY1 错义突变(G41C; 616585.0002) 是纯合子。
▼ 等位基因变异体(2 个选定示例):
.0001 脊椎骨干骺端发育不良,FADEN-ALKURAYA 型
RSPRY1,1-BP DUP,1279A
Faden 等人在患有 Faden-Alkuraya 型脊椎骨干骺端发育不良(SEMDFA; 616723) 的沙特贝都因血缘家庭的受影响成员中(2015) 鉴定出 RSPRY1 基因中 1 bp 重复(c.1279dupA, NM_133368.1) 的纯合性,导致预计会导致提前终止的移码(Thr427AsnfsTer10)。该突变在家族中随疾病分离,在 650 个沙特对照外显子组或 ExAC 数据库中未发现。RT-PCR 显示,与对照组相比,患者血液中的 RSPRY1 转录物显着减少。
.0002 脊椎骨干骺端发育不良,FADEN-ALKURAYA 型
RSPRY1,GLY41CYS
Faden 等人在一名患有 Faden-Alkuraya 型脊椎骨干骺端发育不良(SEMDFA; 616723) 的 8 岁秘鲁男孩中(2015) 鉴定了 RSPRY1 基因中 c.121G-T 颠换(c.121G-T,NM_133368.1)的纯合性,导致保守残基处发生 gly41 至 cys(G41C) 取代。他的父母来自秘鲁一个偏僻的小地区,都是杂合突变,在内部外显子组数据库或 dbSNP、1000 基因组计划、NHLBI 外显子组计划或 ExAC 数据库中都没有发现这种突变。