信号蛋白 3C;SEMA3C
信号素E;SEME
HGNC 批准的基因符号:SEMA3C
细胞遗传学定位:7q21.11 基因组坐标(GRCh38):7:80,742,538-80,922,389(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
信号蛋白或塌陷蛋白构成一个家族,其特征是 N 末端存在保守的信号蛋白结构域(参见 601124)。鉴定负责非多药耐药性(MDR;参见171050)针对化疗药物顺铂(CDDP),Yamada等(1997)将CDDP耐药的人卵巢癌细胞cDNA表达文库导入CDDP敏感细胞中,并筛选出CDDP耐药的细胞。他们分离出编码预测蛋白的 cDNA,该蛋白与 semaphorin E 具有 93% 的氨基酸同源性。616 个氨基酸的人 semaphorin E 包含 15 个氨基酸的 N 端信号序列,后面是一个 semaphorin 结构域。信号蛋白 E cDNA 的体外转录产生了 70-kD 的蛋白质。作者表明,信号蛋白 E 由哺乳动物细胞分泌。通过 Northern 印迹分析,信号蛋白 E 在所有测试的人体组织中均表达为 5.2 kb 转录物。
Mangasser-Stephan 等人(1997)孤立地使用 mRNA 差异展示克隆了人信号蛋白 E cDNA,以鉴定类风湿性关节炎患者滑膜成纤维细胞中上调的 mRNA。
▼ 基因功能
Yamada et al.(1997)发现转染semaphorin E cDNA的CDDP敏感细胞获得了CDDP抗性。Semaphorin E 在 CDDP 耐药细胞系中过度表达,并由多种化疗药物以及 X 射线和紫外线照射诱导。在接受过广泛放化疗的患者体内切除的复发性鳞状细胞癌中,有 33% 通过免疫组织化学方法检测到异常的信号蛋白 E 蛋白表达。
Lepore等人(2006)在SEMA3C启动子区域鉴定了多个假定的GATA结合位点,其中4个在小鼠、大鼠和人类之间是保守的。GATA6(601656),而非失活的GATA6突变体,可以驱动SEMA3C启动子报告基因的表达。
Wiegreffe et al.(2015)表明,小鼠Bcl11a(606557)通过与Sema3c基因内含子2的调控元件结合,直接抑制Sema3c的表达。这种抑制对于小鼠胚胎发育过程中适当的神经元细胞极性的发育和上层投射神经元的迁移是必需的。
▼ 测绘
Hillier等(2003)通过序列分析,将SEMA3A基因定位到染色体7q21.11。