PARVIN, α; PARVA
HGNC 批准基因符号:PARVA
细胞遗传学定位:11p15.3 基因组坐标(GRCh38):11:12,376,436-12,535,356(来自 NCBI)
▼ 说明
Parvin 家族的成员,包括 PARVA,是与焦点接触相关的肌动蛋白结合蛋白。
▼ 克隆与表达
Olski et al.(2001)克隆了Parva。他们鉴定出 2 个 Parva 转录本是通过使用不同的聚腺苷酸化信号而产生的。两种转录物均编码推导的 372 个氨基酸的蛋白质,其计算分子量为 42.3 kD。Olski et al.(2001)通过在EST数据库中搜索与小鼠Parva相似的序列,然后对胚胎肾细胞系cDNA文库进行RT-PCR,克隆了人PARVA。人类 PARVA 蛋白含有 372 个氨基酸。小鼠和人 PARVA 具有单个肌动蛋白结合结构域,由 2 个由连接区分隔的 calponin(600806)同源结构域组成。N 末端有 2 个核定位信号和 3 个潜在的 SH3 结合位点。小鼠组织的 Northern 印迹分析在大多数组织中检测到 4.4-和 1.6-kb 转录本,其中较长的转录本占主导地位。在肾脏和心脏中检测到最高表达,在脑、肺和肝脏中表达较弱。Northern blot分析在睾丸中未检测到表达,但RT-PCR在睾丸中检测到表达。两个转录本在整个胚胎发育过程中均表达。荧光标记的小鼠 Parva 与膜褶边、焦点接触处的肌动蛋白丝以及成纤维细胞中心富含张力蛋白(600076)的纤维共定位。
Korenbaum et al.(2001)通过对几个EST进行测序,发现PARVA的3-prime非翻译区含有多达9个替代切割位点和非常规的聚腺苷酸化信号。5-素数非翻译区富含 GC。PARVA 蛋白的 N 末端含有一个低复杂性的脯氨酸/富含丝氨酸的基序,与结构蛋白中的基序相似。Northern 印迹分析检测到 1.8、3.5 和 4.5 kb 的主要 PARVA 转录本,这些转录本优先在心脏、骨骼肌、肾脏和肝脏中表达。RNA 斑点印迹分析揭示了几乎无处不在的分布。
▼ 基因功能
Olski et al.(2001)确定重组小鼠Parva以与其他肌动蛋白结合蛋白类似的解离常数结合肌肉F-肌动蛋白。通过结构域分析,他们确定 Parva 的第二个钙调蛋白同源结构域足以靶向焦点接触。
▼ 基因结构
Korenbaum et al.(2001)确定PARVA基因含有13个外显子。
▼ 测绘
Korenbaum et al.(2001)通过基因组序列分析,将PARVA基因定位到染色体11p15。
▼ 动物模型
Lange et al.(2009)表明,在推定的激酶结构域的自磷酸化位点以及在夜间-白细胞C 底部物同源结构域中携带点突变的小鼠是正常的。
相反,介导Ilk与α-parvin结合的激酶结构域的潜在ATP结合位点的保守赖氨酸残基发生点突变的小鼠会因肾发育不全而死亡。类似的肾缺陷也发生在 α-parvin 缺失的小鼠中。Lange et al.(2009)的结论是,他们的结果提供了遗传证据,证明Ilk激酶活性对于哺乳动物的发育是不可或缺的。然而,Ilk 和 α-parvin 之间的相互作用对于肾脏发育至关重要。
Lange et al.(2009)发现小鼠的整联蛋白连接激酶(Ilk; 602366)与α-parvin结合所需的蛋白由于肾发育不全而死亡。类似的肾缺陷也发生在α-parvin缺失小鼠中(Montanez et al., 2009)。Lange et al.(2009)得出结论,Ilk 和 α-parvin 之间的相互作用对于肾脏发育至关重要。