磷酸化酶激酶,肝脏,α-2 子单元;PHKA2
HGNC 批准基因符号:PHKA2
细胞遗传学定位:Xp22.13 基因组坐标(GRCh38):X:18,892,298-18,984,114(来自 NCBI)
染色体Xp22上的PHKA2基因编码肝磷酸化酶激酶(PHK; α 子单元)EC 2.7.11.19)。肝磷酸化酶激酶是一种十六聚体酶,包含由 4 个不同基因编码的 4 个独特子单元各 4 个拷贝:α(PHKA2)、β(PHKB, 172490)、γ(PHKG2,(172471))和 δ。δ子单元可以由3个不同的基因编码(CALM1, 114180; 平静2,114182;或CALM3,114183)。PHKA1(311870)和PHKG1(172470)基因分别编码肌肉磷酸化酶激酶的α和γ子单元;两种亚型中的 β 子单元是相同的。γ子单元含有酶的活性位点,而α和β子单元具有由磷酸化控制的调节功能。编码钙调蛋白的 δ 子单元介导酶对钙浓度的依赖性(Beauchamp et al., 2007)。
▼ 克隆与表达
Davidson 等人(1992)从兔 cDNA 文库中分离出与 Phka2 基因相对应的克隆。推导的 1,235 个残基蛋白质与兔 Phka1 基因有 68% 的序列相似性。核苷酸和残基差异的位置表明 Phka1 和 Phka2 由 2 个孤立的基因编码,而不是由单个基因的选择性剪接产生。Northern 印迹分析发现 4.3 kb mRNA Phka2 转录物在肝脏和大脑中高表达,但在肌肉中不表达。
Hendrickx等人(1992,1993)从人肝癌cDNA文库中分离出人PHKA2基因的克隆。该蛋白与兔蛋白显示出 93.5% 的同源性。兔 Phka1 中鉴定的两个钙调蛋白结合位点在兔和人 PHKA2 中高度保守。观察到差异剪接。
▼ 测绘
Davidson 等人(1992)利用兔 Phka2 基因将人类同源物 PHKA2 定位到染色体 Xp22.2-p22.1。Wauters等(1992)通过原位杂交证明PHKA2基因位于Xp的远端,与X染色体连锁肝糖原增多症(GSD IXa;GSD IXa;)突变位于同一区域。306000)。Hendrickx等人(1992,1993)通过荧光原位杂交将人类PHKA2基因定位到Xp22。值得注意的是,PHKA1 和 PHKA2 分别位于 Xq 和 Xp 上。
在小鼠中,Ryder-Cook et al.(1989)将磷酸化酶激酶的α子单元定位到X染色体。他们指出 β、γ 和 δ 子单元是常染色体。
▼ 基因结构
Hendrickx et al.(1999)确定人类PHKA2基因含有33个外显子,跨度65 kb或更长。
▼ 分子遗传学
X染色体连锁肝糖原贮积病(GSD9A;见306000),Hendrickx et al.(1995)鉴定出PHKA2基因的4种不同突变(300798.0001-300798.0004)。
Van den Berg 等人(1995)在 2 个患有 GSD IXa1 的荷兰家庭的受影响成员中发现了 PHKA2 基因突变(300798.0005 和 300798.0006)。其中一个家庭曾被Huijing 和Fernandes(1969)报道过。
Burwinkel等人(1996)发现GSD IXa2患者的PHKA2基因发生突变(306000.0007-306000.0010)。这些突变似乎聚集在有限的序列区域。Burwinkel等人(1996)强调GSD IXa2突变的聚集将进一步促进血细胞mRNA的RT-PCR分析,从而有助于在诊断中避免肝活检。
Fukao等人(2007)在一名患有经典GSD IXa2的日本男孩中鉴定出PHKA2基因中的半合子10-kb缺失,导致外显子20至26缺失。对断点区域的研究表明,该缺失是由Alu引起的元件介导的不等同源重组。
Roscher et al.(2014)报告了 PHKA2 基因中的 7 个新突变,导致了 GSD IXa。
▼ 基因型/表型相关性
Hendrickx等人(1996)在4名无关的GSD IXa2患者中鉴定出4种不同的PHKA2基因突变(306000.0011-306000.0014)。这些突变导致蛋白质一级结构出现轻微异常。这些突变存在于保守的 RXX(X)T 基序中,类似于可能参与 PHK 调节的已知磷酸化位点。Hendrickx等人(1996)推测PHK活性可能通过这些位点的磷酸化来调节,并且II型GSD9A可能是由于PHK活性激活受损所致。这些发现可以解释为什么 II 型体外 PHK 酶活性并不缺乏,而 I 型却缺乏。
Hendrickx 等人(1999)在 10 名 I 型和 II 型 GSD9A 患者中发现了 PHKA2 突变。他们提出,I 型 GSD 突变(肝脏和红细胞中 PHK 活性均降低)是由 PHKA2 蛋白截短或破坏造成的。相比之下,所有导致红细胞残留活性的 II 型突变都是错义突变或小的框内删除和插入。这些结果表明,两种类型的 GSD IXa 之间的生化差异是由于 PHKA2 中致病突变的不同性质造成的。I 型突变可能导致 α 子单元的缺失,从而导致 PHK 全酶不稳定和酶活性缺陷,而 II 型突变可能导致 PHK 体内失调,这可能很难在体外证明。
▼ 等位基因变异体(15个选例):
.0001 糖原储存疾病,IXa1 型
PHKA2、GLN1009TER
一名患有糖原累积病的比利时男孩 IXa1(GSD9A1; 306000),Hendrickx 等人(1995)在外显子 8 中发现了 C 到 T 的转变,导致 gln1009 到 ter(Q1009X)的取代。这导致蛋白质被截短,缺少 C 末端、磷酸化位点和假定的钙调蛋白结合位点。患者出现肝肿大、肝酶升高和生长迟缓,但随着青春期的进展,生长迟缓有所减轻。红细胞和肝脏中完全不存在 PHK 活性。
.0002 糖原储存疾病,IXa1 型
PHKA2、GLN766TER
一名法国男孩患有 IXa1 型 GSD(GSD9A1;306000),Hendrickx et al.(1995)在PHKA基因的外显子2中发现了C到T的转变,导致gln766到ter(Q766X)的取代。这导致蛋白质被截短,缺少 C 末端、磷酸化位点和两个假定的钙调蛋白结合位点。患者有肝肿大、肝酶升高和生长迟缓。红细胞PHK活性是对照值的2%。他的妹妹病情较轻,仅有肝肿大;她的红细胞 PHK 活性是对照值的 30%。
.0003 糖原贮积症,IXa1 型
PHKA2、IVS7DS、GT、+1
来自英国的双胞胎男孩,GSD 类型为 IXa1(GSD9A1;306000),Hendrickx et al.(1995)在PHKA2基因内含子7的+1位置发现了G到T的颠换。这导致外显子 7 完全跳过,并且 PHKA2 蛋白缺乏该外显子的 34 个氨基酸。两名患者均有肝肿大、生长迟缓和高甘油三酯血症,但没有高胆固醇血症。只有 1 例肝酶升高。两名 8 岁至 10 岁男孩的肝肿大均消失。红细胞活性分别为对照值的8%和4%。
.0004 糖原储存疾病,IXa1 型
PHKA2、SER1049TER
来自英国的2个兄弟拥有IXa1型GSD(GSD9A1;306000),Hendrickx et al.(1995)发现PHKA2基因第11号外显子发生C-A颠换,导致ser1049-to-ter(S1049X)取代,导致蛋白质C端缺失180多个氨基酸,包括 3-素数推定钙调蛋白结合位点。两名患者均出现生长迟缓、肝肿大和肝酶升高。红细胞PHK活性分别是对照值的5.7%和16.9%。
.0005 糖原储存疾病,IXa1 型
PHKA2、PRO1205LEU
荷兰一个大家庭的受累成员患有 IXa1 型 GSD(GSD9A1;Huijing and Fernandes(1969)和Willems et al.(1990)先前描述了306000),van den Berg et al.(1995)在PHKA2基因中发现了3614C-T转变,导致pro1205到leu(P1205L) )在蛋白质的高度保守区域进行取代。
.0006 糖原贮积症,IXa1 型
PHKA2、3-BP DEL、419TCT
一名荷兰男孩患有 IXa1 型 GSD(GSD9A1;306000),van den Berg et al.(1995)发现了一个3-bp的缺失(419_421),导致基因产物中苯丙氨酸-141的缺失。在杂合状态的患者母亲淋巴细胞的 PHKA2 编码序列中也发现了相同的缺失。这种苯丙氨酸是种间高度保守的氨基酸。
.0007 糖原储存疾病,IXa1 型
PHKA2、ASP299GLY
Burwinkel等人(1996)在一名被他们归类为具有X染色体连锁GSD IXa2(GSD9A2;GSD9A2;见306000)。然而,Beauchamp et al.(2007)在一名红细胞和白细胞PHK活性降低的患者中发现了D299G突变,与GSD IXa1(306000)一致。他们建议 D299G 应重新分类为 GSD IXa1 突变。
.0008 糖原储存疾病,IXa2 型
PHKA2、ARG186HIS
X染色体连锁GSD IXa2(GSD9A2;参见 306000),Burwinkel 等人(1996)在 PHKA2 基因中发现了 G 到 A 的转变,导致 arg186 到 hiss(R186H)的取代。
Hendrickx 等人(1998)介绍了一位患有 II 型 X 染色体连锁肝糖原增多症和 PHKA2 基因 R186H 突变的患者的临床、生化和分子发现。该患者已被追踪 40 年。尽管早年发育迟缓,但他在33岁时身高达到了182厘米。甲状腺治疗似乎对该患者有帮助。五名男性亲属也患有肝糖原增多症。
.0009 糖原储存疾病,IXa2 型
PHKA2、HIS132PRO
GSD IXa2(GSD9A2;306000),Burwinkel et al.(1996)在PHKA2基因中发现了A到C的颠换,导致his132到pro(H132P)的取代。
.0010 糖原储存疾病,IXa2 型
PHKA2、HIS132TYR
GSD IXa2(GSD9A2;参见 306000),Burwinkel 等人(1996)鉴定出 PHKA2 基因中的 C 到 T 变化,导致 his132 到 tyr(H132Y)取代。
.0011 糖原储存疾病,IXa2 型
PHKA2、THR1114ILE
X染色体连锁GSD IXa2(GSD9A2;见306000),Hendrickx等人(1996)鉴定出PHKA2基因中的3341C-T变化,导致thr1114-to-ile(T1114I)取代。
.0012 糖原贮积症,IXa2 型
PHKA2、ARG556CYS
X染色体连锁GSD IXa2型(GSD9A2;参见 306000),Hendrickx 等人(1996)在 PHKA2 基因中发现了一个 556C-T 转变,导致 arg556 到 cys(R556C)的取代。
.0013 糖原贮积病,IXa2 型
PHKA2、3-BP DEL、NT750
X染色体连锁GSD IXa2患者(参见GSD9A2;参见 306000),Hendrickx et al.(1996)在 PHKA2 基因中发现了一个框内 3-bp 缺失(750_752),导致 thr251 缺失。
.0014 糖原贮积症,IXa2 型
PHKA2、6-BP INS、NT3331
X染色体连锁GSD IXa2型(GSD9A2;参见 306000),Hendrickx 等人(1996)在 PHKA2 基因的核苷酸 3331 和 3332 之间发现了一个符合读码框的 6-bp 插入,导致在 arg1111 和 glu1112(R1111insTR)之间插入一个苏氨酸和一个精氨酸残基。
.0015 糖原储存疾病,IXa2 型
PHKA2、LYS189GLU
X染色体连锁GSD IXa2(GSD9A2;参见 306000),Burwinkel 等人(1998)描述了 PHKA2 编码序列中的 A 到 G 转变,导致 lys189 到 glu(K189E)取代。该患者的表型是肝组织中PHK活性低,但红细胞中的活性比正常人高4倍。