清道夫受体类 F, 成员 1; SCARF1
内皮细胞表达的清道夫受体; SREC
SREC1
SREC I
KIAA0149
HGNC 批准的基因符号:SCARF1
细胞遗传学定位:17p13.3 基因组坐标(GRCh38):17:1,633,858-1,645,732(来自 NCBI)
▼ 说明
清道夫受体介导化学修饰脂蛋白的内吞作用。SCARF1特异性介导内皮细胞选择性摄取乙酰化低密度脂蛋白(Ac-LDL)。
▼ 克隆与表达
Nagase等人(1995)通过对从骨髓性白血病细胞cDNA文库获得的克隆进行测序,克隆了SCARF1,并将其命名为KIAA0149。推导的 830 个氨基酸的蛋白质包含一个假定的跨膜结构域和一个类似 EGF 的半胱氨酸重复模式。SCARF1 与上皮受体酪氨酸激酶 Tie2(600221)在 147 个氨基酸上具有约 33% 的同一性。3-prime 非翻译区包含 Alu 重复序列。Northern印迹分析检测到大多数检查组织中的表达,其中肺和脾中的表达水平最高。在 HeLa 细胞、胰腺或结肠中未检测到表达。
Adachi 等人(1997)使用表达克隆策略克隆了 SCARF1,并将其命名为 SREC,在该策略中,他们测定了转染人脐静脉内皮细胞(HUVEC)cDNA 文库的 CHO 细胞中荧光标记的 Ac-LDL 的摄取情况。推导的 830 个氨基酸的蛋白质的计算分子量约为 86 kD。SCARF1 包含一个疏水信号序列,后跟 5 个 EGF 样半胱氨酸模式特征,位于其胞外 N 端半部、跨膜区和胞内 C 端半部,其中胞内 C 端半部含有富含丝氨酸/脯氨酸的区域,随后是富含甘氨酸的区域。它具有 3 个潜在的 N-糖基化位点和几个假定的丝氨酸和苏氨酸磷酸化位点。Northern 印迹分析显示,3.5 kb 转录物在 HUVEC 和冠状动脉内皮细胞中表达,但在冠状动脉平滑肌细胞中不表达。
Adachi 和 Tsujimoto(2002)在外周血白细胞 cDNA 文库中鉴定了几个 SCARF1 变异体。在其中 2 个变体中,选择性剪接在跨膜区之前引入了终止密码子,从而产生了 SCARF1 的可溶形式。
▼ 基因功能
Adachi等人(1997)确定稳定表达SCARF1的CHO细胞以高亲和力结合放射性标记的Ac-LDL,并通过内吞途径将其降解。SCARF1 和 Ac-LDL 之间的关联受到氧化 LDL、丙二醛修饰 LDL、硫酸葡聚糖和聚肌苷酸的抑制,但不受天然 LDL 或肝素的抑制。
Adachi 和 Tsujimoto(2002)确定 SCARF1 的所有膜结合剪接变体均表现出针对 Ac-LDL 的受体活性。他们鉴定出了SCARF1的转录激活子ZNF444(607874)。HUVEC 中 ZNF444 的过表达使 SCARF1 启动子活性增加近 2.5 倍。SCARF1 最大表达需要完整的 SP1(189906)基序和带有三核苷酸间隔区(IR3)的完整反向重复序列(IR3),可结合 ZNF444。几种炎症细胞因子在体外抑制 SCARF1 启动子活性,并在体内减少 Ac-LDL 摄取。
Means et al.(2009)表明清道夫受体Scarf1和Cd36(173510)通过产生抗菌肽介导针对两种真菌病原体(新型隐球菌和白色念珠菌)的防御。线虫研究表明同源蛋白可以保护线虫。巨噬细胞结合和细胞因子产生需要Cd36,但不需要Tlr2(603028),并且结合依赖于病原体β-葡聚糖的识别。缺乏Cd36但表达其他β-葡聚糖受体(例如CLEC7A;606264),与野生型小鼠相比,静脉感染新型隐球菌后,其真菌负荷更高,死亡率更高。Means et al.(2009)得出结论,SCARF1和CD36是β-葡聚糖结合受体,参与真菌病原体先天感知的进化保守途径。
▼ 基因结构
Adachi和Tsujimoto(2002)确定SCARF1基因包含11个外显子,跨度12 kb。5-prime 侧翼区域缺少 TATA 和 CCAAT 框,但它包含 DNA 结合元件的几个假定基序,包括 SP1 基序和结合 ZNF444 的 IR3 序列。
▼ 测绘
Nagase等人(1995)通过对人类/啮齿动物杂交组进行PCR,将SCARF1基因定位到染色体17。