A-激酶锚定抑制剂 1; AKAIN1
染色体 18 开放解读码组 42; C18ORF42
HGNC 批准的基因符号:AKAIN1
细胞遗传学定位:18p11.31 基因组坐标(GRCh38):18:5,142,911-5,197,691(来自 NCBI)
▼ 说明
C18ORF42编码一种短蛋白,预计可调节蛋白激酶A(PKA;PKA;见 601639)在神经组织中(Fukuda 和 Aizawa,2015)。
▼ 克隆与表达
Fukuda 和 Aizawa(2015)通过人小脑 RNA 的 RT-PCR 克隆了 C18ORF42。推导的 69 个氨基酸蛋白具有中心 PKA 结合基序,预计该基序与 PKA 调节子单元(例如 PRKAR2A;PRKAR2A;176910)。实时RT-PCR检测到C18ORF42在脑中表达最高,其次是脊髓,在睾丸中表达很少。在心脏、肝脏、肺和子宫中未检测到 C18ORF42 表达。类似的表达模式也出现在了老鼠身上。数据库分析揭示了脊椎动物中 C18ORF42 的直系同源物。
▼ 基因功能
Fukuda and Aizawa(2015)利用免疫沉淀、质谱和蛋白质印迹分析发现,表位标记的C18ORF42优先与PKA调节子单元RII-α(PRKAR2A)和RII-β(PRKAB2;602741),对 I 型调控子单元(例如 PRKAR1A;188830)。将 C18ORF42 转染到小鼠 Neuro2A 细胞中,将 RII-α 从核周区域重新定位到弥漫的细胞质分布。Fukuda 和 Aizawa(2015)使用共转染的 HEK293 细胞表明,C18ORF42 破坏了 PKA 与 PKA 锚定蛋白 AKAP5(604688)的相互作用,但不破坏与其他检查的 PKA 锚定蛋白的相互作用。
▼ 基因结构
Fukuda and Aizawa(2015)确定C18ORF42基因包含2个外显子,跨度约为50 kb。
▼ 测绘
Fukuda and Aizawa(2015)报道C18ORF42基因定位于染色体18p11.31。