HIV-1 TAT 刺激因子 1；HTATSF1

TATSF1

HGNC 批准的基因符号：HTATSF1

细胞遗传学定位：Xq26.3 基因组坐标（GRCh38）：X:136,497,229-136,512,346（来自 NCBI）

▼ 说明

大多数 DNA 序列特异性转录因子会增加起始速率并与增强子或启动子 DNA 相互作用，而人类免疫缺陷病毒-1（HIV-1） Tat 主要刺激延伸并与反式作用响应（TAR） RNA 元件相互作用。Tat 对于 HIV 复制至关重要。

▼ 克隆与表达

Zhou和Sharp（1996）通过对Tat刺激因子进行功能和生化纯化，然后进行微序列分析和单核细胞cDNA文库筛选，孤立出编码HTATSF1的cDNA。序列分析预测HTATSF1蛋白有754个氨基酸。HTATSF1的N端半部含有2个与EWS蛋白（133450）和FUS/TLS（137070）同源的RNA识别基序，而C端半部富含酸性氨基酸，特别是谷氨酸和天冬氨酸，并且具有几个潜在的丝氨酸磷酸化位点。Northern 印迹分析揭示了 3.0-kb HTATSF1 转录物在多种细胞系中的表达。免疫印迹分析表明，HTATSF1 在多种细胞类型中表达为 140 kD 磷蛋白，表明 HTATSF1 除了在 Tat 激活中发挥重要作用外，还可能介导广泛活跃的细胞过程。结合分析表明 HTATSF1 与 TAR RNA 的结合较弱。Tat 的存在大大增强了与 TAR RNA 的关联。

▼ 生化特征

冷冻电子显微镜

张等人（2020）报道了核心分辨率为4.1埃的人类17S U2 snRNP的3D冷冻电子显微镜结构，并将其与蛋白质交联数据相结合，以确定该snRNP的分子结构。结构揭示SF3B1（605590）的HEAT结构域与PRP5（617848）和TATSF1相互作用，并在U2 snRNP中保持其开放构象，并且U2 snRNA形成夹在PRP5之间的分支点相互作用茎环（BSL）， TATSF1 和 SF3B1 的 HEAT 结构域。因此，必须发生 BSL 的实质性重塑和 BSL 相互作用蛋白的置换，以允许 U2 分支位点螺旋的形成。张等人（2020）得出结论，他们的研究为为什么 TATSF1 在 U2 稳定添加到剪接体之前必须被置换提供了结构解释，并确定了 PRP5 促进的 RNP 重排，这是 U2 和分支位点之间稳定相互作用所必需的。

▼ 测绘

Stumpf（2020）根据HTATSF1序列（GenBank BC009896）与基因组序列（GRCh38）的比对，将HTATSF1基因定位到染色体Xq26.3。

▼ 基因功能

Fong and Zhou（2001）证明剪接因子直接发挥促进转录延伸的作用。剪接体 U 小核核糖核蛋白（snRNP）与人转录延伸因子 TATSF1 相互作用，当针对无内含子的 HIV-1 模板时，强烈刺激聚合酶延伸。Fong and Zhou（2001）认为这种效应可能是通过TATSF1与延伸因子P-TEFb的结合介导的（见603251）。在新生转录物中包含剪接信号进一步刺激转录，支持了延伸聚合酶附近 U snRNP 的募集对于转录很重要的观点。由于TATSF1--U snRNP复合物也在体外刺激剪接，Fong和Zhou（2001）提出它可能作为双功能因子来耦合转录和剪接并促进它们的相互激活。