主要促进者超家族结构域蛋白 12;MFSD12

PP3501

HGNC 批准的基因符号:MFSD12

细胞遗传学定位:19p13.3 基因组坐标(GRCh38):19:3,538,275-3,557,586(来自 NCBI)

▼ 说明

MFSD12 是一种核蛋白,似乎在调节细胞增殖中发挥作用(Wang et al., 2012)。

▼ 克隆与表达

Wang等(2012)通过人神经母细胞瘤细胞系SH-SY5Y总RNA的RT-PCR克隆了MFSD12,并将其命名为pp3501。推导的蛋白质的计算分子量为 16 kD。免疫荧光显微镜显示 MFSD12 在 SH-SY5Y 细胞中的核定位。

▼ 基因功能

丁酸钠是一种提高癌症化疗和免疫疗法疗效的药物。Wang et al.(2012)发现,用丁酸钠处理SH-SY5Y细胞48小时后,细胞增殖受到抑制,MFSD12 mRNA和蛋白上调。MFSD12转染SH-SY5Y细胞可抑制细胞增殖,增加G1期细胞数量,减少S期细胞数量。SH-SY5Y 细胞中外源 MFSD12 的表达增强了丁酸钠的抗增殖作用,而通过小干扰 RNA 抑制 MFSD12 可恢复丁酸钠处理的细胞中神经母细胞瘤的增殖。Wang et al.(2012)得出结论,MFSD12通过将神经母细胞瘤细胞阻滞在G1期来抑制其增殖。

▼ 基因结构

Wang et al.(2012)指出MFSD12基因是无内含子的。

▼ 测绘

Gross(2017)根据MFSD12序列(GenBank BC036706)与基因组序列(GRCh38)的比对,将MFSD12基因定位到染色体19p13.3。

▼ 分子遗传学

通过检查来自具有量化色素沉着水平的非洲人的不同种族基因组,Crawford 等人(2017)发现了 MFSD12 基因中或附近与皮肤色素沉着密切相关的 SNP(见 617745.0001)。

▼ 动物模型

“灰白”小鼠(gr)是一种常染色体隐性毛色突变,其特征是毛发中黄色色素的丧失,但对黑色色素没有影响。与正常同窝小鼠相比,纯合的灰白小鼠在围产期体型较小且存活率较低。该表型定位于染色体10的中心区域(Qiao et al., 2003总结)。Crawford et al.(2017)指出,gr 映射的区域与小鼠 Mfsd12 基因重叠。Crawford 等人(2017)使用 CRISPR-Cas9 创造了 Mfsd12 基因外显子 2 缺失的小鼠。他们观察到 4 位创始人的毛色都是统一的灰色。对这些小鼠毛发的显微镜观察发现,它们缺乏褐黑素,导致出现白色而不是黄色的条带。对存档的 gr/gr DNA 样本进行外显子组测序,鉴定出 Mfsd12 基因外显子 2 内的 9 bp 框内缺失(leu163_ala165del)是影响映射候选区域中编码序列的唯一突变。这些结果表明,Mfsd12 的突变导致了 gr/gr 突变小鼠的灰色。

Hedan等人(2019)利用全基因组关联研究和全基因组测序,在Mfsd12中发现了一个arg51-to-cys(R51C)变异体,该变异体与缺乏真黑素的各种品种的纯白色狗中褐黑素的极度稀释有关。这种变异似乎很古老,因为在 31 只狼中的 9 只身上发现了这种变异。

▼ 等位基因变异体(1个精选示例):

.0001 MFSD12 多态性

MFSD12、IVS8、TC(rs10424065)

与皮肤色素沉着的关联

通过检查来自具有量化色素沉着水平的个体的 1,570 个不同种族的非洲基因组,Crawford 等人(2017)在染色体 19 上发现了一个包含与皮肤色素沉着密切相关的 MFSD12 基因的区域。精细定位描绘了 2 个簇中的 8 个潜在因果 SNP,其中一个位于 MFSD12 内,另一个位于基因上游约 7,600 至 9,000 个碱基对处。许多 SNP 位于黑色素细胞和/或角质形成细胞中活跃的预测调节区域,并在黑色素瘤细胞系的荧光素酶报告基因测定中显示出增强子活性。因果概率最高的 2 个 SNP 分别是外显子 9 内的同义变异 rs56203814(p = 3.6 x 10(-18))和内含子 8 内的 rs10424065(p = 5.1 x 10(-20))。 SNP 相距 130 个碱基对,处于强连锁不平衡状态,并且在荧光素酶表达测定中增加的基因表达比最小启动子高 1.5 至 2.7 倍。衍生的 rs56203814T 和 rs10424065T 等位基因与深色色素沉着相关,仅存在于非洲人群或近代非洲人后裔中,并且在具有尼罗-撒哈拉血统的东非人群中最常见。西蒙斯基因组多样性计划(SGDP)数据集的合并分析表明,rs10424065T等位基因的起源早于30万年前的现代人类,并且估计最近共同祖先(TMRCA)的时间为612,000年前。在斑马鱼中,复合杂合 mfsd12a 突变体表现出黄细胞染色减少,黄细胞是野生型斑马鱼中蝶啶黄色色素沉着的细胞。这些结果和小鼠研究(参见动物模型)表明,MFSD12 在脊椎动物色素沉着中发挥着保守的作用。

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