含有三联基序的蛋白质 22; TRIM22
刺激反式作用因子,50-KD; STAF50
HGNC 批准的基因符号:TRIM22
细胞遗传学定位:11p15.4 基因组坐标(GRCh38):11:5,689,790-5,710,863(来自 NCBI)
▼ 正文
TRIM 蛋白由 3 个锌结合结构域、一个环、一个 1 型 B 框和一个 2 型 B 框组成,后面是一个卷曲螺旋区域。它们参与发育和细胞生长。
▼ 克隆与表达
Tissot和Mechti(1995)通过对IFNA(147660)/IFNB(147640)(I型IFN)处理和未处理的Daudi淋巴母细胞的cDNA文库进行差异筛选,孤立出编码TRIM22的cDNA,他们将其命名为STAF50。序列分析预测该442个氨基酸的蛋白与小鼠Rpt1和人SSA/RO52(SSA1;)有44%和41%的一致性。109092),分别。它包含一个无名指、一个中间基序和一个位于其 N 末端的 CHC3H2 锌指,以及一个中央二分核定位信号。Northern印迹分析显示I型干扰素(IFNG;147570)-用适当的受体处理的细胞。在没有IFN治疗的情况下,TRIM22在外周血白细胞、脾脏、胸腺和卵巢中强烈表达;它在其他组织中以基础水平表达。SDS-PAGE分析表明TRIM22表达为54-kD蛋白。功能分析表明,TRIM22 下调转染细胞中 HIV-1 长末端重复序列指导的转录,表明 TRIM22 可能参与 IFN 抗病毒作用的转导。
Reymond et al.(2001)通过EST数据库搜索含B框的蛋白,鉴定出37个TRIM成员,其中包括TRIM22。Northern 印迹分析揭示了 4.5-和 3.5-kb 转录物的普遍表达。荧光显微镜证实了弥漫性细胞质斑点中的表达。共聚焦显微镜未能识别亚细胞定位。相互作用交配分析表明TRIM22不形成同源二聚体。
▼ 测绘
Tissot et al.(1996)利用FISH将TRIM22基因定位到染色体11p15,靠近SSA1基因。Reymond et al.(2001)通过辐射混合分析将其对应到同一位置。
▼ 分子遗传学
Kelly等人(2014)报道了SNP rs1063303,它导致TRIM22中arg242到thr(R242T)的取代,位于正选择位点。他们发现,rs1063303 的频率在非洲、亚洲、美洲和欧洲种族之间差异高达 10 倍,其中亚洲人的频率最低。功能分析表明 rs1063303 导致 TRIM22 表达增加并降低抗病毒活性。