生长抑制剂3; ING3
p47ING3
HGNC 批准的基因符号:ING3
细胞遗传学定位:7q31.31 基因组坐标(GRCh38):7:120,950,777-120,977,216(来自 NCBI)
▼ 说明
ING3属于含有植物同源结构域(PHD)指的蛋白质家族,其中包括转录因子和调节染色质结构的蛋白质。
▼ 克隆与表达
在人类癌症中经常检测到染色体 7q31 杂合性缺失(LOH),表明该区域存在抑癌基因。通过分析49例头颈鳞状细胞癌(HNSCC;275355),Gunduz et al.(2002)确定了2个优先删除的区域。通过数据库检索和序列分析,他们发现ING3基因(GenBank NM_019071)定位在该区域内。ING3 基因编码预测的 418 个氨基酸的蛋白质,推定分子量为 47 kD。该蛋白与 PHD 锌指结构域内的 ING 家族其他成员表现出高度同源性,与 ING1(601566)整体同源性较弱。Northern blot 分析在人类心脏、骨骼肌、胸腺、脾脏、肾脏、肝脏、胎盘和外周血白细胞中检测到大约 1.9 kb 的转录物;在脑、结肠、小肠或肺中未检测到表达。
▼ 基因功能
Gunduz等人(2002)通过RT-PCR分析证明,与匹配的正常样本相比,50%的原发性肿瘤中ING3 mRNA表达减少或不表达。大约 63% 的舌和喉肿瘤出现减少,并且在 ING3 表达减少的病例中观察到死亡率较高的趋势。
NuA4 组蛋白乙酰转移酶(HAT)复合物负责酵母中组蛋白 H4(见 602822)和 H2A(见 613499)N 末端尾部的乙酰化。其催化子单元Esa1与人TIP60(HTATIP; 601409)。Doyon等人(2004)利用亲和纯化、蛋白质印迹分析、细胞分级分离、免疫沉淀和质谱分析,发现TIP60及其剪接变体TIP60B/PLIP是多子单元NuA4复合物的一部分,在多个细胞中具有HAT活性。人类细胞系。他们鉴定了 12 个酵母 NuA4 子单元中的 11 个的人类同源物,包括 ING3。Doyon et al.(2004)表明ING3将NuA4与p53(TP53;191170)在体内发挥作用。TIP60、EPC1(610999)和ING3的重组三聚体复合物足以在体外重建核小体HAT活性。
Doyon等人(2006)通过免疫纯化与ING3相关的HeLa细胞蛋白,发现大部分ING3与人NuA4/TIP60 HAT复合物相关。在人结肠癌细胞系中,ING3-TIP60 复合物在染色质存在的情况下乙酰化组蛋白 H4 N 末端结构域中的所有 4 个赖氨酸。
▼ 基因结构
Gunduz et al.(2002)确定ING3基因至少包含12个外显子,跨度超过25 kb。启动子区域包含几个假定的转录因子结合位点。
▼ 测绘
Gunduz等(2002)通过基因组序列分析,将ING3基因定位到染色体7q31,靠近标记D7S643。
▼ 分子遗传学
Gunduz et al.(2002)通过对49个HNSCC和4个肿瘤来源的细胞系进行PCR-SSCP和直接测序,仅鉴定出1个错义突变和3个多态性。