无名指和CCCH型锌指结构域-含有1个;RC3H1
ROQUIN
KIAA2025
HGNC 批准的基因符号:RC3H1
细胞遗传学定位:1q25.1 基因组坐标(GRCh38):1:173,931,084-174,022,357(来自 NCBI)
▼ 说明
RC3H1(或 roquin)编码 RING 型泛素连接酶蛋白家族的高度保守成员。roquin 蛋白的特点是在 RNA 结合蛋白中存在 CCCH 锌指,并且定位于胞质 RNA 颗粒,涉及调节 mRNA 转录和稳定性(Vinuesa 等人,2005)。RC3H1通过mRNA转录后调控在控制免疫反应中发挥重要作用(Tavernier et al., 2019总结)
▼ 克隆与表达
Vinuesa et al.(2005)开发了一种系统策略,通过用乙基亚硝基脲处理雄性 C57BL/6 小鼠,在种系中产生单碱基取代,将变异基因组序列培育至纯合性,并进行筛选,以确定抑制抗自身免疫反应的机制。通过抗核自身抗体的标准临床测试来检测自身免疫。第一个被确定的血统被命名为桑罗克,因为伴随着淋巴结病。桑罗克小鼠被发现患有一种自身免疫性疾病,作为一种简单的隐性性状遗传,与远端染色体 1 上的单个基因座有关。在该区域,作者鉴定了一个以前未表征的基因,他们将其命名为 roquin,该基因在桑罗克小鼠。Roquin mRNA 转录本随处可见。roquin 蛋白预计是一种含有 1,130 个残基的细胞内蛋白,在哺乳动物到无脊椎动物中其全长高度保守。该蛋白在残基 14-53 处具有氨基末端 RING-1 锌指,完全符合 E3 泛素连接酶蛋白家族的共识。RING指的羧基末端(残基131-360)是一个高度保守的新型蛋白质结构域(ROQ结构域)。roquin中间有一个C-X8-C-X5-C-X3-H型(CCCH型)锌指结构域(残基419-438)。CCCH 结构域序列与一系列蛋白质中发现的 RNA 结合锌指结构域完全一致。CCCH 结构域的 C 端是富含脯氨酸的区域,代表结合相互作用蛋白的 SH3 结构域的潜在位点,以及可介导同源多聚化或异源多聚化的 2 个卷曲螺旋结构域。
▼ 基因功能
Yu等人(2007)定义了一种新发现的途径,通过限制T淋巴细胞上共刺激受体——诱导性T细胞共刺激物(ICOS;ICOS;604558)。在 Roquin 的 ROQ 结构域中 M199R 突变的纯合 sanroque 小鼠中,T 细胞上 ICOS 表达增加导致淋巴细胞积聚,这与狼疮样自身免疫综合征相关。Roquin 通常通过促进 Icos mRNA 的降解来限制 Icos 表达。异常长的 ICOS 3-prime 未翻译 mRNA 中的一个保守片段对于 Roquin 的调节至关重要。该片段包含一个 47 bp 的最小区域,与 T 细胞表达的 mRNA(包括 miR101)互补,其抑制活性被预计会消除 miR101 结合的碱基对倒置所破坏。Yu等人(2007)得出结论,他们的发现阐明了T细胞内调节淋巴细胞积累和自身免疫的关键转录后途径,并强调了部分拮抗ICOS途径的治疗潜力。
Regnase-1(ZC3H12A;610562)和roquin是RNA结合蛋白,对于炎症相关mRNA的降解至关重要。Mino等人(2015)利用HeLa细胞和其他哺乳动物细胞发现,虽然regnase-1和roquin通过共同的茎环结构调节一组重叠的mRNA,但它们在不同的亚细胞位置发挥作用,其中regnase-1发挥作用在核糖体/内质网中,roquin 在处理身体/应激颗粒中发挥作用。Regnase-1以UPF1(601430)解旋酶依赖性方式切割和降解高度活跃的RNA,而roquin则作用于高度不活跃的mRNA,不依赖于UPF1。regnase-1 和 roquin 的缺乏导致其靶标 mRNA 大幅增加。Mino et al.(2015)得出结论,这些RNA结合蛋白以时空不同的方式控制炎症,其中regnase-1控制炎症的早期阶段,此时mRNA的翻译更加活跃,而roquin控制炎症的晚期阶段。
▼ 测绘
Gross(2015)根据RC3H1序列(GenBank BC136784)与基因组序列(GRCh38)的比对,将RC3H1基因定位到染色体1q25.1。
▼ 分子遗传学
一名患有免疫失调和全身过度炎症综合征的 18 岁男性(IMDYSHI;Tavernier et al.(2019)在RC3H1基因(R688X; 618998)中发现了一个纯合无义突变。609424.0001)。该突变是通过全外显子组测序发现的,与家族中的疾病分离,并且不存在于包括 gnomAD 在内的公共数据库中。患者 T 细胞显示 ICOS(604558)和 OX40(600315)水平升高,提示免疫失调。转染该突变的 HEK293T 细胞的体外研究表明,RC3H1 对参与 mRNA 调节的 P 体(加工体)的定位受损,以及与 CCR4(604836)/CNOT1(604917)复合物的关联性降低;这些发现与 ICOS mRNA 的增强相对应。许多异常与在桑罗克小鼠中观察到的相似,这些小鼠表现出全身性过度炎症(参见动物模型)。Tavernier 等人(2019)得出结论,这种过度炎症性疾病是由于转录后阻遏物 RC3H1 功能受损导致的免疫失调所致。
▼ 动物模型
为了鉴定小鼠基因组中的自身免疫调节因子,Vinuesa 等人(2005)分离出了 sanroque 菌株,该菌株表现出严重的自身免疫性疾病并伴有淋巴结病。Sanroque纯合子(san/san)雌性在6至7周龄时产生抗核自身抗体,雄性在8至16周时产生抗核自身抗体。额外的测试显示桑罗克小鼠具有以下系统性红斑狼疮(SLE;152700):针对双链DNA的高亲和力抗体;局灶性增生性肾小球肾炎伴含IgG(见147100)的免疫复合物沉积;坏死性肝炎;贫血; 和 CBA sanroque 小鼠的自身免疫性血小板减少症。到 7 周龄时,所有 san/san 小鼠的脾脏和淋巴结均出现肿大。在 sanroque 小鼠中,roquin 基因携带 T 到 G 的替换,导致非保守的 met199 到 arg(M199R)的替换。桑罗克突变作用于成熟 T 细胞内,导致形成过量的滤泡辅助 T(Tfh)细胞和生发中心。该突变破坏了 Tfh 细胞必需的共刺激受体 ICOS(604558)的阻遏蛋白,并导致细胞因子 IL21(605384)的过量产生。Sanroque 小鼠未能抑制引起糖尿病的 T 细胞。
Linterman et al.(2009)发现即使在同样缺乏Cd28的Rc3h1 san/san小鼠中Icos表达也有所增加(186760)。在双突变小鼠中,Icos可以替代Cd28诱导体内免疫反应,包括一抗反应、生发中心B细胞形成、Il2(147680)表达以及Foxp3(300292)阳性调节性T细胞的稳态(Treg)细胞。Linterman et al.(2009)得出结论,RC3H1 对于 ICOS 和 CD28 信号的功能划分是必需的,因此对于正常免疫反应的 2 信号控制是必需的。
Bertossi等人(2011)通过培育T细胞中带有条件性Roquin等位基因敲除的小鼠,观察到所有T细胞上Icos的上调以及Cd8(见186910)阳性效应物的增加,但不包括Cd4(186940)阳性效应物的增加T 细胞数量。与缺乏 Roquin 的小鼠相比,Tfh 细胞分化没有增加,也没有出现自身免疫表现。造血细胞或 B 细胞中 Roquin 的缺失会导致免疫失调。胸腺上皮细胞中的 Roquin 缺陷导致胸腺萎缩,但不影响 T 细胞选择。与均表现出围产期致死性的 C57BL/6 Roquin -/- 小鼠不同,远交 CD1 Roquin -/- 小鼠有 4% 存活至成年,尽管它们表现出生长迟缓和卷尾,有时会在以后得到纠正。免疫缺陷相对轻微,但 Cd8 阳性效应 T 细胞数量显着增加,但其他 T 细胞数量没有增加。由于单独消除 T 细胞中的 Roquin 不足以引起自身免疫,与具有 sanroque 突变的小鼠不同,Bertossi 等人(2011)提出,Roquin M199R 蛋白复合物可能比没有 Roquin 时更具破坏性。
Vogel等人(2013)发现,T细胞中特异性缺乏Rc3h1旁系同源物Rc3h2(615231)的小鼠,免疫细胞稳态没有缺陷。然而,T细胞同时缺乏Rc3h1和Rc3h2的小鼠出现淋巴结肿大和脾肿大,这表明T细胞中Rc3h1和Rc3h2的功能多余。Rc3h1和Rc3h2均与Edc4(606030)蛋白进行相同的分子相互作用,并过度下调Icos mRNA的表达。Rc3h1和Rc3h2联合缺失诱导Tfh细胞分化,表达趋化因子受体Cxcr5(601613)、共刺激分子Pd1(PDCD1;600244)和Icos、转录因子Bcl6(109565)和Il21,促进生发中心B细胞成熟为分泌抗体的浆细胞。EMSA还鉴定出Ox40(TNFRSF4;600315)作为Rc3h1和Rc3h2的转录后靶标。Vogel et al.(2013)得出结论,RC3H1和RC3H2通过ICOS和OX40过度限制T细胞激活和共刺激,以防止不适当的Tfh细胞分化。
Pratama 等人(2013)孤立地表明,消除小鼠中 roquin-1 或 roquin-2 的 RING 结构域或 ROQ 结构域的突变(即 sanroque 突变)会破坏 roquin-1 对 Icos mRNA 的调节。ROQ 突变体占据 mRNA 调节和脱盖应激颗粒,但 RING 缺陷的 roquin-1 未能定位到应激颗粒,并允许 roquin-2 补偿对 Icos 和 Tfh 细胞的抑制。在自身抗体诱导的关节炎模型中,旁系同源的 roquin 基因靶向非淋巴细胞中的 Tnf(191160)并改善了疾病。Pratama et al.(2013)得出结论,roquin 蛋白是抗体反应适应性和先天阶段的转录后制动器。
▼ 等位基因变异体(1个精选示例):
.0001 免疫失调和全身性过度炎症综合征(1名患者)
RC3H1、ARG688TER
一名 18 岁男性,父母是比利时血统,有西班牙血统,患有免疫失调和全身性过度炎症综合征(IMDYSHI;618998),Tavernier et al.(2019)在RC3H1基因的外显子12中鉴定出纯合的c.2062C-T转换(g.173931003G-A, ENST00000258349.4),导致arg688到ter(R688X)的取代。该突变是通过全外显子组测序发现的,与家族中的疾病分离,并且不存在于包括 gnomAD 在内的公共数据库中。在患者细胞中检测不到全长 RC3H1,但检测到截短的 75 kD 蛋白。转染该突变的 HEK293T 细胞的体外研究表明,RC3H1 对参与 mRNA 调节的 P 体(加工体)的定位受损,以及与 CCR4(604836)/CNOT1(604917)复合物的关联性降低;这些发现与增强的ICOS(604558)mRNA相对应。该患者在最初的十年内,在没有传染源或自身免疫触发因素的情况下出现了过度炎症。特征包括淋巴结肿大、肝脾肿大、反复发烧,以及免疫失调、免疫细胞群异常和炎症细胞因子血清水平升高的实验室证据。免疫表型让人想起复发性噬血细胞性淋巴组织细胞增多症(HLH)(参见 FHL1, 267700)。许多异常与在桑罗克小鼠中观察到的异常相似,桑罗克小鼠表现出全身过度炎症。在该患者中观察到的其他特征包括身材矮小、蹼颈和智力发育轻度受损。