转录终止因子，RNA 聚合酶 I; TTF1

HGNC 批准的基因符号：TTF1

细胞遗传学定位：9q34.13 基因组坐标（GRCh38）：9:132,375,548-132,406,840（来自 NCBI）

▼ 说明

TTF1基因编码调节核糖体基因转录的转录终止因子（Green et al., 2010总结）。

▼ 克隆与表达

RNA 聚合酶 I 的转录终止很大程度上是转录终止因子与称为转录终止子的 DNA 元件结合的结果。终止子元件位于前核糖体RNA（rRNA）编码区（RNR1）的下游；180450），并且在许多物种中还发现串联重复 rRNA 基因的基因启动子的上游（Henderson 和 Sollner-Webb，1986）。由于终止子 DNA 序列和不同终止因子相应的结合亲和力的差异，终止过程具有物种特异性。

Evers等人（1995）分离出了小鼠终止因子的cDNA（他们用TTF1表示RNA聚合酶I的转录终止因子）。对小鼠蛋白进行部分纯化，得到有限的肽序列。设计了简并寡聚物并用于 RT-PCR。获得产物并用于探测小鼠腹水细胞cDNA文库。由此产生的 cDNA 编码了一个预测的 833 个氨基酸的蛋白质。重组小鼠 TTF1 特异性结合小鼠终止子元件并在体外系统中停止转录。该蛋白的研究发现了一个大的C端DNA结合域，与c-Myb癌基因（MYB;）具有序列相似性。189990），以及转录终止所需的内部结构域。

Evers 和 Grummt（1995）随后通过用小鼠基因序列在低严格度下筛选 HeLa cDNA 文库来分离人类 cDNA。人 TTF1 cDNA 预测有 886 个氨基酸的蛋白质，与 C 端 400 个氨基酸中的小鼠蛋白质有 80% 的一致性。嵌合构建体表明，用同源人类序列替换小鼠蛋白的 31 个氨基酸可以放松 DNA 结合特异性，并允许嵌合蛋白与人类终止子序列结合并停止人类 rDNA 的转录。

▼ 进化

Green et al.（2010）发表了尼安德特人基因组序列草案。将尼安德特人基因组与来自世界不同地区的 5 个现代人类的基因组进行比较，发现了许多可能受到现代人类祖先正选择影响的基因组区域，包括参与新陈代谢以及认知和骨骼发育的基因。Green等人（2010）发现78个核苷酸取代改变了基因的蛋白质编码能力，其中现代人类被固定为派生状态，而尼安德特人则携带祖先（类似黑猩猩）的状态。因此，在人类进化的最后几十万年中，相对较少的氨基酸变化已经固定，这一观察结果与补充研究一致（Burbano et al., 2010）。只有 5 个基因具有超过 1 个固定取代，改变了编码蛋白的一级结构。其中之一是 TTF1，一种调节核糖体基因转录的转录终止因子。Green等人（2010）还表明，尼安德特人与欧亚大陆的现代人类比与撒哈拉以南非洲的现代人类共享更多的遗传变异，这表明从尼安德特人到非非洲人祖先的基因流动发生在欧亚族群之间的分歧。