核糖体蛋白S15;RPS15

大鼠胰岛素瘤基因同源物;RIG

HGNC 批准的基因符号:RPS15

细胞遗传学定位:19p13.3 基因组坐标(GRCh38):19:1,438,396-1,440,495(来自 NCBI)

▼ 说明

前核糖体 RNA 的早期加工发生在细胞核中,最终加工和核糖体组装发生在细胞质中。RPS15参与前40S核糖核颗粒的核输出(Rouquette et al., 2005)。

▼ 克隆与表达

Rig(大鼠胰岛素瘤基因)基因首次从大鼠胰岛素瘤cDNA文库中分离出来。已发现其同源基因在多种人类肿瘤中被激活,例如胰岛素瘤、食道癌和结肠癌。Inoue等人(1987)分离出编码Rig的人类同源物的人胰岛素瘤cDNA。结构分析表明,预测的 145 个氨基酸的 RIG 蛋白可能是 DNA 结合蛋白。

由于人类 RIG 基因中 5 素区和 GC 含量高的区域中存在 CpG 岛,并且由于 RIG 在组织和细胞中广泛表达,Shiga 等(1990)提出 RIG 可能属于这一类“管家”基因,其产物是所有细胞类型生长所必需的。

Kitakawa等人(1991)表明,针对推导的Rig蛋白的单克隆抗体的免疫反应性以及Rig mRNA的转录产物与核糖体蛋白S15共迁移。从大鼠肝脏中纯化的核糖体蛋白S15的氨基酸序列与Rig mRNA的核苷酸序列推导的氨基酸序列一致,但有迹象表明起始子甲硫氨酸被去除并且随后的丙氨酰残基被单乙酰化。作者得出结论,Rig 基因的产物是核糖体蛋白 S15。

▼ 基因结构

Shiga等(1990)从人食管癌构建的基因组DNA文库中分离出人RIG的基因组序列,并测定了其完整的核苷酸序列。该基因由约3000个核苷酸组成,分为4个外显子。转录起始位点位于第一个 ATG 密码子上游 -46 bp。人类基因组至少含有6个拷贝的RIG假基因,其中4个具有加工假基因的特征。

▼ 基因功能

Rouquette等人(2005)使用小干扰RNA发现,RPS15对于前40S核糖核颗粒的加工不是必需的,但在HeLa细胞和小鼠L929成纤维细胞中是其核输出所必需的。细胞质提取物的蔗糖梯度分级显示,RPS15的敲低导致小核糖体子单元的成熟缺陷和40S子单元的完全消失。40S 之前的粒子似乎被困在核质中。

转移RNA衍生的小RNA(tsRNAs;也称为 tRNA 衍生片段)是一类丰富的小非编码 RNA。Kim 等人(2017)表明,抑制特定的 tsRNA(LeuCAG3-prime-tsRNA)可诱导体外快速分裂细胞和小鼠原位肝细胞癌模型中的细胞凋亡。该tsRNA结合至少2个核糖体蛋白mRNA(RPS28、603685和RPS15)以增强它们的转录。RPS28 mRNA 转录的减少会阻断前 18S 核糖体 RNA 加工,导致 40S 核糖体子单元数量减少。Kim等人(2017)得出的结论是,他们的数据建立了一种转录后机制,可以在不同的生理状态下微调基因表达,并为治疗癌症提供了潜在的靶点。

▼ 测绘

Kenmochi等人(1998)通过体细胞杂交和辐射杂交作图分析,将人类RPS15基因定位到染色体19p。

Hartz(2017)根据RPS15序列(GenBank J02984)与基因组序列(GRCh38)的比对,将RPS15基因定位到染色体19p13.3。

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