La 核糖核蛋白 4; LARP4

La 核糖核蛋白结构域家族，成员 4

La相关蛋白4

HGNC 批准的基因符号：LARP4

细胞遗传学定位：12q13.12 基因组坐标（GRCh38）：12:50,400,885-50,480,004（来自 NCBI）

▼ 说明

LARP4包含一个La基序（LAM）和一个RNA识别基序（RRM）样结构域。它作为 RNA 伴侣并参与促进 mRNA 稳定性（Yang et al., 2011；侯赛因等，2013）。

▼ 克隆与表达

Hussain et al.（2013）指出，724个氨基酸的人LARP4蛋白含有一个N端变体PABP（PABPC1；604679）-结合基序，随后是 LAM 和相邻的 RRM 样基序以及长 C 端结构域。

▼ 测绘

Gross（2019）根据LARP4序列（GenBank BC022377）与基因组序列（GRCh38）的比对，将LARP4基因定位到染色体12q13.12。

▼ 基因功能

Yang等（2011）发现人LARP4与PABP相互作用并优先结合长度超过10个核苷酸的poly（A）。人LARP4通过其RRM与40S核糖体子单元和多核糖体相关联，并与40S核糖体和mRNA相关蛋白RACK1（176981）相互作用。LARP4 中含有色氨酸的变体 PAM2 基序通过疏水相互作用与 PABPC1 的 MLLE 结构域结合。LARP4 RRM 下游区域有助于其与 PABP 和多核糖体的有效关联。LARP4 敲除降低了聚合起始和细胞蛋白质合成。进一步分析表明LARP4延长了mRNA的半衰期。

Hussain等人（2013）通过酵母的功能表征证明，全长人类LARP4、LARP6（611300）和LARP7（612026）不是tRNA介导的抑制因子，尽管它们的La模块（即LAM和相邻的RRM） ）单独具有孤立于稳定的前tRNA 3-引物末端保护的抑制活性。相反，LARP4、LARP6 和 LARP7 是 RNA 伴侣，其活性孤立于 UUU-3-prime-OH 结合，并且集中在 RRM 周围以及紧邻 RRM 下游的序列。La 模块的 tRNA 介导的抑制活性与伴侣活性相关，因为 LAM 充当辅助结构，帮助将 RNA 募集到相邻的 RRM。

Mattijssen et al.（2017）发现人类LARP4 mRNA含有一个限制其表达的编码区决定簇（CRD）。CRD 位于编码 PABP 结合基序的区域内，在其天然调节 3-prime UTR 后面时是一种活性抑制元件，并介导 LARP4 mRNA 的整体稳定性和转录。LARP4 CRD 的密码子表现出复杂的簇，并且偏向于抑制表达的弱摆动密码子。LARP4 CRD 的密码子也偏向于低水平的 tRNA，其中 tRNA-thr（UGU）（参见 189913）以低水平存在，且功能最受限制。结果，同义CRD密码子替换或tRNA-thr（UGU）的过表达通过提高LARP4的转录效率来增加LARP4的表达，从而增加LARP4依赖的3-prime poly（A）尾（PAT）的延长和其他mRNA的稳定性。同样，LARP4 的过度表达增加了 PAT 的延长和其他 mRNA 的稳定性，而 LARP4 的缺失则具有相反的效果。LARP4 的 N 端 LAM 和 RRM 识别聚（A）3 素末端。