核磷蛋白/核质蛋白家族,成员 3; NPM3
HGNC 批准基因符号:NPM3
细胞遗传学定位:10q24.32 基因组坐标(GRCh38):10:101,781,325-101,783,446(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
MacArthur 和 Shackleford(1997)克隆并鉴定了 Npm3,这是一种鼠类基因,编码与核伴侣磷蛋白核蓝蛋白(非洲爪蟾蛋白)和核磷蛋白(NPM1)相关的蛋白质;164040)。
Shackleford et al.(2001)分离并测序了编码NPM3的人类基因组和cDNA克隆。预测的NPM3蛋白含有178个氨基酸,与小鼠蛋白有87%的一致性。除了氨基酸相似性之外,NPM3 与核磷蛋白/核蓝蛋白家族成员具有许多物理特征,包括酸性结构域、多个潜在磷酸化位点和推定的核定位信号。对来自不同后生动物的该家族 14 个成员的比较分析表明,非洲爪蟾 NO29 是人类和小鼠 NPM3 的候选直系同源物,并且他们进一步将这两种蛋白质与核纤蛋白比与核磷蛋白更接近。Northern 印迹分析显示,NPM3 在所有 16 个人体组织中均强烈表达,其中在胰腺和睾丸中表达尤其强烈;肺显示最低表达水平。对表达表位标记的 NPM3 的 NIH 3T3 细胞的亚细胞部分的分析表明,NPM3 蛋白仅位于细胞核中。
▼ 生化特征
Dutta et al.(2001)以2.3埃分辨率展示了非洲爪蟾核浆蛋白N末端结构域(Np-core)的结构。Np 核心单体是一个 8 链 β 桶,可紧密贴合在稳定的五聚体中。在晶体中,2 个五聚体结合形成十聚体。作者表明,Np 和 Np-core 都能够组装包含 4 个核心组蛋白的大型复合物。这些复合物各自包含 5 个组蛋白八聚体,与中央 Np 十聚体对接。Dutta et al.(2001)提供了组蛋白储存、精子染色质解凝和核小体组装的模型。
▼ 基因结构
MacArthur and Shackleford(1997)确定小鼠Npm3基因包含6个外显子,跨度为2 kb。Shackleford等(2001)通过基因组序列分析发现,人类NPM3基因具有与小鼠Npm3相同的外显子结构。
▼ 测绘
Shackleford等(2001)通过基因组序列分析,将NPM3基因定位于FGF8基因(600483)上游5.5 kb的10q24-q26。MacArthur and Shackleford(1997)将小鼠 Npm3 基因定位到染色体 19。