肌醇 1,4,5-三磷酸 3-激酶 C; ITPKC

HGNC 批准基因符号:ITPKC

细胞遗传学定位:19q13.2 基因组坐标(GRCh38):19:40,717,112-40,740,860(来自 NCBI)

▼ 说明

肌醇1,4,5-三磷酸3-激酶(ITPK)催化Ins(1,4,5)P3磷酸化为Ins(1,3,4,5)P4,两者都是钙稳态的调节剂。ITPK亚型包括ITPKA(147521)、ITPKB(147522)和ITPKC,它们的C端均含有保守的催化单元,但具有独特的N端序列和组织分布。

▼ 克隆与表达

Dewaste等人(2000)通过筛选甲状腺cDNA文库中新的ITPK同工酶,然后进行EST数据库检索,孤立出编码ITPKC的cDNA。序列分析预测该683个氨基酸的蛋白含有ITPKA和ITPKB中保守的lys262残基的Ins(1,4,5)P3结合位点、保守的ATP结合位点和6个潜在的蛋白激酶C(见600448)磷酸化位点。与ITPKA和ITPKB不同,ITPKC没有钙调蛋白激酶II(见602123)磷酸化位点。功能分析表明,钙-钙调蛋白复合物对 ITPKC 的激活相对较弱。Northern 印迹分析显示,3.9 kb ITPKC 转录物在胰腺、骨骼肌、肝脏、肺和胎盘中表达,在肾脏和大脑中表达较低。这种表达模式比 ITPKA 更广泛,ITPKA 仅限于大脑和睾丸,但与 ITPKB 相当。蛋白质印迹分析显示 105 kD 蛋白质的表达,远大于预测的 75 kD。

▼ 测绘

Onouchi et al.(2008)指出ITPKC基因定位于染色体19q13.2。

▼ 分子遗传学

有关 ITPKC 基因变异与川崎病之间可能关联的讨论,请参阅 611775 和 606476.0001。

▼ 动物模型

Pouillon et al.(2003)发现Itpkc缺陷小鼠没有T淋巴细胞缺陷,Itpkb/Itpkc双敲除小鼠除了Itpkb缺陷小鼠之外没有其他改变。Itpkc 缺陷小鼠的肠道 ITPK 活性确实降低。

▼ 等位基因变异体(1个精选示例):

.0001 重新分类 - 意义未知的变体

ITPKC、IVS1、GC({dbSNP 28493229})

这种变异以前被称为川崎病,易感性,已被重新分类,因为其对该疾病的贡献尚未得到证实。

Onouchi等人(2008)发现川崎病(611775)的易感性与ITPKC基因中的功能性SNP(作者将其命名为itpkc_3(rs28493229))之间存在显着关联。它还与日本和美国儿童冠状动脉病变的增加有关。在 78 对受影响的日本同胞中,40 对在 itpkc_3 附近共享一个以上等位基因;在这个子集中,与对照组相比,itpkc_3 等位基因的比例过高(OR = 2.46,95% CI 1.63-3.73)。rs28493229 的 C 等位基因与风险增加相关。

Chi等人(2010)在一项涉及385名无关的台湾川崎病儿童、140名冠状动脉病变儿童和1,158名种族匹配的健康对照的关联研究中,没有发现ITPKC基因SNP rs28493229与川崎病或台湾儿童冠状动脉病变。

Hamosh(2020)发现该GC变异存在于gnomAD数据库中198,428个等位基因中的23,577个以及1,596个纯合子中,总频率为0.1188(2020年5月6日)。

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