SPT6 同源物、组蛋白伴侣和转录延伸因子;SUPT6H

TY 6 的抑制子,酿酒酵母,同系物
染色质结构调节剂,酵母,同源物;SPT6

HGNC 批准的基因符号:SUPT6H

细胞遗传学定位:17q11.2 基因组坐标(GRCh38):17:28,662,205-28,702,679(来自 NCBI)

▼ 克隆与表达

Jiang等人(1996)分离并测序了SUPT6H和Supt6h,它们分别是酿酒酵母和秀丽隐杆线虫基因SPT6和emb-5的人类和小鼠同源物。人类和鼠类 SPT6 同源物实际上是相同的,因为它们在蛋白质水平上具有超过 98% 的同一性和超过 99% 的相似性。这两个基因的衍生氨基酸序列分别预测了人类中的1,603个氨基酸的多肽和小鼠中的1,726个氨基酸的多肽。这些蛋白质具有高酸性 5 引物区域、简并 SH2 结构域和亮氨酸拉链,其特征与调节转录的核蛋白一致。Northern 印迹分析揭示了一个 7.0-kb 的转录本,该转录本在小鼠和人类中均持续表达。Chiang等人(1996)评论说SUPT6H在功能上似乎与SPT6和emb-5类似,因此可能通过建立或维持染色质结构来调节转录。

▼ 基因功能

Andrulis 等人(2002)证明果蝇 Spt6 与外泌体共纯化,外泌体是一种 3-prime-to-5-prime 外核糖核酸酶复合物,参与结构 RNA 的加工和未正确加工的前 mRNA 的降解。果蝇核提取物的免疫沉淀分析表明,外泌体还与延伸因子 Spt5(602102)和 RNA 聚合酶 II(180660)相关。在体内,外泌体子单元在正常发育过程中与Spt6共定位于多线染色体上的转录活性位点,并在基因诱导时被强烈招募到热休克位点。在更高分辨率下,染色质免疫沉淀分析表明外泌体被招募到热休克基因的转录活性单位。Andrulis 等人(2002)得出结论,他们的数据为外泌体介导的前 mRNA 监视伴随转录延伸的假设提供了物理基础。

Kaplan 等人(2003)鉴定了一种酿酒酵母 Spt6 突变体,该突变体允许从编码区内进行异常转录起始。Spt6突变体中的转录染色质对微球菌核酸酶过敏,并且这种过敏性通过RNA聚合酶II的突变失活而受到抑制。Kaplan et al.(2003)得出的结论是,他们的结果表明Spt6在转录延伸过程中维持正常染色质结构中发挥着关键作用,从而抑制隐秘启动子的转录起始。

Nakamura等人(2012)通过HeLa细胞的敲低分析表明,PAAF1(619772)在人类免疫缺陷病毒(HIV)-1(见609423)转录过程中保护SPT6免受蛋白酶体降解并调节SPT6蛋白的细胞内水平。通过保护 SPT6,PAAF1 将其稳定到足以与 HIV-1 染色质关联的水平。PAAF1 与 SPT6 的 N 末端区域发生物理相互作用,并与 SPT6 共定位于 HIV-1 转录和延长 RNA 聚合酶 II 的位点。PAAF1 介导的 SPT6 稳定对于 HIV-1 启动子处的核小体重新组装以及抑制蛋白质合成效率低下的异常 HIV-1 转录也是必需的。HeLa 细胞中的转录谱和染色质免疫沉淀分析表明,PAAF1 和/或 SPT6 也以与 HIV-1 转录类似的方式调节细胞基因。

▼ 测绘

通过基于PCR的体细胞杂交分析和荧光原位杂交,Chiang等人(1996)将人类同源物定位到17q11.2。

Segre等人(1995)在小鼠YAC上检测到Supt6h基因的cDNA片段,该片段也包含“裸露”基因座。他们的数据将Supt6h定位到与位于小鼠染色体11上的whn(600838)约100 kb。因此,Supt6h基因被定位到小鼠染色体11B1,其与近端人类17q表现出广泛的同线性。

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