趋化因子、CXC 基序、配体 11;CXCL11

小诱导细胞因子亚族 B,成员 11;SCYB11
干扰素-γ-诱导蛋白9;IP9
干扰素诱导 T 细胞 α 趋化剂; ITAC
小诱导细胞因子亚族 B,成员 9B; SCYB9B

HGNC 批准的基因符号:CXCL11

细胞遗传学定位:4q21.1 基因组坐标(GRCh38):4:76,033,682-76,036,070(来自 NCBI)

▼ 说明

趋化因子是正常白细胞运输以及炎症期间白细胞募集的重要介质。根据CXC基序附近是否存在该三肽序列,CXC亚家族分为ELR(glu-leu-arg)和非ELR CXC趋化因子。CXCL11是一种非ELR趋化因子,在细胞因子刺激的星形胶质细胞中高表达(Cole et al., 1998)。

▼ 克隆与表达

通过筛选星形细胞瘤细胞系中γ-干扰素(IFNG;IFNG;147570),Rani等人(1996)鉴定了编码SCYB11的部分cDNA,他们将其称为β-R1。Northern 印迹分析检测到 4.5 kb 的单个 SCYB11 转录本。

Jacobs等人(1997)使用一种新型的基于酵母的系统筛选激活的外周血单核细胞文库中编码分泌蛋白的cDNA,鉴定出编码SCYB11的cDNA,他们将其命名为H174。SCYB11 基因编码 94 个氨基酸的蛋白质。

Cole等人(1998)通过在用IFNG和其他促炎细胞因子刺激的原代星形胶质细胞构建的cDNA文库中寻找新序列,获得了编码SCYB11的全长cDNA,他们将其称为ITAC(干扰素诱导的T细胞α-)化学引诱剂)。SCYB11 基因编码预测的 94 个氨基酸的非 ELR CXC 细胞因子,其中包含 21 个氨基酸的信号肽。Northern 印迹分析检测到 1.4 kb SCYB11 转录物在外周血白细胞、胰腺和肝脏中含量最高,其次是胸腺、脾脏和肺。在胎盘、前列腺和小肠中检测到较低水平。在胰腺、外周血白细胞和脾脏中也检测到了 4.5 kb SCYB11 转录物。

▼ 基因功能

Rani et al.(1996)发现SCYB11基因受到IFNG和β-干扰素(IFNB)的强烈诱导;147640),但仅受α-干扰素(IFNA; 147640)微弱诱导。147660)。SCYB11的诱导需要STAT1(600555)的表达。

Cole et al.(1998)发现SCYB11在活化的T细胞中诱导趋化反应,但在新鲜的T细胞、单核细胞或粒细胞中不诱导反应。Cole等人(1998)通过交叉脱敏和结合分析表明,SCYB11与SCYB9(MIG;601704)和SCYB10(147310),使用T细胞限制性CXC受体-3(CXCR3,或GPR9);300574)。他们发现 SCYB11 对 CXCR3 的亲和力比 SCYB9 和 SCYB10 更高。IFNG 上调星形胶质细胞、单核细胞和小胶质细胞中的 SCYB11 表达。白介素-1(见IL1A;147760)与IFNG协同诱导星形胶质细胞SCYB11表达。作者发现,SCYB11 在诱导细胞内钙水平增加方面比 SCYB9 和 SCYB10 更有效。

Luo et al.(1998)发现单核细胞对重组SCYB11产生趋化反应。RT-PCR 分析检测到 1 名 AIDS 痴呆患者和 1 名多发性硬化症患者的脑组织中存在 SCYB11 表达,但 2 名对照者中未检测到 SCYB11 表达。

在一项鉴定角质形成细胞产生的生物活性趋化因子的研究中,Tensen等人(1999)鉴定了SCYB11,他们将其称为IP9(IFNG-inducible Protein-9)。Northern 印迹分析检测到 IFNG 刺激的角质形成细胞中 SCYB11 的表达。RNA原位杂交分析检测过敏斑贴试验反应、扁平苔藓病变和蕈样肉芽肿中基底层角质形成细胞中SCYB11的表达。SCYB11 表达尤其在显示活化 T 细胞表皮浸润的区域中检测到,但在正常皮肤或过敏患者的未受攻击的皮肤中未检测到。

由于I型干扰素对于调节小鼠破骨细胞生成至关重要,Coelho等人(2005)比较了IFNA2(147562)和IFNB对人单核细胞分化为破骨细胞的影响。尽管经历破骨细胞分化的原代单核细胞对这两种蛋白高度且同等敏感,但 IFNB 在抑制破骨细胞生成方面的效力比 IFNA2 强 100 倍。微阵列和RT-PCR分析表明,与IFNA2相比,CXCL11是该细胞系统中唯一被IFNB差异上调的基因。用CXCL11处理单核细胞可抑制破骨细胞分化,并且CXCL11通过不同于CXCR3的受体发挥作用,而不是通过CCR5(601373)的拮抗作用。Coelho et al.(2005)提出IFNB可能在预防骨溶解方面具有临床意义。

Burns et al.(2006)通过细胞、分子、生物学和药理学评估,确定CXCR7(610376)是SDF1(CXCL12;CXCL12)的替代受体。600835)和ITAC。流式细胞术和Northern印迹分析表明CXCR7在小鼠和人转化细胞、内皮细胞和胚胎组织中高表达。

▼ 基因结构

Tensen等人(1999)通过对编码SCYB11的基因组克隆进行序列分析发现,与SCYB10一样,SCYB11基因也含有4个外显子。外显子 1 编码 21 个氨基酸的信号肽,其余外显子分别编码 43、24 和 7 个氨基酸序列。

▼ 测绘

通过对体细胞杂交体的PCR分析,Cole等(1998)将SCYB11基因定位到染色体4。Erdel等(1998)利用FISH将SCYB11基因定位到4q21.2。通过PCR分析和YAC克隆图谱,O'Donovan等人(1999)将一些CXC趋化因子的基因定位于4q12-q21。他们提出该区域的着丝粒顺序为--IL8(146930)--GRO1(155730)/PPBP(121010)/PF4(173460)--SCYB5(600324)/SCYB6(138965)--GRO2(139110)/ GRO3(139111)--SCYB11--SCYB10--MIG--端粒。

Tags: none