CDY 样蛋白 2; CDYL2
HGNC 批准基因符号:CDYL2
细胞遗传学定位:16q23.2 基因组坐标(GRCh38):16:80,597,907-80,805,037(来自 NCBI)
▼ 说明
CDY 家族蛋白(例如 CDYL2)均包含高度保守且参与组蛋白修饰和识别的染色质结构域和催化结构域。然而,由于其染色质结构域中的微妙氨基酸变化,CDY蛋白在染色质识别和结合方面表现出显着差异,从而使其发挥的表观遗传调节作用多样化(Fischle et al., 2008)。
▼ 克隆与表达
通过数据库分析和脑、睾丸和前列腺cDNA池的RACE,Dorus等人(2003)克隆了人CDYL2。CDYL2 编码包含 N 端染色结构域和 C 端催化结构域的 506 个氨基酸的蛋白质。人类和小鼠 CDYL2 在蛋白质序列上具有显着的同源性,特别是在染色结构域和催化结构域内。Northern blot 和 RT-PCR 分析显示 CDYL2 在人体组织中普遍表达。
Fischle et al.(2008)表明FLAG标记的人CDY(CDY1; 400016)和CDYL(603778)和老鼠Cdyl2仅定位于老鼠成纤维细胞的细胞核。Cdyl2 在整个细胞核中呈点状分布,并与三甲基化组蛋白 H3(参见 602810)lys9(H3K9me3)区域共定位。CDY 被排除在核仁之外,但在染色质中与 H3K9me3 区域重叠。CDYL 也被排除在核仁之外,但它与 H3K9me3 的区域不重叠。
▼ 基因结构
Dorus等(2003)确定CDYL2基因含有7个外显子。
▼ 测绘
Dorus等(2003)通过辐射杂交分析将CDYL2基因定位到染色体16q。他们将小鼠基因定位到染色体8。
Gross(2020)根据CDYL2序列(GenBank BC069440)与基因组序列(GRCh38)的比对,将CDYL2基因定位到染色体16q23.2。
▼ 基因功能
Fischle et al.(2008)指出,人CDY的染色结构域与甲基化的H3K9相互作用。他们发现,尽管 CDY、CDYL 和 CDYL2 的染色结构域具有高度同源性和相似的三级结构,但它们在与 H3K9me3 的结合方面表现出变异性。CDY 和 CDYL2 染色结构域均与 H3 尾部的相似片段结合,但 CDY 染色结构域比 CDYL2 染色结构域结合更紧密。CDY 和 CDYL2 染色质域对 H3K9 甲基化水平也表现出不同的敏感性。CDYL2 染色结构域的亲和力随着甲基化水平的增加而增加,而 CDY 染色结构域与 H3K9me1 肽的结合与 CDYL2 染色结构域与 H3K9me3 肽的结合一样有效。与 H3K9 相邻的 ser10 的磷酸化减弱了 CDY 和 CDYL2 与 H3K9me3 肽的结合。CDYL 染色结构域不与 H3K9me3 肽结合,但可以通过染色结构域中的点突变建立有效的结合。除了 H3K9me3 之外,还鉴定了 CDY 和 CDYL2 染色结构域的其他赖氨酸甲基化结合位点,但与 CDYL2 染色结构域相比,CDY 染色结构域显示出更高的结合选择性。
▼ 进化
通过结构和系统发育分析,Dorus 等人(2003)确定 CDYL 和 CDYL2 基因源自共同祖细胞的基因组复制,该祖细胞通过 2 个古老结构域(染色结构域和催化结构域)的增生而出现。相比之下,在早期哺乳动物进化过程中,CDY 作为 CDYL 的衍生物出现在人类-小鼠分歧之前。