结肠癌相关转录本 2

CCAT2 是一种与染色体不稳定性相关的长链非编码 RNA(lncRNA)( Chen et al., 2020 )。

▼ 克隆与表达
------
使用 RACE,Ling 等人(2013)从人骨髓 cDNA 文库中克隆了一个 340 bp 的非剪接 CCAT2 转录本。他们从小鼠睾丸 cDNA 中克隆了一个类似的无内含子 630 bp 转录本。小鼠和人类转录本之间的重叠序列具有 93% 的同源性。CCAT2 缺乏 ORF,体外翻译试验证实它是非编码的。人结肠癌细胞系的 Northern 印迹分析检测到 400 bp CCAT2 转录物。

通过对人乳腺组织的原位杂交分析,Redis 等人(2013)表明 CCAT2 在细胞核和细胞质中均表达,细胞核染色更强烈。

▼ 测绘
------
通过基因组序列分析,Ling 等人(2013)将 CCAT2 基因定位到染色体 8q24.21。

▼ 基因功能
------
使用定量 RT-PCR 分析,Ling 等人(2013)表明 CCAT2 在微卫星稳定的结直肠癌(CRC; 114500 ) 样本中过表达。CCAT2 通过诱导染色体不稳定性促进癌症生长和转移。CCAT2通过与 TCF7L2( 602228 602228 ) 的物理相互作用激活 Wnt 信号传导(见606359)来调节 MYC( 190080 ) 转录并上调 miR17-5p( 609416 ) 和 miR20A( 609420 ) 。) 转录活性。击倒和过表达分析将 CCAT2 鉴定为 Wnt 的下游目标,它通过反馈回路响应 Wnt 信号。作者还在 CCAT2 基因组区域rs6983267中发现了影响 CCAT2 表达和功能的 SNP 。

使用 RT-PCR 分析,Redis 等人(2013)表明 CCAT2 在一些乳腺癌( 114480 ) 组织样本中过度表达。CCAT2 表达与 ESR1( 133430 ) 和 PGR( 607311 ) 的表达呈负相关,与原发性乳腺肿瘤样本中 8q24 基因组区域的扩增呈正相关。然而,CCAT2 表达与 8q24 区域rs6983267和rs13281615 中的 2 个 SNP 的基因型无关。体外分析表明,CCAT2 以rs6983267孤立的方式上调乳腺癌细胞的细胞迁移和下调化学敏感性。

通过分析过表达 CCAT2 的人类 CRC 细胞系和来自表达人类 CCAT2 的转基因小鼠的结肠类器官,Chen 等人(2020)表明 CCAT2 诱导染色体不稳定并激活与核糖体蛋白相关的途径。CCAT2 与核糖体生物发生因子BOP1( 610596 )相互作用,主要通过直接结合在蛋白质水平上调其表达,但也通过 MYC 正向调节其转录。BOP1 在 CRC 细胞系中的过度表达反映了 CCAT2 的过度表达,通过增加极光激酶 B 的活性形式来促进染色体不稳定性(AURKB;604970) 并增加集落形成和侵袭性。相比之下,BOP1 的敲低会损害增殖,进一步证实了 BOP1 在结直肠癌中的致癌作用。为支持这些结果,RT-PCR 和蛋白质印迹分析显示 CCAT2 和 BOP1 在以染色体不稳定为特征的微卫星稳定肿瘤中增加。