RNA 结合基序蛋白 11； RBM11

HGNC 批准的基因符号：RBM11

细胞遗传学位置：21q11.2 基因组坐标（GRCh38）：21:14,216,157-14,228,372（来自 NCBI）

▼ 说明

RBM11 是一种组织特异性剪接因子，可能在神经元和生殖细胞分化过程中的选择性剪接中发挥作用（Pedrotti et al., 2012）。

▼ 克隆与表达

佩德罗蒂等人（2012） 分别通过 HEK293T 细胞 RNA 和小鼠睾丸 RNA 的 RT-PCR 克隆了人和小鼠 RBM11。推导的全长人和小鼠蛋白分别含有 281 和 237 个氨基酸，并且具有 67% 的氨基酸同一性。两种蛋白均含有假定的 N 端 RNA 识别基序（RRM） 和 C 端核定位信号。人 RBM11 的 RRM 与参与前 mRNA 剪接、切割和聚腺苷酸化以及 mRNA 转录的蛋白质的 RRM 具有最高的同源性。 RT-PCR和10种人细胞系的实时定量PCR显示，RBM11在HEK293T细胞和Panc-1胰腺腺癌细胞中高表达，在NT2D1睾丸胚胎癌细胞中弱表达。小鼠组织的RT-PCR显示Rbm11在脑、小脑和睾丸中高表达，而在肾脏中低表达。 Rbm11 在小鼠大脑和小脑中的表达在围产期达到峰值，而睾丸中的表达从产后 3 天（dpp） 到 16 dpp 迅速增加。 Rbm11 也在分化的神经元细胞系和纯化的生殖细胞中表达。当在 HeLa 细胞中过表达时，带有 GFP 标记的 RBM11 仅显示出核定位。 GFP 标记的 RBM11 与剪接因子 SRSF2（600813） 和 U2AF65（U2AF2; 191318） 共定位，表明 RBM11 定位于剪接斑点。转录抑制导致 RBM11 在核斑点中积累，细胞从抑制中释放导致 RBM11 从斑点重新分配到核质。应激诱导剂也会导致核斑点中 RBM11 的积累。

▼ 基因功能

Pedrotti 等人使用下拉分析（2012） 发现人类和小鼠 FLAG 标记的 RBM11 在体外结合合成的均聚物 RNA，并对 PolyU RNA 具有选择性。人 RBM11 的 RRM 的缺失消除了与 PolyU RNA 的结合，并且分离的 RRM 的结合效率降低。当共转染 HEK293T 细胞时，FLAG 标记和 GFP 标记的 RBM11 发生共免疫沉淀，表明 RBM11 可以同源二聚化。 HeLa 细胞中 FLAG 标记的 RBM11 的过度表达影响了 E1A 小基因的剪接，该基因包含多个 5-prime 和 3-prime 选择性剪接位点。 RBM11 过表达增强了 HEK293T 和 HeLa 细胞中 BCLX（BCL2L1; 600039） 小基因短变体的剪接。在 Pull-down 测定中，全长 RBM11 结合生物素化的 BCLX 外显子 2 RNA，但缺乏 RRM 的 RBM11 和分离的 RRM 都不能有效结合 BCLX RNA。在 HEK293T 细胞中对 FLAG 标记的 RBM11 进行紫外交联免疫沉淀分析时，内源 BCLX mRNA 得到富集。 BCLX 小基因的连续删除会影响 RBM11 介导的剪接。在使用 HEK293T 细胞核提取物的 Pull-down 实验中，RBM11 的过度表达抑制了 SRSF1（600812） 对 BCLX 长变体的剪接。佩德罗蒂等人（2012） 提出 RBM11 是一种组织特异性剪接调节因子，可能在神经元和生殖细胞分化过程中的选择性剪接中发挥作用。

▼ 测绘

Gross（2018） 根据 RBM11 序列（GenBank AY077695） 与基因组序列（GRCh38） 的比对，将 RBM11 基因对应到染色体 21q11.2。