异质核核糖核蛋白 C; HNRNPC
HNRPC
此条目中涉及的其他实体：
包含核核糖核蛋白颗粒 C1 蛋白
包含核糖核蛋白颗粒 C2 蛋白
HGNC 批准的基因符号：HNRNPC
细胞遗传学位置：14q11.2 基因组坐标（GRCh38）：14:21,209,147-21,269,442（来自 NCBI）
▼ 说明
RNA 聚合酶 II 的初级核转录物，其中一些是细胞质 mRNA（pre-mRNA） 的前体，统称为异源核 RNA（hnRNA）。这些蛋白质中至少有 20 种大量存在，称为 A1（34 kD） 至 U（120 kD）。在细胞核中，它们与一组特定的蛋白质结合形成核糖核蛋白（hnRNP） 颗粒。在脊椎动物中，C 蛋白 C1 和 C2 是这些颗粒的主要成分。这两种蛋白是抗原性密切相关的磷蛋白，在体外与 RNA 紧密结合（Nakakawa 等人，1986）。
▼ 克隆与表达
中川等人（1986） 克隆了 hnRNA C 蛋白的 cDNA。基因组印迹分析显示从人类到酵母的真核生物中存在同源 DNA 序列，表明 hnRNA C 蛋白是保守基因家族的成员。伯德等人（1989）报道了hnRNP蛋白A2、B1和C2的完整一级结构； A1、C1 和 L 先前已测序。他们认为 C1 和 C2 蛋白是通过单个基因转录本的选择性剪接产生的。梅里尔等人（1989） 发现 C1 和 C2 的不同之处在于 C2 中存在 13 个氨基酸插入片段，位于 C1 的甘氨酸 106 或丝氨酸 107 之后。额外的 13 个氨基酸解释了 C2 在 SDS 聚丙烯酰胺凝胶电泳上的分子量差异。否则C1和C2是相同的；此外，2 个 mRNA 的 3-prime 和 5-prime 非翻译部分是相同的（Swanson et al., 1987）。
▼ 测绘
国际辐射混合测绘联盟将 HNRNPC 基因定位到 14 号染色体（RH70234）。
▼ 基因功能
基因座控制区（LCR） 是距离其同源启动子数千个碱基的调节 DNA 序列。马哈詹等人（2005） 发现从人红白血病细胞系纯化的 LCR 相关重塑复合物（LARC） 以 hnRNP C1 和 C2、染色质重塑 SWI/SNF 复合物（见 600014）以及核小体重塑和脱乙酰化（NURD；参见 603526）/MECP1（156535） 复合物。
陈等人（2006） 纯化了 Chen 等人鉴定的核反应元件结合蛋白（REBiP）（2003） 在一名患有维生素 D 依赖性佝偻病 2B 型（VDDR2B; 600785） 的患者中，发现了一个与人 hnRNP C1 和 C2 蛋白具有 100% 序列同一性的胰蛋白酶片段。胰蛋白酶肽测序和蛋白质印迹分析证实，来自 VDDR2B 患者的细胞过表达一对 39-40 kD 的抗 hnRNPC C1/C2 反应蛋白，与 hnRNPC1 和稍大的 hnRNPC2 相容。当在维生素 D 反应细胞中过表达时，C1 和 C2 的 cDNA 均抑制 VDR（维生素 D 受体；601769）-VDRE（维生素 D 反应元件）定向的反式激活，分别达 23% 和 42%（两者的 p 均小于 0.005） ）。相比之下，hnRNP C1/C2 小干扰 RNA（siRNA） 的瞬时表达使 VDR 反式激活增加了 39%（p 小于 0.005）。染色质免疫沉淀研究揭示了维生素 D 反应性人类细胞中存在 REBiP，并表明 1,25-二羟基维生素 D 引发的 VDR 在 VDRE 上和离开 VDRE 的循环运动的正常模式是通过竞争性、相互占用来规定的。 VDRE 由 hnRNP C1/C2 提供。在过表达 hnRNP C1/C2 REBiP 的 VDDR2B 细胞中，VDR 和 hnRNP C1/C2 与 VDRE 相互作用的时间和交互模式丢失。陈等人（2006） 指出，他们的工作提供了进一步的证据，证明 hnRNP 能够通过充当激素反应元件的结合蛋白来影响基因转录本身，并表明 hnRNP C1/C2 可能是 VDRE 占用时间模式的关键决定因素。
在人体细胞中，刘等人（2015） 证明 m6A（参见 610640）控制 RNA 结合基序的 RNA 结构依赖性可及性，从而影响 RNA-蛋白质相互作用以进行生物调节；他们将这种机制称为“m6A 开关”。刘等人（2015） 发现 m6A 改变 mRNA 和长非编码 RNA 的局部结构，以促进 HNRNPC 的结合。 Liu 等人将光活化核糖核苷增强交联和免疫沉淀（PAR-CLIP） 与抗 m6A 免疫沉淀方法相结合（2015） 鉴定了 HNRNPC 结合位点之间的 39,060 个 m6A 开关。整体 m6A 减少减少了 2,798 个高置信度 m6A 开关处的 HNRNPC 结合。刘等人（2015） 确定这些 m6A 开关调节的 HNRNPC 结合活性会影响靶 mRNA 的丰度以及选择性剪接，证明 m6A 开关对基因表达和 RNA 成熟的调节作用。刘等人（2015） 得出的结论是，他们的结果说明了 RNA 结合蛋白如何通过 m6A 依赖性 RNA 结构重塑来获得对其 RNA 结合基序的调控。
