输出蛋白 5; XPO5
EXP5
KIAA1291
HGNC 批准的基因符号:XPO5
细胞遗传学定位:6p21.1 基因组坐标(GRCh38):6:43,522,334-43,576,038(来自 NCBI)
▼ 说明
Exportin-5 属于核运蛋白大家族(参见 602738),介导蛋白质和其他货物在核和细胞质区室之间的运输(Brownawell 和 Macara,2002)。
▼ 克隆与表达
Nagase 等人(1999)通过对从按大小分级的成人脑 cDNA 文库获得的克隆进行测序,克隆了 XPO5 cDNA,并将其命名为 KIAA1291。RT-PCR ELISA 检测到所有组织和所检查的特定脑区域中都有低至中等的表达。
Brownawell and Macara(2002)确定KIAA1291与通用核孔蛋白输出受体CRM1(XPO1;602559)。他们通过脑 cDNA 文库的 5-prime RACE 获得了全长 XPO5 cDNA。推导的 1,205 个氨基酸蛋白质的计算分子量约为 136 kD。XPO5 和 XPO1 具有 25% 的氨基酸同一性。Northern 印迹分析在所有检查的组织中检测到约 3.6 和 5.0 kb 的转录物。
Braun et al.(2016)在胎鼠肾脏中发现,Xpo5基因在肾小球发育过程中毛细血管袢阶段的足细胞中表达。在成年大鼠肾小球中,Xpo5 与突触蛋白(SYNPO; 608155),初级和次级足细胞足突的标记。
▼ 基因功能
Brownawell 和 Macara(2002)使用各种标准确定 XPO5 与其他核传递蛋白具有一些共同特征。XPO5以GTP结合构象结合RAN(601179),并且结合需要XPO5的N端结构域。XPO5以不依赖于RAN-GTP的方式结合核孔蛋白NUP214(114350)和NUP153(603948),并以依赖于RAN-GTP的方式结合货物蛋白ILF3(603182)。XPO5在其双链RNA结合域(dsRBD)处结合ILF3,并且还结合其他蛋白质的dsRBD。Brownawell 和 Macara(2002)使用异核融合测定证明 XPO5 在核和细胞质区室之间穿梭。他们得出结论,XPO5 调节 dsRBD 蛋白易位到细胞质,在那里它们与目标 mRNA 相互作用。
Gwizdek等人(2003)通过非洲爪蟾卵母细胞显微注射发现XPO5介导腺病毒VA1 RNA的核输出。XPO5 以 RAN-GTP 依赖性方式直接与 VA1 RNA 相互作用。使用各种 VA1、人工和细胞 RNA 进行的体内和体外竞争实验使作者得出结论,XPO5 优先识别和运输含有迷你螺旋基序(一种双链茎结构)的 RNA。
Lund et al.(2004)证明,exportin-5 介导短 microRNA(miRNA)前体(pre-miRNAs)的有效核输出,并且通过 RNA 干扰消除它会导致 miRNA 水平降低。XPO5 以 RAN-GTP 依赖性方式直接、特异地结合正确加工的 pre-miRNA,但与扩展的 pre-miRNA 仅有微弱的相互作用,这些 pre-miRNA 在体外被 Dicer(606241)加工时产生不正确的 miRNA。因此,Lund et al.(2004)得出结论,XPO5 是 miRNA 生物合成的关键,可能有助于协调核和细胞质加工步骤。
Li et al.(2014)发现MIR138(见613394)直接靶向RMND5A(618964)并在HeLa细胞中下调其表达。免疫沉淀实验表明RMND5A与exportin-5间接相互作用,且该相互作用需要RANBPM(RANBP9; 603854)。HeLa 细胞的共聚焦成像分析显示,RMND5A、exportin-5 和 RANBPM 分布在整个细胞核和细胞质中,但主要存在于细胞核周围的血浆中。与 RMND5A 的相互作用可保护 Exportin-5 免受泛素化和蛋白酶体降解。然而,MIR138 诱导的 RMND5A 下调降低了输出蛋白 5 的稳定性并降低了 Dicer 蛋白的水平,从而抑制了前体 miRNA 的核输出。
▼ 生化特征
晶体结构
Okada et al.(2009)提出了由pre-miRNA与Exp5复合形成的pre-miRNA核输出机制的2.9埃结构以及小核GTPase Ran的GTP结合形式(RANGAP1;602362)。X射线结构显示Exp5:RanGTP识别2-核苷酸3-引物悬垂结构和pre-miRNA的双链茎。Exp5:RanGTP 在棒球手套样结构中保护 pre-miRNA 免遭降解,在该结构中,它通过广泛分布的弱相互作用保持,而 Exp5 的隧道状结构通过氢键与 2 核苷酸 3 引物突出端强烈相互作用和离子相互作用。Exp5:RanGTP 的 RNA 识别不依赖于 RNA 序列,这意味着 Exp5:RanGTP 可以识别多种 pre-miRNA。
▼ 测绘
国际辐射混合图谱联盟将XPO5基因定位到染色体6(stSG6379)。
▼ 分子遗传学
关联待确认
有关 XPO5 基因变异与肾病综合征之间可能关联的讨论(例如,参见 NPHS1, 256300),请参见 607845.0001。
▼ 等位基因变异体(1个精选示例):
.0001 意义不明的变体
XPO5、VAL552ILE
该变异被归类为意义不明的变异,因为其对肾病综合征的贡献(参见例如NPHS1, 256300)尚未得到证实。
Braun等人(2016)在一名近亲出生的患有早发性肾病综合征的土耳其男孩中,在XPO5的外显子15中鉴定出纯合的c.1654G-A转换(c.1654G-A, NM_020750.2)基因,导致保守残基处 val552-to-ile(V552I) 取代。没有对该变体进行功能研究。该患者在 2 岁时出现肾脏疾病。肾活检显示微小病变肾病综合征,且足细胞未消失。该疾病对类固醇具有抗药性,但对环孢菌素 A 表现出一定的反应。患者的语言发育也出现延迟。