热休克 27-KD 蛋白相关蛋白 1; HSPBAP1
HSPB 相关蛋白 1
PASS1,RAT,同系物;PASS1
此条目中涉及的其他实体:
包含 HSPBAP1/DIRC3 融合基因
HGNC 批准的基因符号:HSPBAP1
细胞遗传学位置:3q21.1 基因组坐标(GRCh38):3:122,739,999-122,793,831(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
在对胎儿脑 cDNA 文库进行大规模序列分析期间,Jiang 等人(2001)克隆了HSPBAP1。推导的 488 个氨基酸蛋白质的计算分子量为 53.1 kD。 HSPBAP1 与大鼠同源物 PASS1 有 80% 的同一性。 RT-PCR 检测到除脑外的所有检查组织中 HSPABAP1 的表达。在胸腺、卵巢和胰腺中检测到最高表达。
▼ 基因结构
博德默等人(2003)确定HSPBAP1基因含有8个外显子。
▼ 测绘
通过基因组序列分析,Jiang 等人(2001) 将 HSPBAP1 基因定位到染色体 3q21.1。博德默等人(2003) 指出 HSPBAP1 基因位于 DIRC2 基因附近(602773)。
▼ 细胞遗传学
博德默等人(2003) 确定肾细胞癌(RCC; 144700) 家族中的 t(2;3)(q35;q21) 易位导致 DIRC3(608262)-HSPBAP1 融合转录本的形成。两个基因中的断点都是内含子,融合产生了一个转录本,其中 DIRC3 的前 2 个外显子取代了 HSPBAP1 的外显子 1。假定的 451 个氨基酸截短的 HSPBAP1 蛋白保留了其 JmjC 和 HSP27(602195) 相互作用结构域,它们分别与染色质重塑和应激反应相关。